RNA–Protein interactions for RNA: YLR373C

VID22, Transcript of Glycosylated integral membrane protein localized to plasma membrane, yeast

Gene VID22, Length 2,706 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VID22	YLR373C	RRD2	Q12461	358 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VID22	YLR373C	ADH4	P10127	382 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VID22	YLR373C	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
VID22	YLR373C	SIN4	P32259	974 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VID22	YLR373C	RPC82	P32349	654 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VID22	YLR373C	PLC1	P32383	869 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VID22	YLR373C	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
VID22	YLR373C	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
VID22	YLR373C	EXO5	P38289	585 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VID22	YLR373C	YHL008C	P38750	627 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VID22	YLR373C	PXA1	P41909	870 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VID22	YLR373C	PGA2	P53903	129 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VID22	YLR373C	OSH6	Q02201	448 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VID22	YLR373C	YDR476C	Q03362	224 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VID22	YLR373C	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
VID22	YLR373C	TDA9	Q04545	1251 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VID22	YLR373C	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
VID22	YLR373C	PHM7	Q12252	991 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VID22	YLR373C	IES3	Q12345	250 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VID22	YLR373C	CEX1	Q12453	761 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VID22	YLR373C	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	MPH2	P0CD99	609 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	YAK1	P14680	807 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	TYR1	P20049	452 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	REB1	P21538	810 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	YBR032W	P38223	100 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	SLM4	P38247	162 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	RFC3	P38629	340 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	BEM4	P39011	633 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	RPA14	P50106	137 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	MDR1	P53258	950 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	RPM2	Q02773	1202 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	MSH6	Q03834	1242 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	SPO16	P17122	198 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	DGR2	P32330	852 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	CDC11	P32458	415 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	GYP6	P32806	458 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	SPC42	P36094	363 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	BCH2	P36122	765 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	MGS1	P40151	587 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	IAH1	P41734	238 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	TEP1	P53916	434 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	YMR187C	Q03236	431 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	SAS4	Q04003	481 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	NSE1	Q07913	336 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	SLX4	Q12098	748 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	HES1	P35843	434 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	PES4	P39684	611 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	ALG5	P40350	334 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	DIP5	P53388	608 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	YET2	Q04210	160 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	NDL1	Q06568	189 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	HAT1	Q12341	374 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	SAC3	P46674	1301 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	MRM1	P25270	412 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	AST1	P35183	429 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	YDR089W	P38966	869 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	ALY2	P47029	1046 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	SGM1	P47166	707 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	TEL2	P53038	688 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	YGR021W	P53212	290 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	NCR1	Q12200	1170 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	NTO1	Q12311	748 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	END3	P39013	349 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	YFR006W	P43590	535 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	GTB1	Q04924	702 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	YPT6	Q99260	215 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	PRT1	P06103	763 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	CHS3	P29465	1165 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	TOA1	P32773	286 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	SAS3	P34218	831 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	YFL040W	P43562	540 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	ALG2	P43636	503 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	YPQ2	Q06328	317 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
VID22	YLR373C	DSE3	Q08729	430 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	YPL260W	Q08977	551 aa		4.88	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 57.9 ms