RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373779.7

PTPRU-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,579 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-202ENST00000373779 FBXO45P0C2W1 286 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 AKAIN1P0CW23 69 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 CREB3L2Q70SY1 520 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 GDF7Q7Z4P5 450 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF683Q8IZ20 524 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 OR5T3Q8NGG3 340 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 HMGN4O00479 90 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 RDH16O75452 317 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 ETHE1O95571 254 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 LTB4RQ15722 352 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF542PQ5EBM4 170 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 TMEM150AQ86TG1 271 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 LAS2Q8IYD9 372 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 C1GALT1Q9NS00 363 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 SERTAD3Q9UJW9 196 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 ARRDC5A6NEK1 342 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 SGK494L7N484 410 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 PEX14O75381 377 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 RORAP35398 523 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 VAMP2P63027 116 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 GRM7Q14831 915 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF283Q8N7M2 679 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 GHSRQ92847 366 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 NEDD4LQ96PU5 975 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 PDE7BQ9NP56 450 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 CAPZA1P52907 286 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 TNFRSF17Q02223 184 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 ELOCQ15369 112 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 APOOLQ6UXV4 268 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 OR6N1Q8NGY5 312 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 UBL3O95164 117 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 P2RY2P41231 377 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 CST9Q5W186 159 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 ABCG4Q9H172 646 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 KCMF1Q9P0J7 381 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 CDHR4A6H8M9 788 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 RAB3DO95716 219 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 AKR1C4P17516 323 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 RACK1P63244 317 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 ELP2Q6IA86 826 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 TCEAL6Q6IPX3 200 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 OR2S2Q9NQN1 319 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF337Q9Y3M9 751 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 TCRBP04435 133 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 RPE65Q16518 533 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 MFFQ9GZY8 342 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 DOCK5Q9H7D0 1870 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 GPRIN2O60269 458 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 LGI1O95970 557 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 RAB40ALP0C0E4 278 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 DLX5P56178 289 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 CSNK1G2P78368 415 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF750Q32MQ0 723 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 FCRLAQ7L513 359 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 PLPP6Q8IY26 295 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 OR4M1Q8NGD0 313 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 RAB40AQ8WXH6 277 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 ELP4Q96EB1 424 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 ZDHHC12Q96GR4 267 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 CLDND1Q9NY35 253 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 H3BNC9 293 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 TIMP1P01033 207 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 SFTPBP07988 381 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 SPNP16150 400 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 HLA-DMAP28067 261 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 GDNFP39905 211 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 PDX1P52945 283 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 HHEXQ03014 270 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 SELENBP1Q13228 472 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 DUSP6Q16828 381 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 GPAT4Q86UL3 456 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 SLC35F3Q8IY50 421 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 TGM7Q96PF1 710 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 SEMA4GQ9NTN9 838 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 P2RY14Q15391 338 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 ACSM5Q6NUN0 579 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 GSG1LQ6UXU4 331 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF281Q9Y2X9 895 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 HTR3AP46098 478 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 TSC22D1Q15714 1073 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRU-202ENST00000373779 CHRFAM7AQ494W8 412 aa16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.1 ms