RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC136Q96JN2 1154 aa28.37■■■□□ 2.13
TSNARE1-208ENST00000524325 POLD1P28340 1107 aa28.36■■■□□ 2.13
TSNARE1-208ENST00000524325 SGIP1Q9BQI5 828 aa28.36■■■□□ 2.13
TSNARE1-208ENST00000524325 MTX1Q13505 466 aa28.35■■■□□ 2.13
TSNARE1-208ENST00000524325 ITGA6P23229 1130 aa28.34■■■□□ 2.13
TSNARE1-208ENST00000524325 SSH3Q8TE77 659 aa28.33■■■□□ 2.13
TSNARE1-208ENST00000524325 BRIP1Q9BX63 1249 aa28.33■■■□□ 2.13
TSNARE1-208ENST00000524325 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
TSNARE1-208ENST00000524325 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
TSNARE1-208ENST00000524325 POLA2Q14181 598 aa28.33■■■□□ 2.13
TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC152Q4G0S7 254 aa28.33■■■□□ 2.13
TSNARE1-208ENST00000524325 SIL1Q9H173 461 aa28.33■■■□□ 2.13
TSNARE1-208ENST00000524325 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
TSNARE1-208ENST00000524325 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
TSNARE1-208ENST00000524325 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC57Q2TAC2 916 aa28.31■■■□□ 2.12
TSNARE1-208ENST00000524325 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
TSNARE1-208ENST00000524325 KLHL34Q8N239 644 aa28.31■■■□□ 2.12
TSNARE1-208ENST00000524325 APBB1O00213 710 aa28.31■■■□□ 2.12
TSNARE1-208ENST00000524325 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
TSNARE1-208ENST00000524325 BCL11AQ9H165 835 aa28.31■■■□□ 2.12
TSNARE1-208ENST00000524325 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa28.31■■■□□ 2.12
TSNARE1-208ENST00000524325 CHRNA5P30532 468 aa28.3■■■□□ 2.12
TSNARE1-208ENST00000524325 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
TSNARE1-208ENST00000524325 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
TSNARE1-208ENST00000524325 SPON1Q9HCB6 807 aa28.3■■■□□ 2.12
TSNARE1-208ENST00000524325 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC51AQ86UW1 340 aa28.3■■■□□ 2.12
TSNARE1-208ENST00000524325 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
TSNARE1-208ENST00000524325 HMMRO75330 724 aa28.29■■■□□ 2.12
TSNARE1-208ENST00000524325 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
TSNARE1-208ENST00000524325 NRXN2Q9P2S2 1712 aa28.28■■■□□ 2.12
TSNARE1-208ENST00000524325 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa28.28■■■□□ 2.12
TSNARE1-208ENST00000524325 SURF6O75683 361 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
TSNARE1-208ENST00000524325 CRY2Q49AN0 593 aa28.28■■■□□ 2.12
TSNARE1-208ENST00000524325 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
TSNARE1-208ENST00000524325 COL4A1P02462 1669 aa28.27■■■□□ 2.12
TSNARE1-208ENST00000524325 TAF7LQ5H9L4 462 aa28.27■■■□□ 2.12
TSNARE1-208ENST00000524325 C2CD5Q86YS7 1000 aa28.27■■■□□ 2.12
TSNARE1-208ENST00000524325 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
TSNARE1-208ENST00000524325 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
TSNARE1-208ENST00000524325 PDE6BP35913 854 aa28.26■■■□□ 2.11
TSNARE1-208ENST00000524325 LRRC24Q50LG9 513 aa28.26■■■□□ 2.11
TSNARE1-208ENST00000524325 WWC3Q9ULE0 1092 aa28.26■■■□□ 2.11
TSNARE1-208ENST00000524325 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
TSNARE1-208ENST00000524325 C10orf71Q711Q0 1435 aa28.25■■■□□ 2.11
TSNARE1-208ENST00000524325 SRGNP10124 158 aa28.24■■■□□ 2.11
TSNARE1-208ENST00000524325 A0A0G2JLW4 131 aa28.24■■■□□ 2.11
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP28.24■■■□□ 2.11
