RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516130.1

RNU6-1278P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1278, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1278P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1278P-201ENST00000516130 NOD1Q9Y239 953 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-1278P-201ENST00000516130 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-1278P-201ENST00000516130 ITGB5P18084 799 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-1278P-201ENST00000516130 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-1278P-201ENST00000516130 C7orf69Q9H7B7 122 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-1278P-201ENST00000516130 C11orf16Q9NQ32 467 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-1278P-201ENST00000516130 CHMP3Q9Y3E7 222 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-1278P-201ENST00000516130 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1278P-201ENST00000516130 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1278P-201ENST00000516130 SOX11P35716 441 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1278P-201ENST00000516130 SETDB1Q15047 1291 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1278P-201ENST00000516130 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1278P-201ENST00000516130 TRIM42Q8IWZ5 723 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1278P-201ENST00000516130 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1278P-201ENST00000516130 CEP41Q9BYV8 373 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1278P-201ENST00000516130 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1278P-201ENST00000516130 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1278P-201ENST00000516130 PSME1Q06323 249 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1278P-201ENST00000516130 VAC14Q08AM6 782 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1278P-201ENST00000516130 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1278P-201ENST00000516130 PRM3Q9NNZ6 103 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1278P-201ENST00000516130 ZFATQ9P243 1243 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1278P-201ENST00000516130 HMX2A2RU54 273 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1278P-201ENST00000516130 GRNP28799 593 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1278P-201ENST00000516130 NRLP54845 237 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1278P-201ENST00000516130 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1278P-201ENST00000516130 STAG2Q8N3U4 1231 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1278P-201ENST00000516130 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1278P-201ENST00000516130 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1278P-201ENST00000516130 DBX1A6NMT0 343 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1278P-201ENST00000516130 TGFBR3LH3BV60 316 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1278P-201ENST00000516130 M0R2N6 131 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1278P-201ENST00000516130 PRNPP04156 253 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1278P-201ENST00000516130 EPB42P16452 691 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1278P-201ENST00000516130 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1278P-201ENST00000516130 SEMA3FQ13275 785 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1278P-201ENST00000516130 CLEC10AQ8IUN9 316 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1278P-201ENST00000516130 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1278P-201ENST00000516130 SHKBP1Q8TBC3 707 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1278P-201ENST00000516130 MYRFLQ96LU7 910 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1278P-201ENST00000516130 FAM83CQ9BQN1 747 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1278P-201ENST00000516130 PIK3CDO00329 1044 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1278P-201ENST00000516130 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1278P-201ENST00000516130 WASHC4Q2M389 1173 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1278P-201ENST00000516130 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1278P-201ENST00000516130 IFT43Q96FT9 208 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1278P-201ENST00000516130 MUC3BQ9H195 1237 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1278P-201ENST00000516130 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1278P-201ENST00000516130 C21orf2O43822 256 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1278P-201ENST00000516130 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1278P-201ENST00000516130 INPP5BP32019 993 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1278P-201ENST00000516130 NCOA4Q13772 614 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1278P-201ENST00000516130 MSMPQ1L6U9 139 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1278P-201ENST00000516130 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1278P-201ENST00000516130 NFXL1Q6ZNB6 911 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1278P-201ENST00000516130 IL22RA1Q8N6P7 574 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1278P-201ENST00000516130 PLD4Q96BZ4 506 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1278P-201ENST00000516130 FBXL18Q96ME1 805 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1278P-201ENST00000516130 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1278P-201ENST00000516130 PIM2Q9P1W9 311 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1278P-201ENST00000516130 RARAP10276 462 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-1278P-201ENST00000516130 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-1278P-201ENST00000516130 TARSP26639 723 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-1278P-201ENST00000516130 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-1278P-201ENST00000516130 RTN1Q16799 776 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-1278P-201ENST00000516130 FAM20CQ8IXL6 584 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-1278P-201ENST00000516130 TPCN2Q8NHX9 752 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-1278P-201ENST00000516130 CCDC39Q9UFE4 941 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-1278P-201ENST00000516130 BCS1LQ9Y276 419 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-1278P-201ENST00000516130 TM4SF5O14894 197 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-1278P-201ENST00000516130 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-1278P-201ENST00000516130 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-1278P-201ENST00000516130 WISP1O95388 367 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-1278P-201ENST00000516130 SKIP12755 728 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-1278P-201ENST00000516130 COL19A1Q14993 1142 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-1278P-201ENST00000516130 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-1278P-201ENST00000516130 VSIG10LQ86VR7 867 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-1278P-201ENST00000516130 TRIM50Q86XT4 487 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-1278P-201ENST00000516130 GALNT11Q8NCW6 608 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-1278P-201ENST00000516130 GAS2L2Q8NHY3 880 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-1278P-201ENST00000516130 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-1278P-201ENST00000516130 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-1278P-201ENST00000516130 CCDC102BQ68D86 513 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-1278P-201ENST00000516130 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
RNU6-1278P-201ENST00000516130 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
RNU6-1278P-201ENST00000516130 HFE2Q6ZVN8 426 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-1278P-201ENST00000516130 ACAD11Q709F0 780 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-1278P-201ENST00000516130 KIAA1024Q9UPX6 916 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-1278P-201ENST00000516130 PPME1Q9Y570 386 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-1278P-201ENST00000516130 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-1278P-201ENST00000516130 WDR64B1ANS9 1081 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-1278P-201ENST00000516130 SASH3O75995 380 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-1278P-201ENST00000516130 FOSL1P15407 271 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-1278P-201ENST00000516130 CD68P34810 354 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
RNU6-1278P-201ENST00000516130 SIK1P57059 783 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-1278P-201ENST00000516130 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
RNU6-1278P-201ENST00000516130 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-1278P-201ENST00000516130 BEND4Q6ZU67 534 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-1278P-201ENST00000516130 KRT25Q7Z3Z0 450 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-1278P-201ENST00000516130 HIF3AQ9Y2N7 669 aa4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms