RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 GGT1P19440 569 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 CRATP43155 626 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 MAGEA8P43361 318 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 KHKP50053 298 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 ZNF83P51522 516 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 CHRNEQ04844 493 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 DMTNQ08495 405 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 ADRM1Q16186 407 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 SYPL1Q16563 259 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 GPAT3Q53EU6 434 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 TIMM23BQ5SRD1 257 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 GCNT6Q5T4J0 391 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 ATAD3BQ5T9A4 648 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 C9orf135Q5VTT2 229 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 SERPINA11Q86U17 422 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 ADGRG3Q86Y34 549 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 TMEM234Q8WY98 164 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 HTRA1Q92743 480 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 MUCL1Q96DR8 90 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 SAP130Q9H0E3 1048 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 ALG2Q9H553 416 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 CHRNA9Q9UGM1 479 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 SLC7A8Q9UHI5 535 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 COL6A5A8TX70 2615 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 ATRQ13535 2644 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 CFAP73A6NFT4 308 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 E7EQL1 145 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 HMGN4O00479 90 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 SSX4O60224 188 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 ARAFP10398 606 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 IDH2P48735 452 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 OR2B6P58173 313 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 DSTNP60981 165 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 MS4A2Q01362 244 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 FXNQ16595 210 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 CYP51A1Q16850 503 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 FBXW9Q5XUX1 488 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 B3GLCTQ6Y288 498 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 DNM1P46Q6ZS02 220 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 DTX2Q86UW9 622 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 MICU2Q8IYU8 434 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 ANKFN1Q8N957 763 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 OR2T12Q8NG77 320 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 OR52E4Q8NGH9 312 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 APH1AQ96BI3 265 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 SPATA9Q9BWV2 254 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 EMC3Q9P0I2 261 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 FBN3Q75N90 2809 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 CIB4A0PJX0 185 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 TMEM72A0PK05 275 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 GPRIN2O60269 458 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 PMS2P2O95744 297 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 CHRM4P08173 479 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 ITGA5P08648 1049 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 PCGF2P35227 344 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 KCNJ10P78508 379 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 MAPK11Q15759 364 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 ETFDHQ16134 617 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 VMACQ2NL98 169 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 GRINAQ7Z429 371 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 MAL2Q969L2 176 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 HS6ST2Q96MM7 605 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 CACNG6Q9BXT2 260 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 PCDHAC1Q9H158 963 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 SLC38A1Q9H2H9 487 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 TMEM38AQ9H6F2 299 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 A4GALTQ9NPC4 353 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 SLC25A15Q9Y619 301 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 MXRA5Q9NR99 2828 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 ELOVL7A1L3X0 281 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 M0R1B8 84 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 ACOT8O14734 319 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 ARPC2O15144 300 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 AGR2O95994 175 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 IMPDH2P12268 514 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-212ENST00000485532 NCK1P16333 377 aa11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms