RNA–Protein interactions for RNA: YJL113W

YJL113W, Transcript of Retrotransposon TYA Gag and TYB Pol genes, yeastyeast

Gene YJL113W, Length 4,647 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJL113WYJL113W PET127P32606 800 aa-0.04□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W DED81P38707 554 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W YHL012WP38709 493 aa-0.04□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W STT3P39007 718 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W TIM17P39515 158 aa-0.04□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W MXR1P40029 184 aa-0.04□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W THI6P41835 540 aa-0.04□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W SPS1P08458 490 aa-0.04□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W PRP16P15938 1071 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W VMA3P25515 160 aa-0.04□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W RPS7AP26786 190 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W PSO2P30620 661 aa-0.04□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W YAT2P40017 923 aa-0.04□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W SIM1P40472 476 aa-0.04□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W YFR020WP43600 232 aa-0.04□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W CAF130P53280 1122 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W YAT1P80235 687 aa-0.04□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W CLU1Q03690 1277 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W HEL2Q05580 639 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W YPS7Q06325 596 aa-0.04□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W YLR149CQ99296 730 aa-0.04□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W PCK1P10963 549 aa-0.04□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W POX1P13711 748 aa-0.04□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W CDC42P19073 191 aa-0.04□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W YSR3P23501 404 aa-0.04□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W PHO11P35842 467 aa-0.04□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W ERG7P38604 731 aa-0.04□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W PHO12P38693 467 aa-0.04□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W OCA5P38738 679 aa-0.04□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W YJL206CP39529 758 aa-0.04□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W ALT1P52893 592 aa-0.04□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W PEF1P53238 335 aa-0.04□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W ALD6P54115 500 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W MUK1Q02866 612 aa-0.04□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W SEG1Q04279 960 aa-0.04□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W SEC15P22224 910 aa-0.04□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W SCT1P32784 759 aa-0.04□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W TFA2P36145 328 aa-0.04□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W YER156CP40093 338 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W XBP1P40489 647 aa-0.04□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W YJR124CP47159 448 aa-0.04□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W SPH1Q06160 661 aa-0.04□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W SLK19Q08581 821 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W APM4Q99186 491 aa-0.04□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W GFA1P14742 717 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W PRE10P21242 288 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.05□□□□□ -2.42not detected
YJL113WYJL113W ATS1P31386 333 aa-0.05□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W MGM1P32266 881 aa-0.05□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W GEF1P37020 779 aa-0.05□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W YJR039WP47107 1121 aa-0.05□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W VAC7P53950 1165 aa-0.05□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W FMP30Q02883 468 aa-0.05□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W APE1P14904 514 aa-0.05□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W TKL1P23254 680 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W CYS3P31373 394 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W GRX7P38068 203 aa-0.05□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W GIP1P38229 639 aa-0.05□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W LNP1P38878 278 aa-0.05□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W UME6P39001 836 aa-0.05□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W MAD1P40957 749 aa-0.05□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W MSH4P40965 878 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W CEP3P40969 608 aa-0.05□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W LYS14P40971 790 aa-0.05□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W YNL320WP42840 284 aa-0.05□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W NCE103P53615 221 aa-0.05□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W HOS3Q02959 697 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W YLR257WQ06146 321 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W EAF1Q06337 982 aa-0.05□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W TDA5Q06417 326 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W HIS4P00815 799 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W MSN1P22148 382 aa-0.05□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W EMC1P25574 760 aa-0.05□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W TRM2P33753 639 aa-0.05□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W MRPL37P36532 105 aa-0.05□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W YBP1P38315 674 aa-0.05□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W INP51P40559 946 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W NRM1P53718 249 aa-0.05□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W HAS1Q03532 505 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W YAP6Q03935 383 aa-0.05□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W YMR018WQ04364 514 aa-0.05□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W YML083CQ04526 418 aa-0.05□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W RSC2Q06488 889 aa-0.05□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W GRE1Q08969 168 aa-0.05□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W BUG1Q12191 341 aa-0.05□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W PUF2Q12221 1075 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.05□□□□□ -2.42not detected
YJL113WYJL113W YVC1Q12324 675 aa-0.05□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W MNN4P36044 1178 aa-0.06□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W UIP5P36137 443 aa-0.06□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W BIM1P40013 344 aa-0.06□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W YDR415CQ04033 374 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W TSC13Q99190 310 aa-0.06□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W ADE3P07245 946 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W SPO11P23179 398 aa-0.06□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W CHS3P29465 1165 aa-0.06□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W BEM3P32873 1128 aa-0.06□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W SQT1P35184 431 aa-0.06□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W CUE1P38428 203 aa-0.06□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W SPC97P38863 823 aa-0.06□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W RAD55P38953 406 aa-0.06□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W UBP12P39538 1254 aa-0.06□□□□□ -2.42
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