RNA–Protein interactions for RNA: YLR369W

SSQ1, Transcript of Mitochondrial hsp70-type molecular chaperone, yeastyeast

Gene SSQ1, Length 1,974 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSQ1YLR369W YPT53P36019 220 aa2.79□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W UIP5P36137 443 aa2.79□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W AIM21P40563 679 aa2.79□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W NET1P47035 1189 aa2.79□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W IRC4Q03036 179 aa2.79□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W YPL277CQ08989 487 aa2.79□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W TRP2P00899 507 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W DOM34P33309 386 aa2.78□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W EEB1Q02891 456 aa2.78□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W NSE3Q05541 303 aa2.78□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W JIP5Q06214 492 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W THI3Q07471 609 aa2.78□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W ACK1Q07622 623 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W RIB2Q12362 591 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W RKM4Q12504 494 aa2.78□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W ADR1P07248 1323 aa2.78□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W TUS1Q06412 1307 aa2.78□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W PRE10P21242 288 aaKnown RBP RIP-Chip data2.78□□□□□ -1.97not detected
SSQ1YLR369W RFC5P38251 354 aa2.78□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W LAM1P38851 1228 aa2.78□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W FMP30Q02883 468 aa2.78□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W GCN5Q03330 439 aa2.78□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W SVF1Q05515 481 aa2.78□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W ACM1Q08981 209 aa2.78□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W ICL2Q12031 575 aa2.78□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W WRS1Q12109 432 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W SUT2Q12286 268 aa2.78□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W YOR131CQ12486 218 aa2.78□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W DUR1,2P32528 1835 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W CYC1P00044 109 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W RPL11AP0C0W9 174 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W BAS1P22035 811 aa2.77□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W RAD53P22216 821 aa2.77□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W CDC60P26637 1090 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W SLA2P33338 968 aa2.77□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W GEM1P39722 662 aa2.77□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W YFL054CP43549 646 aa2.77□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W BRE5P53741 515 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W PKH1Q03407 766 aa2.77□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W CLU1Q03690 1277 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W NAB6Q03735 1134 aaKnown RBP RIP-Chip data2.77□□□□□ -1.97not detected
SSQ1YLR369W RSM24Q03976 319 aa2.77□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W DUS4Q06063 367 aa2.77□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W CFT2Q12102 859 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W TY3A-GQ12173 290 aa2.77□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W MDM20Q12387 796 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W RPL11BQ3E757 174 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W TY3A-IQ99219 290 aa2.77□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W KIN2P13186 1147 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W ACE2P21192 770 aa2.76□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W TOD6P34219 525 aa2.76□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W MCM7P38132 845 aa2.76□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W MEF2P39677 819 aa2.76□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W SNF7P39929 240 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W TYW3P53177 273 aa2.76□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W YGR053CP53234 283 aa2.76□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W YNL050CP53952 270 aa2.76□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W GSF2Q04697 403 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W YOR352WQ08816 343 aa2.76□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W SVS1Q12254 260 aa2.76□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W SAC3P46674 1301 aa2.76□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W UBR2Q07963 1872 aa2.76□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W YLR358CO13565 187 aa2.76□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W SRM1P21827 482 aa2.76□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W OCT1P35999 772 aa2.76□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W MAD1P40957 749 aa2.76□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W RRP46P53256 223 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W YPL066WQ12194 479 aa2.76□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W YLL058WQ12198 575 aa2.76□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W SWI1P09547 1314 aa2.75□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W CDC6P09119 513 aa2.75□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W KRI1P42846 591 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W MSC2Q03455 724 aa2.75□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W SPO20Q04359 397 aa2.75□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W BI4P03879 638 aa2.74□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W GAL10P04397 699 aa2.74□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W INO1P11986 533 aa2.74□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W CLN2P20438 545 aa2.74□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W STE11P23561 717 aa2.74□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W DBP2P24783 546 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W CTS1P29029 562 aa2.74□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W BCS1P32839 456 aa2.74□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W YKL107WP34251 309 aa2.74□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W MCD4P36051 919 aa2.74□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W ACA1P39970 489 aa2.74□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W MXR1P40029 184 aa2.74□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W SIP5P40210 489 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W YJR008WP47085 338 aa2.74□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W PBP1P53297 722 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W PDS5Q04264 1277 aa2.74□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W SPP382Q06411 708 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W BMS1Q08965 1183 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W PMA1P05030 918 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W CMP2P14747 604 aa2.74□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W RPT3P33298 428 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W ZDS1P50111 915 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W SPT20P50875 604 aa2.74□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W PLB2Q03674 706 aa2.74□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W YOL057WQ08225 711 aa2.74□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W PIN2Q12057 282 aa2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 22.1 ms