Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD1

Fthl17d, Ferritin, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fthl17dQ3SXD1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Fthl17dQ3SXD1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Fthl17dQ3SXD1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Fthl17dQ3SXD1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Fthl17dQ3SXD1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Fthl17dQ3SXD1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Fthl17dQ3SXD1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Fthl17dQ3SXD1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Fthl17dQ3SXD1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Fthl17dQ3SXD1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fthl17dQ3SXD1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Fthl17dQ3SXD1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fthl17dQ3SXD1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Fthl17dQ3SXD1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Fthl17dQ3SXD1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Fthl17dQ3SXD1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Fthl17dQ3SXD1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Fthl17dQ3SXD1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Fthl17dQ3SXD1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Fthl17dQ3SXD1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fthl17dQ3SXD1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fthl17dQ3SXD1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fthl17dQ3SXD1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fthl17dQ3SXD1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Fthl17dQ3SXD1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fthl17dQ3SXD1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Fthl17dQ3SXD1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fthl17dQ3SXD1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Fthl17dQ3SXD1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Fthl17dQ3SXD1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fthl17dQ3SXD1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Fthl17dQ3SXD1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fthl17dQ3SXD1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fthl17dQ3SXD1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Fthl17dQ3SXD1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fthl17dQ3SXD1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Fthl17dQ3SXD1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fthl17dQ3SXD1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Fthl17dQ3SXD1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Fthl17dQ3SXD1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fthl17dQ3SXD1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fthl17dQ3SXD1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Fthl17dQ3SXD1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Fthl17dQ3SXD1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fthl17dQ3SXD1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Fthl17dQ3SXD1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fthl17dQ3SXD1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fthl17dQ3SXD1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fthl17dQ3SXD1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fthl17dQ3SXD1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Fthl17dQ3SXD1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fthl17dQ3SXD1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fthl17dQ3SXD1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fthl17dQ3SXD1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fthl17dQ3SXD1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Fthl17dQ3SXD1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Fthl17dQ3SXD1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Fthl17dQ3SXD1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Fthl17dQ3SXD1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Fthl17dQ3SXD1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Fthl17dQ3SXD1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fthl17dQ3SXD1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fthl17dQ3SXD1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Fthl17dQ3SXD1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fthl17dQ3SXD1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fthl17dQ3SXD1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fthl17dQ3SXD1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fthl17dQ3SXD1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fthl17dQ3SXD1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fthl17dQ3SXD1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Fthl17dQ3SXD1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fthl17dQ3SXD1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fthl17dQ3SXD1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fthl17dQ3SXD1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Fthl17dQ3SXD1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fthl17dQ3SXD1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fthl17dQ3SXD1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fthl17dQ3SXD1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fthl17dQ3SXD1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fthl17dQ3SXD1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fthl17dQ3SXD1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fthl17dQ3SXD1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fthl17dQ3SXD1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Fthl17dQ3SXD1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fthl17dQ3SXD1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fthl17dQ3SXD1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fthl17dQ3SXD1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fthl17dQ3SXD1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fthl17dQ3SXD1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fthl17dQ3SXD1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fthl17dQ3SXD1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fthl17dQ3SXD1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fthl17dQ3SXD1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fthl17dQ3SXD1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Fthl17dQ3SXD1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fthl17dQ3SXD1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fthl17dQ3SXD1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fthl17dQ3SXD1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fthl17dQ3SXD1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fthl17dQ3SXD1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms