RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301886.3

ARL2-SNX15-201, Transcript of ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ARL2-SNX15, Length 2,392 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ANO10Q9NW15 660 aa26.59■■□□□ 1.85
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLC27A2O14975 620 aa26.58■■□□□ 1.85
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TMCO3Q6UWJ1 677 aa26.58■■□□□ 1.85
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EFCC1Q9HA90 598 aa26.58■■□□□ 1.85
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 STAG3Q9UJ98 1225 aa26.58■■□□□ 1.85
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EVI5LQ96CN4 794 aa26.57■■□□□ 1.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ECHDC1Q9NTX5 307 aa26.57■■□□□ 1.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.57■■□□□ 1.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RPS6KB1P23443 525 aa26.57■■□□□ 1.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SYT10Q6XYQ8 523 aa26.57■■□□□ 1.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MAP3K19Q56UN5 1328 aa26.57■■□□□ 1.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.57■■□□□ 1.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PEAK1Q9H792 1746 aa26.57■■□□□ 1.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NBPF11Q86T75 865 aa26.56■■□□□ 1.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa26.56■■□□□ 1.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NEK11Q8NG66 645 aa26.56■■□□□ 1.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GPATCH3Q96I76 525 aa26.56■■□□□ 1.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HIP1O00291 1037 aa26.55■■□□□ 1.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCDC150Q8NCX0 1101 aa26.55■■□□□ 1.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CEP57L1Q8IYX8 460 aa26.54■■□□□ 1.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SNRKQ9NRH2 765 aa26.54■■□□□ 1.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LRRC37A3O60309 1634 aa26.53■■□□□ 1.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RASSF4Q9H2L5 321 aa26.53■■□□□ 1.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa26.52■■□□□ 1.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 OVOS2Q6IE36 1432 aa26.52■■□□□ 1.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa26.52■■□□□ 1.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 UBXN4Q92575 508 aa26.52■■□□□ 1.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MYH15Q9Y2K3 1946 aa26.52■■□□□ 1.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BRF1Q92994 677 aa26.51■■□□□ 1.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GPS2Q13227 327 aa26.51■■□□□ 1.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRBA2Q6ZNG9 492 aa26.51■■□□□ 1.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa26.51■■□□□ 1.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 AOPEPQ8N6M6 819 aa26.51■■□□□ 1.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SMARCE1Q969G3 411 aa26.51■■□□□ 1.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TCEANC2Q96MN5 208 aa26.51■■□□□ 1.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RCOR1Q9UKL0 485 aa26.51■■□□□ 1.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 H3BQV1 296 aa26.5■■□□□ 1.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NRDCO43847 1150 aa26.5■■□□□ 1.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 STK3Q13188 491 aa26.5■■□□□ 1.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IFFO2Q5TF58 517 aa26.5■■□□□ 1.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KINO60870 393 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TPM1P09493 284 aa26.5■■□□□ 1.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KDRP35968 1356 aa26.5■■□□□ 1.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TADA3O75528 432 aa26.49■■□□□ 1.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ETF1P62495 437 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ST5P78524 1137 aa26.49■■□□□ 1.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ARMCX5Q6P1M9 558 aa26.49■■□□□ 1.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FAM227BQ96M60 508 aa26.49■■□□□ 1.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCP110O43303 1012 aa26.48■■□□□ 1.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 JAK2O60674 1132 aa26.48■■□□□ 1.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TSGA10IPQ3SY00 556 aa26.48■■□□□ 1.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa26.48■■□□□ 1.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BABAM1Q9NWV8 329 aa26.48■■□□□ 1.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP26.48■■□□□ 1.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCDC158Q5M9N0 1113 aa26.48■■□□□ 1.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HMG20BQ9P0W2 317 aa26.48■■□□□ 1.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ADD1P35611 737 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NALCNQ8IZF0 1738 aa26.47■■□□□ 1.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EFCAB8A8MWE9 144 aa26.47■■□□□ 1.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FAM160A1Q05DH4 1040 aa26.47■■□□□ 1.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ENGASEQ8NFI3 743 aa26.47■■□□□ 1.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RSPH14Q9UHP6 348 aa26.47■■□□□ 1.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TBC1D8O95759 1140 aa26.46■■□□□ 1.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZSCAN26Q16670 478 aa26.46■■□□□ 1.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 USP31Q70CQ4 1352 aa26.46■■□□□ 1.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RAPGEF3O95398 923 aa26.46■■□□□ 1.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 OAS2P29728 719 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa26.46■■□□□ 1.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HOMER1Q86YM7 354 aa26.46■■□□□ 1.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ERC1Q8IUD2 1116 aa26.46■■□□□ 1.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DDX11Q96FC9 970 aa26.46■■□□□ 1.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CHMP4AQ9BY43 222 aa26.46■■□□□ 1.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PSD3Q9NYI0 1048 aa26.46■■□□□ 1.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MYO1CO00159 1063 aa26.45■■□□□ 1.82
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NOP2P46087 812 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MTX1Q13505 466 aa26.45■■□□□ 1.82
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MNS1Q8NEH6 495 aa26.45■■□□□ 1.82
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GNAT3A8MTJ3 354 aa26.44■■□□□ 1.82
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.5 ms