RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-212ENST00000491266 USP17L10C9JJH3 530 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 USP17L13C9JLJ4 530 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 USP17L12C9JPN9 530 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 USP17L11C9JVI0 530 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 USP17L21D6R901 530 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 USP17L18D6R9N7 530 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 USP17L22D6RA61 530 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 USP17L17D6RBQ6 530 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 USP17L19D6RCP7 530 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 USP17L20D6RJB6 530 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 CLDN10P78369 228 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 USP17L24Q0WX57 530 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 FOXC1Q12948 553 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 USP4Q13107 963 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 OXLD1Q5BKU9 147 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 TRIM50Q86XT4 487 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 SIRT1Q96EB6 747 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 TRAIPQ9BWF2 469 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 CCDC7Q96M83 1385 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 TMEM88BA6NKF7 163 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 LILRA1O75019 489 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 KCNA6P17658 529 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 SCTRP47872 440 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 PRAM1Q96QH2 718 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 TECPR2O15040 1411 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 ATP1A2P50993 1020 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-212ENST00000491266 RAB15P59190 212 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-212ENST00000491266 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-212ENST00000491266 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-212ENST00000491266 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-212ENST00000491266 SIX5Q8N196 739 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-212ENST00000491266 LARGE2Q8N3Y3 721 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-212ENST00000491266 OGFOD1Q8N543 542 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-212ENST00000491266 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-212ENST00000491266 KIAA1024Q9UPX6 916 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-212ENST00000491266 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-212ENST00000491266 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
RABGGTB-212ENST00000491266 ALDH1A1P00352 501 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGGTB-212ENST00000491266 RASA1P20936 1047 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGGTB-212ENST00000491266 GTF2IP78347 998 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGGTB-212ENST00000491266 NNTQ13423 1086 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGGTB-212ENST00000491266 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
RABGGTB-212ENST00000491266 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
RABGGTB-212ENST00000491266 OSBPL3Q9H4L5 887 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGGTB-212ENST00000491266 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
RABGGTB-212ENST00000491266 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGGTB-212ENST00000491266 STRCQ7RTU9 1775 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGGTB-212ENST00000491266 DLC1Q96QB1 1528 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGGTB-212ENST00000491266 J3QL48 77 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGGTB-212ENST00000491266 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGGTB-212ENST00000491266 ANKMY2Q8IV38 441 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGGTB-212ENST00000491266 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
RABGGTB-212ENST00000491266 TULP4Q9NRJ4 1543 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGGTB-212ENST00000491266 MYCP01106 439 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
RABGGTB-212ENST00000491266 SMPD1P17405 629 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGGTB-212ENST00000491266 PDE4CQ08493 712 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGGTB-212ENST00000491266 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
RABGGTB-212ENST00000491266 TMEM164Q5U3C3 297 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGGTB-212ENST00000491266 STK32AQ8WU08 396 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGGTB-212ENST00000491266 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGGTB-212ENST00000491266 FAM135BQ49AJ0 1406 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-212ENST00000491266 CPS1P31327 1500 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-212ENST00000491266 PIK3R4Q99570 1358 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-212ENST00000491266 TNFRSF10AO00220 468 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-212ENST00000491266 ADD1P35611 737 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-212ENST00000491266 MYT1Q01538 1121 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-212ENST00000491266 CYP4X1Q8N118 509 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-212ENST00000491266 CYLDQ9NQC7 956 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-212ENST00000491266 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-212ENST00000491266 WASF2Q9Y6W5 498 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-212ENST00000491266 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-212ENST00000491266 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-212ENST00000491266 PRR36Q9H6K5 1346 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-212ENST00000491266 DIP2AQ14689 1571 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-212ENST00000491266 WASLO00401 505 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-212ENST00000491266 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-212ENST00000491266 PTCH1Q13635 1447 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-212ENST00000491266 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-212ENST00000491266 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-212ENST00000491266 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-212ENST00000491266 DPYDQ12882 1025 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-212ENST00000491266 CCDC102BQ68D86 513 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-212ENST00000491266 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-212ENST00000491266 POGKQ9P215 609 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-212ENST00000491266 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-212ENST00000491266 TMEM229AB2RXF0 380 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-212ENST00000491266 M0R2N6 131 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-212ENST00000491266 TIMP2P16035 220 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-212ENST00000491266 SCNN1DP51172 638 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-212ENST00000491266 Q6ZVU0 165 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-212ENST00000491266 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-212ENST00000491266 TPCN2Q8NHX9 752 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-212ENST00000491266 FAM200AQ8TCP9 573 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-212ENST00000491266 ITPKCQ96DU7 683 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-212ENST00000491266 CDK19Q9BWU1 502 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-212ENST00000491266 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-212ENST00000491266 NWD1Q149M9 1564 aa8.51□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.2 ms