RNA–Protein interactions for RNA: YKL007W

CAP1, Transcript of Alpha subunit of the capping protein heterodimer (Cap1p and Cap2p), yeast

Gene CAP1, Length 807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CAP1	YKL007W	DIF1	O13577	133 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CAP1	YKL007W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CAP1	YKL007W	ERR1	P0CX10	437 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CAP1	YKL007W	ERR2	P0CX11	437 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CAP1	YKL007W	PHO8	P11491	566 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CAP1	YKL007W	ERG4	P25340	473 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CAP1	YKL007W	YCL002C	P25565	263 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CAP1	YKL007W	TIM23	P32897	222 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CAP1	YKL007W	VHR1	P40522	640 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CAP1	YKL007W	SSY5	P47002	699 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CAP1	YKL007W	ASI2	P53895	289 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CAP1	YKL007W	CTF4	Q01454	927 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CAP1	YKL007W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CAP1	YKL007W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CAP1	YKL007W	THI21	Q08975	551 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CAP1	YKL007W	MET3	P08536	511 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CAP1	YKL007W	RPP1	P38786	293 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CAP1	YKL007W	KIN4	Q01919	800 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CAP1	YKL007W	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CAP1	YKL007W	MDM12	Q92328	271 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CAP1	YKL007W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CAP1	YKL007W	MTC2	P34246	357 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAP1	YKL007W	SUL1	P38359	859 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAP1	YKL007W	SAK1	P38990	1142 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAP1	YKL007W	ALY2	P47029	1046 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAP1	YKL007W	ERG5	P54781	538 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAP1	YKL007W	RNT1	Q02555	471 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAP1	YKL007W	UGO1	Q03327	502 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAP1	YKL007W	DLT1	Q04216	342 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAP1	YKL007W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CAP1	YKL007W	THI4	P32318	326 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CAP1	YKL007W	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CAP1	YKL007W	BUL1	P48524	976 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CAP1	YKL007W	AMA1	P50082	593 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CAP1	YKL007W	ZIP2	P53061	704 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CAP1	YKL007W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CAP1	YKL007W	YLR415C	O13578	112 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CAP1	YKL007W	CIT2	P08679	460 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CAP1	YKL007W	PER1	P25625	357 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CAP1	YKL007W	MSH2	P25847	964 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CAP1	YKL007W	CHS7	P38843	316 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CAP1	YKL007W	CAF16	P43569	289 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CAP1	YKL007W	HXT16	P47185	567 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CAP1	YKL007W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CAP1	YKL007W	MAL11	P53048	616 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CAP1	YKL007W	YLR040C	Q07988	224 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CAP1	YKL007W	YOL073C	Q08232	322 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CAP1	YKL007W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CAP1	YKL007W	DSS1	P39112	969 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CAP1	YKL007W	ELO3	P40319	345 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CAP1	YKL007W	PFA3	P42836	336 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CAP1	YKL007W	TY4A-J	P47023	414 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CAP1	YKL007W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CAP1	YKL007W	NRG1	Q03125	231 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CAP1	YKL007W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CAP1	YKL007W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CAP1	YKL007W	ALG7	P07286	448 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CAP1	YKL007W	PEX6	P33760	1030 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CAP1	YKL007W	YBR259W	P38338	688 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CAP1	YKL007W	YBP2	P53169	641 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CAP1	YKL007W	CRR1	Q05790	422 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CAP1	YKL007W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CAP1	YKL007W	MCD4	P36051	919 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CAP1	YKL007W	FKH2	P41813	862 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CAP1	YKL007W	BNA2	P47125	453 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CAP1	YKL007W	SLI1	P53304	468 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CAP1	YKL007W	TIM44	Q01852	431 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CAP1	YKL007W	COG8	Q04632	607 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CAP1	YKL007W	OMS1	Q06668	471 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CAP1	YKL007W	ATG11	Q12527	1178 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CAP1	YKL007W	CDC9	P04819	755 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CAP1	YKL007W	VBA3	P25594	458 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CAP1	YKL007W	YEL1	P34225	687 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CAP1	YKL007W	OAR1	P35731	278 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CAP1	YKL007W	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CAP1	YKL007W	SIC1	P38634	284 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CAP1	YKL007W	YIR042C	P40586	236 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CAP1	YKL007W	YFL052W	P43551	465 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CAP1	YKL007W	DAS1	P47005	663 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CAP1	YKL007W	ORC4	P54791	529 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CAP1	YKL007W	FRE5	Q08908	694 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CAP1	YKL007W	ACF2	Q12168	779 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CAP1	YKL007W	HSL7	P38274	827 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CAP1	YKL007W	ECM1	P39715	212 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CAP1	YKL007W	MUP1	P50276	574 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CAP1	YKL007W	NPY1	P53164	384 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CAP1	YKL007W	ADY4	Q05955	493 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CAP1	YKL007W	SRD1	P09007	221 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CAP1	YKL007W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CAP1	YKL007W	HOG1	P32485	435 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CAP1	YKL007W	PPG1	P32838	368 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CAP1	YKL007W	MOH1	P38191	138 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CAP1	YKL007W	UBA2	P52488	636 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CAP1	YKL007W	NHX1	Q04121	633 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CAP1	YKL007W	YDR338C	Q05497	695 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CAP1	YKL007W	MRPS35	P53292	345 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CAP1	YKL007W	GPR1	Q12361	961 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CAP1	YKL007W	TRM13	Q12383	476 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CAP1	YKL007W	MEF1	P25039	761 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CAP1	YKL007W	APT2	P36973	181 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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