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TSNARE1-208ENST00000524325 RIC1Q4ADV7 1423 aa28.23■■■□□ 2.11
TSNARE1-208ENST00000524325 COPRSQ9NQ92 184 aa28.22■■■□□ 2.11
TSNARE1-208ENST00000524325 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
TSNARE1-208ENST00000524325 KDM2BQ8NHM5 1336 aa28.22■■■□□ 2.11
TSNARE1-208ENST00000524325 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa28.21■■■□□ 2.11
TSNARE1-208ENST00000524325 H0YIN7 160 aa28.21■■■□□ 2.11
TSNARE1-208ENST00000524325 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
TSNARE1-208ENST00000524325 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa28.21■■■□□ 2.11
TSNARE1-208ENST00000524325 SKAP1Q86WV1 359 aa28.21■■■□□ 2.11
TSNARE1-208ENST00000524325 RTL9Q8NET4 1388 aa28.21■■■□□ 2.11
TSNARE1-208ENST00000524325 DPEP1P16444 411 aa28.2■■■□□ 2.11
TSNARE1-208ENST00000524325 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.11
TSNARE1-208ENST00000524325 LAMB2P55268 1798 aa28.2■■■□□ 2.11
TSNARE1-208ENST00000524325 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
TSNARE1-208ENST00000524325 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa28.2■■■□□ 2.1
TSNARE1-208ENST00000524325 RPS8P62241 208 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
TSNARE1-208ENST00000524325 ATG9AQ7Z3C6 839 aa28.19■■■□□ 2.1
TSNARE1-208ENST00000524325 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
TSNARE1-208ENST00000524325 CNNM1Q9NRU3 951 aa28.19■■■□□ 2.1
TSNARE1-208ENST00000524325 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
TSNARE1-208ENST00000524325 NPR1P16066 1061 aa28.19■■■□□ 2.1
TSNARE1-208ENST00000524325 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
TSNARE1-208ENST00000524325 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP28.19■■■□□ 2.1
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TSNARE1-208ENST00000524325 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
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TSNARE1-208ENST00000524325 EYA2O00167 538 aa28.18■■■□□ 2.1
TSNARE1-208ENST00000524325 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
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TSNARE1-208ENST00000524325 SMC5Q8IY18 1101 aa28.17■■■□□ 2.1
TSNARE1-208ENST00000524325 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
TSNARE1-208ENST00000524325 SASH1O94885 1247 aa28.17■■■□□ 2.1
TSNARE1-208ENST00000524325 ANKRD45Q5TZF3 282 aa28.17■■■□□ 2.1
TSNARE1-208ENST00000524325 OLFM4Q6UX06 510 aa28.17■■■□□ 2.1
TSNARE1-208ENST00000524325 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa28.17■■■□□ 2.1
TSNARE1-208ENST00000524325 TAF1P21675 1872 aa28.17■■■□□ 2.1
TSNARE1-208ENST00000524325 KCNA3P22001 575 aa28.16■■■□□ 2.1
TSNARE1-208ENST00000524325 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
TSNARE1-208ENST00000524325 NLGN2Q8NFZ4 835 aa28.16■■■□□ 2.1
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
TSNARE1-208ENST00000524325 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa28.16■■■□□ 2.1
TSNARE1-208ENST00000524325 MYH3P11055 1940 aa28.16■■■□□ 2.1
TSNARE1-208ENST00000524325 TFCP2Q12800 502 aa28.15■■■□□ 2.1
TSNARE1-208ENST00000524325 GCC1Q96CN9 775 aa28.15■■■□□ 2.1
TSNARE1-208ENST00000524325 CRAMP1Q96RY5 1269 aa28.15■■■□□ 2.1
TSNARE1-208ENST00000524325 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
TSNARE1-208ENST00000524325 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
TSNARE1-208ENST00000524325 SNAP23O00161 211 aa28.13■■■□□ 2.09
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