RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586667.1

DNMT1-208, Transcript of DNA methyltransferase 1, human

TSL 2

Gene DNMT1, Length 714 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DNMT1-208	ENST00000586667	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	TM9SF4	Q92544	642 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	FIG4	Q92562	907 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF524	Q96C55	264 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	TMCO6	Q96DC7	493 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	ARSG	Q96EG1	525 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	WFDC6	Q9BQY6	131 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	RLIM	Q9NVW2	624 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	CNIH4	Q9P003	139 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	NCKAP5	O14513	1909 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	C2orf72	A6NCS6	295 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	ERICH4	A6NGS2	130 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667		M0QX08	132 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	SCD	O00767	359 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	SNPH	O15079	494 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	ANGPTL1	O95841	491 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	ADH7	P40394	386 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	DUSP7	Q16829	419 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	NADK2	Q4G0N4	442 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	LIN52	Q52LA3	116 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF766	Q5HY98	468 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	SLC25A25	Q6KCM7	469 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	CBLN3	Q6UW01	205 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	SULF2	Q8IWU5	870 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	FADS6	Q8N9I5	356 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	SMYD1	Q8NB12	490 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	OR2M7	Q8NG81	312 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	SLC39A7	Q92504	469 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	TBL1XR1	Q9BZK7	514 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	11.49	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	MUC13	Q9H3R2	512 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	GORASP2	Q9H8Y8	452 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	KLHL1	Q9NR64	748 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	POMP	Q9Y244	141 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	FRS3	O43559	492 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	PDE9A	O76083	593 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	SERPINA1	P01009	418 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	SEMG1	P04279	462 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	UBL4A	P11441	157 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	CD46	P15529	392 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	MST1	P26927	711 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	KCNJ5	P48544	419 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	PMP22	Q01453	160 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	NPTX1	Q15818	432 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	GLYAT	Q6IB77	296 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	SLC30A6	Q6NXT4	461 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	KRT73	Q86Y46	540 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	LACC1	Q8IV20	430 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	CMIP	Q8IY22	773 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF614	Q8N883	585 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF527	Q8NB42	609 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	ZFP62	Q8NB50	900 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	OR4D11	Q8NGI4	311 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	C5orf34	Q96MH7	638 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF607	Q96SK3	696 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	ARHGDIG	Q99819	225 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	DOHH	Q9BU89	302 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	UBQLN3	Q9H347	655 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	OLAH	Q9NV23	265 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	SEC14L3	Q9UDX4	400 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	FBXL2	Q9UKC9	423 aa		11.48	□□□□□ -0.57

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