RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471023.1

NOP56-211, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 2

Gene NOP56, Length 592 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-211ENST00000471023 TM9SF2Q99805 663 aa6.77□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 SLC39A3Q9BRY0 314 aa6.77□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 ASPNQ9BXN1 380 aa6.77□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.77□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 SLC38A1Q9H2H9 487 aa6.77□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 RMND5AQ9H871 391 aa6.77□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa6.77□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 GALNT9Q9HCQ5 603 aa6.77□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 Q9N2J8 555 aa6.77□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 KLHL1Q9NR64 748 aa6.77□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 ARL8BQ9NVJ2 186 aa6.77□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 CNIH4Q9P003 139 aa6.77□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 CAPN7Q9Y6W3 813 aa6.77□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 OTOGQ6ZRI0 2925 aa6.77□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 PCNX1Q96RV3 2341 aa6.77□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 F8P00451 2351 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 SHISA3A0PJX4 238 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 PRAMEF25A6NGN4 478 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 ALG1L2C9J202 215 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 NPIPA7E9PJI5 369 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 PRRG2O14669 202 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 KIAA0513O60268 411 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 REM1O75628 298 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 UGT2B17O75795 530 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 UTS2O95399 124 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 CLDN14O95500 239 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 EPPINO95925 133 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 NPIPA8P0DM63 369 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 PRF1P14222 555 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 TBXA2RP21731 343 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 PRDX6P30041 224 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 LCN1P31025 176 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 RFC3P40938 356 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 GP2P55259 537 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 CHRNEQ04844 493 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 SNTA1Q13424 505 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 EFR3AQ14156 821 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 CD226Q15762 336 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 ZNF141Q15928 474 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 SPDYE7PQ495Y7 208 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 CMPK2Q5EBM0 449 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 RABL3Q5HYI8 236 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 PRAMEF20Q5VT98 475 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 NANOGP8Q6NSW7 305 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 HACD2Q6Y1H2 254 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 DHDDSQ86SQ9 333 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 COMTD1Q86VU5 262 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 TMEM251Q8N6I4 163 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 FAM71CQ8NEG0 241 aa6.76□□□□□ -1.33
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NOP56-211ENST00000471023 ADAMTS15Q8TE58 950 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 SLC38A5Q8WUX1 472 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 TMEM125Q96AQ2 219 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 ROPN1LQ96C74 230 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 LRRC58Q96CX6 371 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 RCN3Q96D15 328 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 C14orf79Q96F83 325 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 MISP3Q96FF7 219 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 TMEM41AQ96HV5 264 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 ZNF583Q96ND8 569 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 NPAS1Q99742 590 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 FAM173AQ9BQD7 235 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 TTTY12Q9BZ98 90 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 NANOGQ9H9S0 305 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 A4GALTQ9NPC4 353 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 SACM1LQ9NTJ5 587 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 CMTM6Q9NX76 183 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 PCDHGB4Q9UN71 923 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 USP22Q9UPT9 525 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 ZNF835Q9Y2P0 537 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 CSMD1Q96PZ7 3565 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 SPG11Q96JI7 2443 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 GTF3C1Q12789 2109 aa6.76□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 A0A1B0GVC2 190 aa6.75□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 A0A1W2PQD3 144 aa6.75□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 BBIP1A8MTZ0 92 aa6.75□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 E9PLN8 166 aa6.75□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 MRASO14807 208 aa6.75□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 ZIC3O60481 467 aa6.75□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 SOX30O94993 753 aa6.75□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 KCNH1O95259 989 aa6.75□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 KRT75O95678 551 aa6.75□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 IGHG3P01860 377 aa6.75□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 KRT16P08779 473 aa6.75□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 EVI2BP34910 448 aa6.75□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 CPOXP36551 454 aa6.75□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 KHKP50053 298 aa6.75□□□□□ -1.33
NOP56-211ENST00000471023 ATP12AP54707 1039 aa6.75□□□□□ -1.33
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