RNA–Protein interactions for RNA: YDR063W

AIM7, Transcript of Protein that interacts with Arp2/3 complex, yeast

Gene AIM7, Length 450 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AIM7	YDR063W	UFD2	P54860	961 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	SSY1	Q03770	852 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	RIM20	Q12033	661 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	RIT1	P23796	513 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	UTR4	P32626	227 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	BCS1	P32839	456 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	MAL31	P38156	614 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	CSM2	P40465	213 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	HXT17	P53631	564 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	ECM29	P38737	1868 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	EUG1	P32474	517 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	MYO3	P36006	1272 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	PEX7	P39108	375 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	VPS8	P39702	1274 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	VAB2	P40003	282 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	VPS62	P53285	467 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	YVC1	Q12324	675 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	TUS1	Q06412	1307 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	RAD18	P10862	487 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	RPB10	P22139	70 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	ANP1	P32629	500 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	GEF1	P37020	779 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	BRN1	P38170	754 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	HXT13	P39924	564 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	MRPL22	P53881	309 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	YOR131C	Q12486	218 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
AIM7	YDR063W	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
AIM7	YDR063W	OPI1	P21957	404 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	NPR1	P22211	790 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	PRO1	P32264	428 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	IMP2'	P32351	346 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	TGL1	P34163	548 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	VPS30	Q02948	557 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	SLD5	Q03406	294 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	TY3A-G	Q12173	290 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	SUT2	Q12286	268 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	TY3A-I	Q99219	290 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	SOD2	P00447	233 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	PER1	P25625	357 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	YUR1	P26725	428 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	RER2	P35196	286 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	NNK1	P36003	928 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	RIM11	P38615	370 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	FOL1	P53848	824 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	CTR9	P89105	1077 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	TFC6	Q06339	672 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	RKM4	Q12504	494 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	RAD50	P12753	1312 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	TAO3	P40468	2376 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	HIP1	P06775	603 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	NUC1	P08466	329 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	NFS1	P25374	497 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	YMR321C	Q04898	105 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	ICL2	Q12031	575 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	ERP3	Q12403	225 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	YOR111W	Q99210	232 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	MAK31	P23059	88 aa		4.84	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	UIP5	P36137	443 aa		4.84	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	VPS45	P38932	577 aa		4.84	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	YJR107W	P47145	328 aa		4.84	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	SOL4	P53315	255 aa		4.84	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	EAR1	Q03212	550 aa		4.84	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	MET7	Q08645	548 aa		4.84	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
AIM7	YDR063W	MYO1	P08964	1928 aa		4.84	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 22.5 ms