RNA–Protein interactions for RNA: YHR140W

YHR140W, Transcript of Putative integral membrane protein of unknown function, yeastyeast

Gene YHR140W, Length 720 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR140WYHR140W DPH6Q12429 685 aa7.34□□□□□ -1.23
YHR140WYHR140W SNQ2P32568 1501 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
YHR140WYHR140W COQ4O13525 335 aa7.33□□□□□ -1.24
YHR140WYHR140W PER1P25625 357 aa7.33□□□□□ -1.24
YHR140WYHR140W STO1P34160 861 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
YHR140WYHR140W SBE2P42223 864 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
YHR140WYHR140W GYP7P48365 746 aa7.33□□□□□ -1.24
YHR140WYHR140W DAM1P53267 343 aa7.33□□□□□ -1.24
YHR140WYHR140W HFD1Q04458 532 aa7.33□□□□□ -1.24
YHR140WYHR140W THS1P04801 734 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
YHR140WYHR140W EUG1P32474 517 aa7.32□□□□□ -1.24
YHR140WYHR140W GIC1P38785 314 aa7.32□□□□□ -1.24
YHR140WYHR140W YER158CP40095 573 aa7.32□□□□□ -1.24
YHR140WYHR140W CAF16P43569 289 aa7.32□□□□□ -1.24
YHR140WYHR140W YJR096WP47137 282 aa7.32□□□□□ -1.24
YHR140WYHR140W MTC3P53077 123 aa7.32□□□□□ -1.24
YHR140WYHR140W YNR014WP53719 212 aa7.32□□□□□ -1.24
YHR140WYHR140W ATP25Q03153 612 aa7.32□□□□□ -1.24
YHR140WYHR140W YEL1P34225 687 aa7.31□□□□□ -1.24
YHR140WYHR140W PMC1P38929 1173 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
YHR140WYHR140W SFB2P53953 876 aa7.31□□□□□ -1.24
YHR140WYHR140W COG6P53959 839 aa7.31□□□□□ -1.24
YHR140WYHR140W YLL058WQ12198 575 aa7.31□□□□□ -1.24
YHR140WYHR140W PRP19P32523 503 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
YHR140WYHR140W MCD4P36051 919 aa7.3□□□□□ -1.24
YHR140WYHR140W YKR078WP36158 585 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
YHR140WYHR140W YBR071WP38243 211 aa7.3□□□□□ -1.24
YHR140WYHR140W NIT3P49954 291 aa7.3□□□□□ -1.24
YHR140WYHR140W AIM14P53109 570 aa7.3□□□□□ -1.24
YHR140WYHR140W BUD9P53226 547 aa7.3□□□□□ -1.24
YHR140WYHR140W SND1Q04007 877 aa7.3□□□□□ -1.24
YHR140WYHR140W YDR514CQ04408 483 aa7.3□□□□□ -1.24
YHR140WYHR140W GUD1Q07729 489 aa7.3□□□□□ -1.24
YHR140WYHR140W TMA7Q3E764 64 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
YHR140WYHR140W NUP170P38181 1502 aa7.3□□□□□ -1.24
YHR140WYHR140W PDR12Q02785 1511 aa7.3□□□□□ -1.24
YHR140WYHR140W DNF2Q12675 1612 aa7.3□□□□□ -1.24
YHR140WYHR140W CDC48P25694 835 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
YHR140WYHR140W PIK1P39104 1066 aa7.29□□□□□ -1.24
YHR140WYHR140W YGR035CP53222 116 aa7.29□□□□□ -1.24
YHR140WYHR140W SRT1Q03175 343 aa7.29□□□□□ -1.24
YHR140WYHR140W RSC6P25632 483 aa7.28□□□□□ -1.24
YHR140WYHR140W SFA1P32771 386 aa7.28□□□□□ -1.24
YHR140WYHR140W PCM1P38628 557 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
YHR140WYHR140W YHL012WP38709 493 aa7.28□□□□□ -1.24
YHR140WYHR140W YPR196WQ06595 470 aa7.28□□□□□ -1.24
YHR140WYHR140W TRE2Q08693 809 aa7.28□□□□□ -1.24
