Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1U8

Elmod1, ELMO domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elmod1Q3V1U8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
Elmod1Q3V1U8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Elmod1Q3V1U8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Elmod1Q3V1U8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Elmod1Q3V1U8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Elmod1Q3V1U8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Elmod1Q3V1U8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Elmod1Q3V1U8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Elmod1Q3V1U8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Elmod1Q3V1U8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Elmod1Q3V1U8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Elmod1Q3V1U8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Elmod1Q3V1U8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Elmod1Q3V1U8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Elmod1Q3V1U8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Elmod1Q3V1U8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Elmod1Q3V1U8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Elmod1Q3V1U8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Elmod1Q3V1U8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Elmod1Q3V1U8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Elmod1Q3V1U8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Elmod1Q3V1U8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Elmod1Q3V1U8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Elmod1Q3V1U8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Elmod1Q3V1U8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Elmod1Q3V1U8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Elmod1Q3V1U8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Elmod1Q3V1U8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Elmod1Q3V1U8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Elmod1Q3V1U8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Elmod1Q3V1U8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Elmod1Q3V1U8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Elmod1Q3V1U8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Elmod1Q3V1U8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Elmod1Q3V1U8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Elmod1Q3V1U8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Elmod1Q3V1U8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Elmod1Q3V1U8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Elmod1Q3V1U8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Elmod1Q3V1U8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Elmod1Q3V1U8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Elmod1Q3V1U8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Elmod1Q3V1U8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Elmod1Q3V1U8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Elmod1Q3V1U8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Elmod1Q3V1U8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Elmod1Q3V1U8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Elmod1Q3V1U8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Elmod1Q3V1U8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Elmod1Q3V1U8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Elmod1Q3V1U8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Elmod1Q3V1U8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Elmod1Q3V1U8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Elmod1Q3V1U8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Elmod1Q3V1U8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Elmod1Q3V1U8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Elmod1Q3V1U8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Elmod1Q3V1U8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Elmod1Q3V1U8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Elmod1Q3V1U8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Elmod1Q3V1U8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Elmod1Q3V1U8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Elmod1Q3V1U8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Elmod1Q3V1U8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Elmod1Q3V1U8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Elmod1Q3V1U8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Elmod1Q3V1U8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Elmod1Q3V1U8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Elmod1Q3V1U8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Elmod1Q3V1U8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Elmod1Q3V1U8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Elmod1Q3V1U8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Elmod1Q3V1U8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Elmod1Q3V1U8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Elmod1Q3V1U8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Elmod1Q3V1U8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Elmod1Q3V1U8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Elmod1Q3V1U8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Elmod1Q3V1U8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Elmod1Q3V1U8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Elmod1Q3V1U8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Elmod1Q3V1U8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Elmod1Q3V1U8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Elmod1Q3V1U8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Elmod1Q3V1U8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Elmod1Q3V1U8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Elmod1Q3V1U8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Elmod1Q3V1U8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Elmod1Q3V1U8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Elmod1Q3V1U8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Elmod1Q3V1U8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Elmod1Q3V1U8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Elmod1Q3V1U8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Elmod1Q3V1U8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Elmod1Q3V1U8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Elmod1Q3V1U8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Elmod1Q3V1U8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Elmod1Q3V1U8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Elmod1Q3V1U8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Elmod1Q3V1U8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.4 ms