RNA–Protein interactions for RNA: Q0055

AI2, Reverse transcriptase required for splicing of the COX1 pre-mRNA, yeast

Gene AI2, Length 2,565 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AI2	Q0055	TOK1	P40310	691 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	BFA1	P47113	574 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	YML6	P51998	286 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	PHM6	Q05637	104 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	YPL272C	Q08984	517 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.18	□□□□□ -1.9	not detected
AI2	Q0055	NUP145	P49687	1317 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	INO80	P53115	1489 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	IDI1	P15496	288 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	SFP1	P32432	683 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	HOG1	P32485	435 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	RXT2	P38255	430 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	GCD10	P41814	478 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	SLS1	P42900	643 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	CNN1	P43618	361 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	ALG2	P43636	503 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	CIR2	Q08822	631 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	CAJ1	P39101	391 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	YTA6	P40328	754 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	VTC2	P43585	828 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	YNR061C	P53747	219 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	SKY1	Q03656	742 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	SOD2	P00447	233 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	RAD18	P10862	487 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	CHS3	P29465	1165 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	SLA2	P33338	968 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	YBR138C	P38277	524 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	IFA38	P38286	347 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	YFL054C	P43549	646 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	YPR071W	Q12346	211 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	SEM1	O94742	89 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	APE1	P14904	514 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	RIM4	P38741	713 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	AIM46	P38885	310 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	PUG1	P40100	303 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	AXL1	P40851	1208 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	HRQ1	Q05549	1077 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	CYB2	P00175	591 aa		3.15	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	ADH4	P10127	382 aa		3.15	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.15	□□□□□ -1.9	RIP-Chip
AI2	Q0055	IME1	P21190	360 aa		3.15	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	ADP1	P25371	1049 aa		3.15	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	YCL049C	P25577	312 aa		3.15	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	MTC7	P32633	139 aa		3.15	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	YBR225W	P38321	900 aa		3.15	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	YHR218W	P38899	603 aa		3.15	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	EAF5	P39995	279 aa		3.15	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	ROG3	P43602	733 aa		3.15	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	MDE1	P47095	244 aa		3.15	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	LYS5	P50113	272 aa		3.15	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	COG8	Q04632	607 aa		3.15	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	SSM4	P40318	1319 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.15	□□□□□ -1.91	not detected
AI2	Q0055	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	CTF13	P35203	478 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	YJR124C	P47159	448 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	FDC1	Q03034	503 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	ARP9	Q05123	467 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	PEX15	Q08215	383 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	YIG1	Q08956	461 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	ARP7	Q12406	477 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	FUS1	P11710	512 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	YKL133C	P36066	463 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	SET3	P36124	751 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	VPS41	P38959	992 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	YER010C	P40011	234 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	NSG2	P53898	299 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	PEX13	P80667	386 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	VID22	Q05934	901 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	OMS1	Q06668	471 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91

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