YHR140WYHR140W SLX4Q12098 748 aa7.28□□□□□ -1.24
YHR140WYHR140W STH1P32597 1359 aa7.28□□□□□ -1.24
YHR140WYHR140W MPH2P0CD99 609 aa7.27□□□□□ -1.25
YHR140WYHR140W HMG1P12683 1054 aa7.27□□□□□ -1.25
YHR140WYHR140W HOG1P32485 435 aa7.27□□□□□ -1.25
YHR140WYHR140W WHI3P34761 661 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
YHR140WYHR140W CCZ1P38273 704 aa7.27□□□□□ -1.25
YHR140WYHR140W YKE2P52553 114 aa7.27□□□□□ -1.25
YHR140WYHR140W SNP1Q00916 300 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
YHR140WYHR140W ATG33Q06485 197 aa7.27□□□□□ -1.25
YHR140WYHR140W SPO14P36126 1683 aa7.27□□□□□ -1.25
YHR140WYHR140W SAM35P14693 329 aa7.26□□□□□ -1.25
YHR140WYHR140W FUN30P31380 1131 aa7.26□□□□□ -1.25
YHR140WYHR140W CKB2P38930 258 aa7.26□□□□□ -1.25
YHR140WYHR140W PEX14P53112 341 aa7.26□□□□□ -1.25
YHR140WYHR140W YOR378WQ08902 515 aa7.26□□□□□ -1.25
YHR140WYHR140W GIN4Q12263 1142 aa7.26□□□□□ -1.25
YHR140WYHR140W YVC1Q12324 675 aa7.26□□□□□ -1.25
YHR140WYHR140W TRM3Q07527 1436 aa7.26□□□□□ -1.25
YHR140WYHR140W DAL7P21826 554 aa7.25□□□□□ -1.25
YHR140WYHR140W NAM7P30771 971 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
YHR140WYHR140W TFC4P33339 1025 aa7.25□□□□□ -1.25
YHR140WYHR140W DAS1P47005 663 aa7.25□□□□□ -1.25
YHR140WYHR140W HFM1P51979 1187 aa7.25□□□□□ -1.25
YHR140WYHR140W TAD1P53065 400 aa7.25□□□□□ -1.25
YHR140WYHR140W REH1Q06709 432 aa7.25□□□□□ -1.25
YHR140WYHR140W RSB1Q08417 382 aa7.25□□□□□ -1.25
YHR140WYHR140W AI1P03875 834 aa7.24□□□□□ -1.25
YHR140WYHR140W AI3P03877 415 aa7.24□□□□□ -1.25
YHR140WYHR140W ACE2P21192 770 aa7.24□□□□□ -1.25
YHR140WYHR140W YCL002CP25565 263 aa7.24□□□□□ -1.25
YHR140WYHR140W TRK2P28584 889 aa7.24□□□□□ -1.25
YHR140WYHR140W PLC1P32383 869 aa7.24□□□□□ -1.25
YHR140WYHR140W SWE1P32944 819 aa7.24□□□□□ -1.25
YHR140WYHR140W AKR1P39010 764 aa7.24□□□□□ -1.25
YHR140WYHR140W RRT14P40470 206 aa7.24□□□□□ -1.25
YHR140WYHR140W ALY2P47029 1046 aa7.24□□□□□ -1.25
YHR140WYHR140W PRY1P47032 299 aa7.24□□□□□ -1.25
YHR140WYHR140W SDH1Q00711 640 aa7.24□□□□□ -1.25
YHR140WYHR140W COG8Q04632 607 aa7.24□□□□□ -1.25
YHR140WYHR140W GUP2Q08929 609 aa7.24□□□□□ -1.25
YHR140WYHR140W MPD2Q99316 277 aa7.24□□□□□ -1.25
YHR140WYHR140W ULS1Q08562 1619 aa7.23□□□□□ -1.25
YHR140WYHR140W RFA1P22336 621 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
YHR140WYHR140W OAF1P39720 1047 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
YHR140WYHR140W YNL034WP53963 612 aa7.23□□□□□ -1.25
YHR140WYHR140W YNL018CP53976 612 aa7.23□□□□□ -1.25
YHR140WYHR140W TGL2P54857 326 aa7.23□□□□□ -1.25
YHR140WYHR140W MAP1Q01662 387 aaKnown RBP RIP-Chip data7.23□□□□□ -1.25not detected
YHR140WYHR140W LRS4Q04087 347 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
YHR140WYHR140W RSC58Q07979 502 aa7.23□□□□□ -1.25
YHR140WYHR140W XYL2Q07993 356 aa7.23□□□□□ -1.25
YHR140WYHR140W YTM1Q12024 460 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.7 ms