Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

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Length 807 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.48■■■■■ 4.07
Perm1Q149B8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Perm1Q149B8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Perm1Q149B8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
Perm1Q149B8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
Perm1Q149B8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Perm1Q149B8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Perm1Q149B8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Perm1Q149B8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
Perm1Q149B8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Perm1Q149B8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Perm1Q149B8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Perm1Q149B8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Perm1Q149B8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Perm1Q149B8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Perm1Q149B8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Perm1Q149B8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Perm1Q149B8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Perm1Q149B8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Perm1Q149B8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Perm1Q149B8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Perm1Q149B8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Perm1Q149B8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Perm1Q149B8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Perm1Q149B8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Perm1Q149B8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Perm1Q149B8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Perm1Q149B8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Perm1Q149B8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Perm1Q149B8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Perm1Q149B8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
Perm1Q149B8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Perm1Q149B8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Perm1Q149B8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Perm1Q149B8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Perm1Q149B8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Perm1Q149B8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Perm1Q149B8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Perm1Q149B8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Perm1Q149B8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Perm1Q149B8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Perm1Q149B8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Perm1Q149B8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Perm1Q149B8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Perm1Q149B8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Perm1Q149B8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Perm1Q149B8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Perm1Q149B8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Perm1Q149B8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Perm1Q149B8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Perm1Q149B8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Perm1Q149B8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Perm1Q149B8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Perm1Q149B8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Perm1Q149B8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Perm1Q149B8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Perm1Q149B8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Perm1Q149B8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Perm1Q149B8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Perm1Q149B8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Perm1Q149B8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Perm1Q149B8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Perm1Q149B8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Perm1Q149B8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Perm1Q149B8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Perm1Q149B8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Perm1Q149B8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Perm1Q149B8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Perm1Q149B8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Perm1Q149B8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Perm1Q149B8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Perm1Q149B8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Perm1Q149B8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Perm1Q149B8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Perm1Q149B8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Perm1Q149B8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Perm1Q149B8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Perm1Q149B8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Perm1Q149B8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Perm1Q149B8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Perm1Q149B8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Perm1Q149B8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Perm1Q149B8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Perm1Q149B8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Perm1Q149B8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Perm1Q149B8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Perm1Q149B8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Perm1Q149B8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Perm1Q149B8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Perm1Q149B8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Perm1Q149B8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Perm1Q149B8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Perm1Q149B8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Perm1Q149B8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Perm1Q149B8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Perm1Q149B8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Perm1Q149B8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Perm1Q149B8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Perm1Q149B8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Perm1Q149B8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms