RNA–Protein interactions for RNA: YKR078W

YKR078W, Transcript of Cytoplasmic protein of unknown function, yeastyeast

Gene YKR078W, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR078WYKR078W DAM1P53267 343 aa3.91□□□□□ -1.78
YKR078WYKR078W CAF20P12962 161 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
YKR078WYKR078W YPT53P36019 220 aa3.9□□□□□ -1.79
YKR078WYKR078W SAK1P38990 1142 aa3.9□□□□□ -1.79
YKR078WYKR078W PZF1P39933 429 aa3.9□□□□□ -1.79
YKR078WYKR078W PKH1Q03407 766 aa3.9□□□□□ -1.79
YKR078WYKR078W ADY4Q05955 493 aa3.9□□□□□ -1.79
YKR078WYKR078W PRC1P00729 532 aa3.89□□□□□ -1.79
YKR078WYKR078W CAN1P04817 590 aa3.89□□□□□ -1.79
YKR078WYKR078W ALG2P43636 503 aa3.89□□□□□ -1.79
YKR078WYKR078W YBR053CP38235 358 aa3.89□□□□□ -1.79
YKR078WYKR078W QRI1P43123 477 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
YKR078WYKR078W TIM44Q01852 431 aa3.89□□□□□ -1.79
YKR078WYKR078W YDR514CQ04408 483 aa3.89□□□□□ -1.79
YKR078WYKR078W BDF2Q07442 638 aa3.89□□□□□ -1.79
YKR078WYKR078W IRC10Q08118 586 aa3.89□□□□□ -1.79
YKR078WYKR078W THI21Q08975 551 aa3.89□□□□□ -1.79
YKR078WYKR078W YLR415CO13578 112 aa3.88□□□□□ -1.79
YKR078WYKR078W NGG1P32494 702 aa3.88□□□□□ -1.79
YKR078WYKR078W MTH1P35198 433 aa3.88□□□□□ -1.79
YKR078WYKR078W GGA2P38817 585 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
YKR078WYKR078W PFA3P42836 336 aa3.88□□□□□ -1.79
YKR078WYKR078W GND2P53319 492 aa3.88□□□□□ -1.79
YKR078WYKR078W REH1Q06709 432 aa3.88□□□□□ -1.79
YKR078WYKR078W PHR1P05066 565 aaKnown RBP RIP-Chip data3.87□□□□□ -1.79not detected
YKR078WYKR078W SAP190P36123 1033 aa3.87□□□□□ -1.79
YKR078WYKR078W STU2P46675 888 aa3.87□□□□□ -1.79
YKR078WYKR078W TY4A-JP47023 414 aa3.87□□□□□ -1.79
YKR078WYKR078W ATP25Q03153 612 aa3.87□□□□□ -1.79
YKR078WYKR078W RSC3Q06639 885 aa3.87□□□□□ -1.79
YKR078WYKR078W MET7Q08645 548 aa3.87□□□□□ -1.79
YKR078WYKR078W GPR1Q12361 961 aa3.87□□□□□ -1.79
YKR078WYKR078W YBR182C-AQ8TGU6 64 aa3.87□□□□□ -1.79
YKR078WYKR078W SET5P38890 526 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
YKR078WYKR078W HXT16P47185 567 aa3.86□□□□□ -1.79
YKR078WYKR078W AMA1P50082 593 aa3.86□□□□□ -1.79
YKR078WYKR078W NRG1Q03125 231 aa3.86□□□□□ -1.79
YKR078WYKR078W ASM4Q05166 528 aa3.86□□□□□ -1.79
YKR078WYKR078W SPC29P33419 253 aa3.86□□□□□ -1.79
YKR078WYKR078W SPC42P36094 363 aa3.86□□□□□ -1.79
YKR078WYKR078W YHL017WP38745 532 aa3.86□□□□□ -1.79
YKR078WYKR078W YJL163CP46996 555 aa3.86□□□□□ -1.79
YKR078WYKR078W DAS1P47005 663 aa3.86□□□□□ -1.79
YKR078WYKR078W NSE3Q05541 303 aa3.86□□□□□ -1.79
YKR078WYKR078W GAL11P19659 1081 aa3.85□□□□□ -1.79
YKR078WYKR078W RLP7P40693 322 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
YKR078WYKR078W HBT1Q07653 1046 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
YKR078WYKR078W TGL5Q12043 749 aa3.85□□□□□ -1.79
YKR078WYKR078W SDS3P40505 327 aa3.84□□□□□ -1.79
YKR078WYKR078W YIR042CP40586 236 aa3.84□□□□□ -1.79
YKR078WYKR078W ZDS1P50111 915 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
YKR078WYKR078W ZIP2P53061 704 aa3.84□□□□□ -1.79
YKR078WYKR078W CRR1Q05790 422 aa3.84□□□□□ -1.79
YKR078WYKR078W IRC13Q08630 104 aa3.84□□□□□ -1.79
YKR078WYKR078W CDC53Q12018 815 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
YKR078WYKR078W STI1P15705 589 aaKnown RBP RIP-Chip data3.84□□□□□ -1.8not detected
YKR078WYKR078W PER1P25625 357 aa3.84□□□□□ -1.8
YKR078WYKR078W SHR5P41912 237 aa3.84□□□□□ -1.8
YKR078WYKR078W NNF1P47149 201 aa3.84□□□□□ -1.8
YKR078WYKR078W YML122CQ03207 126 aa3.84□□□□□ -1.8
YKR078WYKR078W DIF1O13577 133 aa3.83□□□□□ -1.8
YKR078WYKR078W LAT1P12695 482 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
YKR078WYKR078W SIC1P38634 284 aa3.83□□□□□ -1.8
YKR078WYKR078W MTR3P48240 250 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
YKR078WYKR078W MSL5Q12186 476 aaKnown RBP RIP-Chip data3.83□□□□□ -1.8not detected
YKR078WYKR078W HOS4P40480 1083 aa3.82□□□□□ -1.8
YKR078WYKR078W MRH1Q12117 320 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
YKR078WYKR078W YBR259WP38338 688 aa3.81□□□□□ -1.8
YKR078WYKR078W PCL5P38794 229 aa3.81□□□□□ -1.8
YKR078WYKR078W GDH3P39708 457 aa3.81□□□□□ -1.8
YKR078WYKR078W ERR1P0CX10 437 aa3.81□□□□□ -1.8
YKR078WYKR078W ERR2P0CX11 437 aa3.81□□□□□ -1.8
YKR078WYKR078W HIS7P33734 552 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
YKR078WYKR078W BCD1P38772 366 aa3.81□□□□□ -1.8
YKR078WYKR078W ALY2P47029 1046 aa3.81□□□□□ -1.8
YKR078WYKR078W MAL11P53048 616 aa3.81□□□□□ -1.8
YKR078WYKR078W TEX1P53851 422 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
YKR078WYKR078W RIA1P53893 1110 aa3.81□□□□□ -1.8
YKR078WYKR078W YDR338CQ05497 695 aa3.81□□□□□ -1.8
YKR078WYKR078W ATG11Q12527 1178 aa3.81□□□□□ -1.8
YKR078WYKR078W CHZ1P40019 153 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
YKR078WYKR078W BAP3P41815 604 aa3.8□□□□□ -1.8
YKR078WYKR078W HSV2P50079 448 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
YKR078WYKR078W SUT2Q12286 268 aa3.8□□□□□ -1.8
YKR078WYKR078W YOL098CQ12496 1037 aa3.8□□□□□ -1.8
YKR078WYKR078W MTC2P34246 357 aa3.79□□□□□ -1.8
YKR078WYKR078W UBC11P52492 156 aa3.79□□□□□ -1.8
YKR078WYKR078W SGO1Q08490 590 aa3.79□□□□□ -1.8
YKR078WYKR078W FMP52P40008 231 aa3.79□□□□□ -1.8
YKR078WYKR078W ATF1P40353 525 aa3.79□□□□□ -1.8
YKR078WYKR078W YOR131CQ12486 218 aa3.79□□□□□ -1.8
YKR078WYKR078W ECM1P39715 212 aa3.78□□□□□ -1.8
YKR078WYKR078W GAD1Q04792 585 aa3.78□□□□□ -1.8
YKR078WYKR078W HIR1P32479 840 aa3.77□□□□□ -1.81
YKR078WYKR078W SRP40P32583 406 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
YKR078WYKR078W MCD4P36051 919 aa3.77□□□□□ -1.81
YKR078WYKR078W TDP1P38319 544 aa3.77□□□□□ -1.81
YKR078WYKR078W PRP31P49704 494 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
YKR078WYKR078W TEL2P53038 688 aa3.77□□□□□ -1.81
YKR078WYKR078W YLR149CQ99296 730 aa3.77□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.5 ms