RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512611.5

RAPGEF6-211, Transcript of Rap guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAPGEF6, Length 3,683 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF6-211ENST00000512611 ABTB2Q8N961 1025 aa8.09□□□□□ -1.11
RAPGEF6-211ENST00000512611 EVI5LQ96CN4 794 aa8.09□□□□□ -1.11
RAPGEF6-211ENST00000512611 ERBB3P21860 1342 aa8.09□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 BTBD11A6QL63 1104 aa8.08□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLFN14P0C7P3 912 aa8.08□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZBTB9Q96C00 473 aa8.08□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 FSD1Q9BTV5 496 aa8.08□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 TECPR2O15040 1411 aa8.08□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 CEP135Q66GS9 1140 aa8.08□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 SMTNL1A8MU46 457 aa8.08□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 SCRN1Q12765 414 aa8.08□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 RESTQ13127 1097 aa8.08□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 Q6ZUG5 572 aa8.08□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 CCDC112Q8NEF3 446 aa8.08□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 KIF18AQ8NI77 898 aa8.08□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 RUFY2Q8WXA3 655 aa8.08□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 SIRT1Q96EB6 747 aa8.08□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF446Q9NWS9 450 aa8.08□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 ELP1O95163 1332 aa8.08□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 NALCNQ8IZF0 1738 aa8.08□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 TAF5LO75529 589 aa8.07□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 SKILP12757 684 aa8.07□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 CCT2P78371 535 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 ELF2Q15723 593 aa8.07□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa8.07□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 STOX1Q6ZVD7 989 aa8.07□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 GJB4Q9NTQ9 266 aa8.07□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 OGFRQ9NZT2 677 aa8.07□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 TAOK2Q9UL54 1235 aa8.07□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 CTDNEP1O95476 244 aa8.07□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa8.07□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 TSPOAP1O95153 1857 aa8.07□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 CYP21A2P08686 494 aa8.07□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 CCZ1BP86790 482 aa8.07□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 ISM2Q6H9L7 571 aa8.07□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 NPHP3Q7Z494 1330 aa8.07□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 TMEM2Q9UHN6 1383 aa8.07□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 NBPF11Q86T75 865 aa8.06□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 USP28Q96RU2 1077 aa8.06□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 PPP6R1Q9UPN7 881 aa8.06□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 FMN2Q9NZ56 1722 aa8.06□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa8.06□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 CCDC69A6NI79 296 aa8.06□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 IGKV5-2P06315 115 aa8.06□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 GTF3C6Q969F1 213 aa8.06□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa8.06□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 LRRC37A3O60309 1634 aa8.06□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 ERICH4A6NGS2 130 aa8.06□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 KIF20AO95235 890 aa8.06□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 TPM3P06753 285 aa8.06□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 MYL6BP14649 208 aa8.06□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLC39A6Q13433 755 aa8.06□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 MTX1Q13505 466 aa8.06□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 NYAP1Q6ZVC0 841 aa8.06□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 FANCGO15287 622 aa8.05□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 GOLGA8FQ08AF8 430 aa8.05□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa8.05□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 APOBRQ0VD83 1088 aa8.05□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa8.05□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 EPC1Q9H2F5 836 aa8.05□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 PXDNLA1KZ92 1463 aa8.05□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 PIK3C2AO00443 1686 aa8.05□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 A0A1B0GVL5 298 aa8.05□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 H3BQV1 296 aa8.05□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa8.05□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 IFFO2Q5TF58 517 aa8.05□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 AOPEPQ8N6M6 819 aa8.05□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 FMNL2Q96PY5 1086 aa8.05□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 MED23Q9ULK4 1368 aa8.05□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 BIN1O00499 593 aa8.05□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 PSMA5P28066 241 aa8.05□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 TEFQ10587 303 aa8.05□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP8.05□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa8.05□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 NEK1Q96PY6 1258 aa8.05□□□□□ -1.12
RAPGEF6-211ENST00000512611 FEZ1Q99689 392 aa8.05□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.7 ms