RNA–Protein interactions for RNA: YER190W

YRF1-2, Transcript of Helicase encoded by the Y' element of subtelomeric regions, yeastyeast

Gene YRF1-2, Length 5,046 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-2YER190W TFB2Q02939 513 aa8.78□□□□□ -1
YRF1-2YER190W AIM33Q04516 312 aa8.78□□□□□ -1
YRF1-2YER190W GRX6Q12438 231 aa8.78□□□□□ -1
YRF1-2YER190W CBR1P38626 284 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
YRF1-2YER190W YGR273CP53329 174 aa8.78□□□□□ -1
YRF1-2YER190W CDC6P09119 513 aa8.78□□□□□ -1
YRF1-2YER190W ALD5P40047 520 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
YRF1-2YER190W GUP1P53154 560 aa8.78□□□□□ -1
YRF1-2YER190W DRN1P53255 507 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
YRF1-2YER190W YNL247WP53852 767 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
YRF1-2YER190W NCS2P53923 493 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
YRF1-2YER190W YPL109CQ02981 657 aa8.78□□□□□ -1
YRF1-2YER190W YMR027WQ04371 470 aa8.78□□□□□ -1
YRF1-2YER190W IVY1Q04934 453 aa8.78□□□□□ -1
YRF1-2YER190W NCA2Q12374 616 aa8.78□□□□□ -1
YRF1-2YER190W KIP2P28743 706 aa8.77□□□□□ -1
YRF1-2YER190W VPH2P32341 215 aa8.77□□□□□ -1
YRF1-2YER190W ERP5P38819 212 aa8.77□□□□□ -1
YRF1-2YER190W SSP120P39931 234 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1
YRF1-2YER190W NOP12Q08208 459 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1
YRF1-2YER190W VMA1P17255 1071 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W PAP1P29468 568 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W SHE10P53075 577 aa8.77□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W TFB3Q03290 321 aa8.77□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W CRF1Q04930 467 aa8.77□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W YPL277CQ08989 487 aa8.77□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W SRD1P09007 221 aa8.77□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W CLN2P20438 545 aa8.77□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W PBP2P38151 413 aaKnown RBP RIP-Chip data8.77□□□□□ -1.01not detected
YRF1-2YER190W CST26P38226 397 aa8.77□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W YHL008CP38750 627 aa8.77□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W GGA2P38817 585 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W ATP25Q03153 612 aa8.77□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W SYF1Q04048 859 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W ADY4Q05955 493 aa8.77□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W MCM3P24279 971 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W MGT1P26188 188 aa8.77□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W TGL4P36165 910 aa8.77□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W REB1P21538 810 aa8.76□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W RPS0AP32905 252 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W PET100P38958 111 aa8.76□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W AIM20P40451 204 aa8.76□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W FMS1P50264 508 aa8.76□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W OYE2Q03558 400 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W YDL124WQ07551 312 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W ACK1Q07622 623 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W PIH1P38768 344 aa8.76□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W FET4P40988 552 aa8.76□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W HLJ1P48353 224 aa8.76□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W YDR476CQ03362 224 aa8.76□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W PIG1Q06216 648 aa8.76□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W ATP7P30902 174 aa8.76□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W KTR2P33550 425 aa8.76□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W EPS1P40557 701 aa8.76□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W SPO20Q04359 397 aa8.76□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W PYC1P11154 1178 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W CSM2P40465 213 aa8.76□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W SLU7Q02775 382 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W YLR053CQ12026 108 aa8.76□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W PPR1P07272 904 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W YMR134WP40207 237 aa8.75□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W YJR008WP47085 338 aa8.75□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W YJR142WP47173 342 aa8.75□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W ARB1P40024 610 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W EFM4P40516 257 aa8.75□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W MRM2P53123 320 aa8.75□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W VPS16Q03308 798 aa8.75□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W YLR297WQ05899 129 aa8.75□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W OCA6Q12454 224 aa8.75□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W PCF11P39081 626 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W THO1P40040 218 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W CRP1P38845 465 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data8.75□□□□□ -1.01not detected
YRF1-2YER190W MMT1Q03218 510 aa8.75□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W PCK1P10963 549 aa8.74□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W BZZ1P38822 633 aa8.74□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W PRP42Q03776 544 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W POB3Q04636 552 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W RRG1Q12167 365 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W LHS1P36016 881 aa8.74□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W TBS1P38114 1094 aa8.74□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W GIP1P38229 639 aa8.74□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W SUL1P38359 859 aa8.74□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W YHR078WP38799 552 aa8.74□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W HXT10P43581 546 aa8.74□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W TY1B-BRQ12193 1756 aa8.74□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W TY1B-GR3Q12316 1755 aa8.74□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W TY1B-ORQ92393 1755 aa8.74□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W MEI5P32489 222 aa8.74□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W ECM4P36156 370 aa8.74□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W TOM22P49334 152 aa8.74□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W ATG16Q03818 150 aa8.74□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W RPN9Q04062 393 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W SFH1Q06168 426 aa8.74□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W GRE2Q12068 342 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W YLL058WQ12198 575 aa8.74□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W HOS1Q12214 470 aa8.74□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W SEC66P33754 206 aa8.73□□□□□ -1.01
YRF1-2YER190W APM2P38700 605 aa8.73□□□□□ -1.01
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