RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-208ENST00000502484 DEFB132Q7Z7B7 95 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF831Q5JPB2 1677 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-208ENST00000502484 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-208ENST00000502484 PLSCR1O15162 318 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-208ENST00000502484 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-208ENST00000502484 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-208ENST00000502484 RAB3GAP1Q15042 981 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-208ENST00000502484 ATG9AQ7Z3C6 839 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-208ENST00000502484 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-208ENST00000502484 PLA2G12BQ9BX93 195 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-208ENST00000502484 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-208ENST00000502484 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-208ENST00000502484 CHMP3Q9Y3E7 222 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-208ENST00000502484 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-208ENST00000502484 ATP5JP18859 108 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-208ENST00000502484 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-208ENST00000502484 MCM2P49736 904 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-208ENST00000502484 NEK4P51957 841 aa9.92□□□□□ -0.82
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PDE4D-208ENST00000502484 GPR108Q9NPR9 543 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-208ENST00000502484 PALLDQ8WX93 1383 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-208ENST00000502484 MCM4P33991 863 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-208ENST00000502484 IL15P40933 162 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-208ENST00000502484 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-208ENST00000502484 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-208ENST00000502484 BOLA2Q9H3K6 86 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-208ENST00000502484 SPEF2Q9C093 1822 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-208ENST00000502484 CDHR2Q9BYE9 1310 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-208ENST00000502484 CIAO1O76071 339 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-208ENST00000502484 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-208ENST00000502484 SNRKQ9NRH2 765 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-208ENST00000502484 FOXD4L1Q9NU39 408 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-208ENST00000502484 RFX7Q2KHR2 1363 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-208ENST00000502484 EYA2O00167 538 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-208ENST00000502484 SOCS7O14512 581 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-208ENST00000502484 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-208ENST00000502484 HLFQ16534 295 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-208ENST00000502484 FBXO3Q9UK99 471 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF609O15014 1411 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-208ENST00000502484 LY75O60449 1722 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-208ENST00000502484 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-208ENST00000502484 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-208ENST00000502484 ERVV-1B6SEH8 477 aa9.9□□□□□ -0.82
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PDE4D-208ENST00000502484 TXNRD1Q16881 649 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-208ENST00000502484 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-208ENST00000502484 CAMKK2Q96RR4 588 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-208ENST00000502484 DBNDD2Q9BQY9 259 aa9.9□□□□□ -0.82
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PDE4D-208ENST00000502484 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa9.9□□□□□ -0.83
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PDE4D-208ENST00000502484 NLRP10Q86W26 655 aa9.9□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 PROM2Q8N271 834 aa9.9□□□□□ -0.83
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PDE4D-208ENST00000502484 MED23Q9ULK4 1368 aa9.89□□□□□ -0.83
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PDE4D-208ENST00000502484 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 NECTIN1Q15223 517 aa9.88□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
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PDE4D-208ENST00000502484 MAP4K1Q92918 833 aa9.88□□□□□ -0.83
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PDE4D-208ENST00000502484 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 TAF1LQ8IZX4 1826 aa9.87□□□□□ -0.83
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