Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI0

Nedd4l, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4lQ8CFI0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Nedd4lQ8CFI0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Nedd4lQ8CFI0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Nedd4lQ8CFI0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nedd4lQ8CFI0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Nedd4lQ8CFI0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nedd4lQ8CFI0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nedd4lQ8CFI0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nedd4lQ8CFI0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Nedd4lQ8CFI0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Nedd4lQ8CFI0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Nedd4lQ8CFI0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nedd4lQ8CFI0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nedd4lQ8CFI0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nedd4lQ8CFI0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nedd4lQ8CFI0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nedd4lQ8CFI0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nedd4lQ8CFI0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nedd4lQ8CFI0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Nedd4lQ8CFI0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nedd4lQ8CFI0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nedd4lQ8CFI0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nedd4lQ8CFI0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nedd4lQ8CFI0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nedd4lQ8CFI0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Nedd4lQ8CFI0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nedd4lQ8CFI0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nedd4lQ8CFI0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Nedd4lQ8CFI0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nedd4lQ8CFI0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Nedd4lQ8CFI0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nedd4lQ8CFI0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Nedd4lQ8CFI0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nedd4lQ8CFI0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Nedd4lQ8CFI0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nedd4lQ8CFI0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nedd4lQ8CFI0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nedd4lQ8CFI0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nedd4lQ8CFI0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nedd4lQ8CFI0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Nedd4lQ8CFI0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Nedd4lQ8CFI0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nedd4lQ8CFI0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nedd4lQ8CFI0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nedd4lQ8CFI0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nedd4lQ8CFI0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nedd4lQ8CFI0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nedd4lQ8CFI0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nedd4lQ8CFI0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nedd4lQ8CFI0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nedd4lQ8CFI0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nedd4lQ8CFI0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nedd4lQ8CFI0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nedd4lQ8CFI0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nedd4lQ8CFI0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nedd4lQ8CFI0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nedd4lQ8CFI0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nedd4lQ8CFI0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nedd4lQ8CFI0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nedd4lQ8CFI0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nedd4lQ8CFI0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Nedd4lQ8CFI0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Nedd4lQ8CFI0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nedd4lQ8CFI0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nedd4lQ8CFI0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nedd4lQ8CFI0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nedd4lQ8CFI0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nedd4lQ8CFI0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nedd4lQ8CFI0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nedd4lQ8CFI0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nedd4lQ8CFI0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nedd4lQ8CFI0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nedd4lQ8CFI0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Nedd4lQ8CFI0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nedd4lQ8CFI0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nedd4lQ8CFI0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nedd4lQ8CFI0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nedd4lQ8CFI0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nedd4lQ8CFI0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nedd4lQ8CFI0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nedd4lQ8CFI0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nedd4lQ8CFI0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nedd4lQ8CFI0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nedd4lQ8CFI0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nedd4lQ8CFI0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nedd4lQ8CFI0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nedd4lQ8CFI0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nedd4lQ8CFI0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nedd4lQ8CFI0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nedd4lQ8CFI0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nedd4lQ8CFI0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nedd4lQ8CFI0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nedd4lQ8CFI0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nedd4lQ8CFI0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nedd4lQ8CFI0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nedd4lQ8CFI0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nedd4lQ8CFI0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nedd4lQ8CFI0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nedd4lQ8CFI0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nedd4lQ8CFI0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms