Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
RoraP51448 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
RoraP51448 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RoraP51448 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
RoraP51448 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
RoraP51448 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
RoraP51448 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
RoraP51448 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RoraP51448 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RoraP51448 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
RoraP51448 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RoraP51448 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RoraP51448 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
RoraP51448 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RoraP51448 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RoraP51448 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RoraP51448 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
RoraP51448 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RoraP51448 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RoraP51448 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
RoraP51448 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RoraP51448 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
RoraP51448 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
RoraP51448 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RoraP51448 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RoraP51448 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RoraP51448 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RoraP51448 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RoraP51448 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RoraP51448 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RoraP51448 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
RoraP51448 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RoraP51448 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RoraP51448 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RoraP51448 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RoraP51448 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RoraP51448 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RoraP51448 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RoraP51448 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RoraP51448 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RoraP51448 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RoraP51448 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RoraP51448 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RoraP51448 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RoraP51448 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RoraP51448 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RoraP51448 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RoraP51448 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RoraP51448 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RoraP51448 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RoraP51448 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RoraP51448 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RoraP51448 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RoraP51448 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RoraP51448 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RoraP51448 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RoraP51448 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RoraP51448 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RoraP51448 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RoraP51448 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RoraP51448 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RoraP51448 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RoraP51448 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RoraP51448 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RoraP51448 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RoraP51448 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RoraP51448 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RoraP51448 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RoraP51448 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RoraP51448 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RoraP51448 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RoraP51448 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RoraP51448 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RoraP51448 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RoraP51448 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RoraP51448 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RoraP51448 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RoraP51448 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RoraP51448 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RoraP51448 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RoraP51448 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RoraP51448 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RoraP51448 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RoraP51448 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RoraP51448 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RoraP51448 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RoraP51448 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RoraP51448 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RoraP51448 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RoraP51448 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RoraP51448 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RoraP51448 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RoraP51448 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RoraP51448 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RoraP51448 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RoraP51448 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RoraP51448 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RoraP51448 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RoraP51448 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RoraP51448 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms