RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416651.5

NIF3L1-206, Transcript of NGG1 interacting factor 3 like 1, human

TSL 2 BASIC

Gene NIF3L1, Length 967 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NIF3L1-206	ENST00000416651	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	CDK20	Q8IZL9	346 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF527	Q8NB42	609 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	7.45	□□□□□ -1.22	8e-7	■■■■■ 37.1
NIF3L1-206	ENST00000416651	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	MUS81	Q96NY9	551 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	TBL1XR1	Q9BZK7	514 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	RACGAP1	Q9H0H5	632 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	PLK3	Q9H4B4	646 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	OPN4	Q9UHM6	478 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	C7orf72	A4D263	438 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	PDLIM1	O00151	329 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	FOXE1	O00358	373 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	RGS14	O43566	566 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	SEMA3D	O95025	777 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	PNP	P00491	289 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	HPX	P02790	462 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	IL3	P08700	152 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	TUBA1B	P68363	451 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	TUBA4A	P68366	448 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	HGFAC	Q04756	655 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	KCNMB1	Q16558	191 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	CBLN3	Q6UW01	205 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM107	Q6UX40	140 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	TUBA1A	Q71U36	451 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	CMC1	Q7Z7K0	106 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	FBXO30	Q8TB52	745 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	YIPF5	Q969M3	257 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	JMJD8	Q96S16	334 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	SERPINI1	Q99574	410 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	DOK1	Q99704	481 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	IPPK	Q9H8X2	491 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	FKRP	Q9H9S5	495 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	CA10	Q9NS85	328 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF780B	Q9Y6R6	833 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651		A0A087WZY1	265 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651		B9A039	149 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651		G3V4G9	280 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	UPK1A	O00322	258 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	PLOD3	O60568	738 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	CYTIP	O60759	359 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	PRSS23	O95084	383 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	BCL10	O95999	233 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	FSHB	P01225	129 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	CELA3B	P08861	270 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	GABRA3	P34903	492 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	THBS4	P35443	961 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	PPOX	P50336	477 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	IL1RL1	Q01638	556 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	MGAT5	Q09328	741 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	IKZF1	Q13422	519 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	GTF2H2	Q13888	395 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	ADRM1	Q16186	407 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	DECR1	Q16698	335 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZFP90	Q8TF47	636 aa		7.43	□□□□□ -1.22

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