RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
PTX4-201ENST00000293922 CIB2O75838 187 aa16.7■□□□□ 0.26
PTX4-201ENST00000293922 NADKO95544 446 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
PTX4-201ENST00000293922 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa16.7■□□□□ 0.26
PTX4-201ENST00000293922 NCK1P16333 377 aa16.7■□□□□ 0.26
PTX4-201ENST00000293922 COL8A1P27658 744 aa16.7■□□□□ 0.26
PTX4-201ENST00000293922 HPCAP84074 193 aa16.7■□□□□ 0.26
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PTX4-201ENST00000293922 SLC34A3Q8N130 599 aa16.7■□□□□ 0.26
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PTX4-201ENST00000293922 OR2M7Q8NG81 312 aa16.68■□□□□ 0.26
PTX4-201ENST00000293922 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
PTX4-201ENST00000293922 FAM162AQ96A26 154 aa16.68■□□□□ 0.26
PTX4-201ENST00000293922 SGCZQ96LD1 299 aa16.68■□□□□ 0.26
PTX4-201ENST00000293922 ZNF607Q96SK3 696 aa16.68■□□□□ 0.26
PTX4-201ENST00000293922 TRIM15Q9C019 465 aa16.68■□□□□ 0.26
PTX4-201ENST00000293922 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
PTX4-201ENST00000293922 MKLN1Q9UL63 735 aa16.68■□□□□ 0.26
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