RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
STRADBP1-201ENST00000478954 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa8.7□□□□□ -1.02
STRADBP1-201ENST00000478954 VAMP1P23763 118 aa8.7□□□□□ -1.02
STRADBP1-201ENST00000478954 ASB16Q96NS5 453 aa8.7□□□□□ -1.02
STRADBP1-201ENST00000478954 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa8.7□□□□□ -1.02
STRADBP1-201ENST00000478954 CABP1Q9NZU7 370 aa8.7□□□□□ -1.02
STRADBP1-201ENST00000478954 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
STRADBP1-201ENST00000478954 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa8.7□□□□□ -1.02
STRADBP1-201ENST00000478954 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
STRADBP1-201ENST00000478954 WEE1P30291 646 aa8.69□□□□□ -1.02
STRADBP1-201ENST00000478954 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
STRADBP1-201ENST00000478954 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
STRADBP1-201ENST00000478954 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
STRADBP1-201ENST00000478954 DCTN4Q9UJW0 460 aa8.69□□□□□ -1.02
STRADBP1-201ENST00000478954 ABCC2Q92887 1545 aa8.69□□□□□ -1.02
STRADBP1-201ENST00000478954 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa8.69□□□□□ -1.02
STRADBP1-201ENST00000478954 TERTO14746 1132 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
STRADBP1-201ENST00000478954 WFS1O76024 890 aa8.68□□□□□ -1.02
STRADBP1-201ENST00000478954 RECKO95980 971 aa8.68□□□□□ -1.02
STRADBP1-201ENST00000478954 THBS1P07996 1170 aa8.68□□□□□ -1.02
STRADBP1-201ENST00000478954 ATP4AP20648 1035 aa8.68□□□□□ -1.02
STRADBP1-201ENST00000478954 TXLNAP40222 546 aa8.68□□□□□ -1.02
STRADBP1-201ENST00000478954 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP8.68□□□□□ -1.02
STRADBP1-201ENST00000478954 WDR44Q5JSH3 913 aa8.68□□□□□ -1.02
STRADBP1-201ENST00000478954 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
STRADBP1-201ENST00000478954 GPAMQ9HCL2 828 aa8.68□□□□□ -1.02
STRADBP1-201ENST00000478954 DYRK1BQ9Y463 629 aa8.68□□□□□ -1.02
STRADBP1-201ENST00000478954 ATAD2Q6PL18 1390 aa8.68□□□□□ -1.02
STRADBP1-201ENST00000478954 FHAD1B1AJZ9 1412 aa8.67□□□□□ -1.02
STRADBP1-201ENST00000478954 EML1O00423 815 aa8.67□□□□□ -1.02
STRADBP1-201ENST00000478954 ITGA6P23229 1130 aa8.67□□□□□ -1.02
STRADBP1-201ENST00000478954 TEAD4Q15561 434 aa8.67□□□□□ -1.02
STRADBP1-201ENST00000478954 POTEAQ6S8J7 498 aa8.67□□□□□ -1.02
STRADBP1-201ENST00000478954 LTBP4Q8N2S1 1624 aa8.67□□□□□ -1.02
STRADBP1-201ENST00000478954 KLRG1Q96E93 195 aa8.67□□□□□ -1.02
STRADBP1-201ENST00000478954 ERBB4Q15303 1308 aa8.66□□□□□ -1.02
STRADBP1-201ENST00000478954 H3BM21 787 aa8.66□□□□□ -1.02
STRADBP1-201ENST00000478954 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
STRADBP1-201ENST00000478954 MSX1P28360 303 aa8.66□□□□□ -1.02
STRADBP1-201ENST00000478954 NOS2P35228 1153 aa8.66□□□□□ -1.02
STRADBP1-201ENST00000478954 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
STRADBP1-201ENST00000478954 L3MBTL2Q969R5 705 aa8.66□□□□□ -1.02
STRADBP1-201ENST00000478954 IQSEC2Q5JU85 1478 aa8.65□□□□□ -1.02
STRADBP1-201ENST00000478954 A0A1B0GTH6 734 aa8.65□□□□□ -1.02
STRADBP1-201ENST00000478954 IGFBP4P22692 258 aa8.65□□□□□ -1.02
STRADBP1-201ENST00000478954 RUBCNLQ9H714 662 aa8.65□□□□□ -1.02
STRADBP1-201ENST00000478954 SERTM1A2A2V5 107 aa8.64□□□□□ -1.03
STRADBP1-201ENST00000478954 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
