RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638448.1

GYPB-216, Transcript of glycophorin B (MNS blood group), human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GYPB, Length 363 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GYPB-216	ENST00000638448	FAM229A	H3BQW9	127 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	PRMT3	O60678	531 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	NPR3	P17342	541 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	VAMP1	P23763	118 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	NEUROD1	Q13562	356 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	RTN1	Q16799	776 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	BHMT	Q93088	406 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	ZNF428	Q96B54	188 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	HINFP	Q9BQA5	517 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	HIF1A	Q16665	826 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	IER5	Q5VY09	327 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	BCS1L	Q9Y276	419 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GYPB-216	ENST00000638448	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448		H3BRB1	525 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	NID1	P14543	1247 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	PRRT3	Q5FWE3	981 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	ASB16	Q96NS5	453 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	KLK14	Q9P0G3	267 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	ARHGAP4	P98171	946 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	DOC2B	Q14184	412 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	ECM1	Q16610	540 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	CITED4	Q96RK1	184 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63	2e-23	■■■■■ 397.5
GYPB-216	ENST00000638448	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	NAGPA	Q9UK23	515 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	UNCX	A6NJT0	531 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	FAM13A	O94988	1023 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	NFKB1	P19838	968 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	GATA4	P43694	442 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	DGKZ	Q13574	1117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	GSX2	Q9BZM3	304 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	BCL11A	Q9H165	835 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	IGFLR1	Q9H665	355 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	LILRB5	O75023	590 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	APBA3	O96018	575 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	ABL1	P00519	1130 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	ITGB7	P26010	798 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	INPP5B	P32019	993 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	IDH3A	P50213	366 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	FGD1	P98174	961 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	XP32	Q5T750	250 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	NUDT8	Q8WV74	236 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	PNMA5	Q96PV4	448 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	EPB42	P16452	691 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	SCNN1A	P37088	669 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	CCIN	Q13939	588 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	GRIK4	Q16099	956 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	MYO19	Q96H55	970 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	SEPT3	Q9UH03	358 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448		A0A0A0MRY4	1105 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	MAPK1	P28482	360 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	ITGAE	P38570	1179 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	ARSD	P51689	593 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	C16orf46	Q6P387	395 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GYPB-216	ENST00000638448	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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