RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258148.11

MDM2-201, Transcript of MDM2 proto-oncogene, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MDM2, Length 1,361 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2-201ENST00000258148 NT5MQ9NPB1 228 aa5.1□□□□□ -1.59
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MDM2-201ENST00000258148 PITPNC1Q9UKF7 332 aa5.1□□□□□ -1.59
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MDM2-201ENST00000258148 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa5.09□□□□□ -1.59
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MDM2-201ENST00000258148 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
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MDM2-201ENST00000258148 MSR1P21757 451 aa5.08□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP5.08□□□□□ -1.64e-10■■□□□ 13
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MDM2-201ENST00000258148 GYG1P46976 350 aa5.08□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
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MDM2-201ENST00000258148 RAB35Q15286 201 aa5.08□□□□□ -1.6
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MDM2-201ENST00000258148 ENPP6Q6UWR7 440 aa5.08□□□□□ -1.6
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MDM2-201ENST00000258148 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
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MDM2-201ENST00000258148 C19orf43Q9BQ61 176 aa5.08□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa5.08□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 LYRM4Q9HD34 91 aa5.08□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 PTTG3PQ9NZH4 202 aa5.08□□□□□ -1.6
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