STRADBP1-201ENST00000478954 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
STRADBP1-201ENST00000478954 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa8.64□□□□□ -1.03
STRADBP1-201ENST00000478954 AIDAQ96BJ3 306 aa8.64□□□□□ -1.03
STRADBP1-201ENST00000478954 C8orf37Q96NL8 207 aa8.64□□□□□ -1.03
STRADBP1-201ENST00000478954 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF232Q9UNY5 417 aa8.64□□□□□ -1.03
STRADBP1-201ENST00000478954 F11P03951 625 aa8.63□□□□□ -1.03
STRADBP1-201ENST00000478954 DBN1Q16643 649 aa8.63□□□□□ -1.03
STRADBP1-201ENST00000478954 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
STRADBP1-201ENST00000478954 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa8.63□□□□□ -1.03
STRADBP1-201ENST00000478954 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
STRADBP1-201ENST00000478954 COL19A1Q14993 1142 aa8.62□□□□□ -1.03
STRADBP1-201ENST00000478954 NPAS3Q8IXF0 933 aa8.62□□□□□ -1.03
STRADBP1-201ENST00000478954 RGL4Q8IZJ4 473 aa8.62□□□□□ -1.03
STRADBP1-201ENST00000478954 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
STRADBP1-201ENST00000478954 C7orf43Q8WVR3 580 aa8.62□□□□□ -1.03
STRADBP1-201ENST00000478954 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa8.62□□□□□ -1.03
STRADBP1-201ENST00000478954 CDC14CA4D256 554 aa8.61□□□□□ -1.03
STRADBP1-201ENST00000478954 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
STRADBP1-201ENST00000478954 NBPF1Q3BBV0 1214 aa8.61□□□□□ -1.03
STRADBP1-201ENST00000478954 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
STRADBP1-201ENST00000478954 VWA5B2Q8N398 1253 aa8.61□□□□□ -1.03
STRADBP1-201ENST00000478954 STAG2Q8N3U4 1231 aa8.61□□□□□ -1.03
STRADBP1-201ENST00000478954 PHACTR1Q9C0D0 580 aa8.61□□□□□ -1.03
STRADBP1-201ENST00000478954 YEATS2Q9ULM3 1422 aa8.61□□□□□ -1.03
STRADBP1-201ENST00000478954 P4HBP07237 508 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
STRADBP1-201ENST00000478954 NPR3P17342 541 aa8.6□□□□□ -1.03
STRADBP1-201ENST00000478954 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
STRADBP1-201ENST00000478954 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa8.6□□□□□ -1.03
STRADBP1-201ENST00000478954 TRIM22Q8IYM9 498 aa8.6□□□□□ -1.03
STRADBP1-201ENST00000478954 HELQQ8TDG4 1101 aa8.6□□□□□ -1.03
STRADBP1-201ENST00000478954 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
STRADBP1-201ENST00000478954 COL26A1Q96A83 441 aa8.6□□□□□ -1.03
STRADBP1-201ENST00000478954 NGLY1Q96IV0 654 aa8.6□□□□□ -1.03
STRADBP1-201ENST00000478954 ZIC5Q96T25 663 aa8.6□□□□□ -1.03
STRADBP1-201ENST00000478954 CRISPLD1Q9H336 500 aa8.6□□□□□ -1.03
STRADBP1-201ENST00000478954 FOXO3O43524 673 aa8.59□□□□□ -1.03
STRADBP1-201ENST00000478954 VSIG8P0DPA2 414 aa8.59□□□□□ -1.03
STRADBP1-201ENST00000478954 TMC7Q7Z402 723 aa8.59□□□□□ -1.03
STRADBP1-201ENST00000478954 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa8.59□□□□□ -1.03
STRADBP1-201ENST00000478954 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
STRADBP1-201ENST00000478954 DRC1Q96MC2 740 aa8.59□□□□□ -1.03
STRADBP1-201ENST00000478954 BACH2Q9BYV9 841 aa8.59□□□□□ -1.03
STRADBP1-201ENST00000478954 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa8.59□□□□□ -1.03
STRADBP1-201ENST00000478954 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa8.59□□□□□ -1.03
STRADBP1-201ENST00000478954 CFAP43Q8NDM7 1665 aa8.59□□□□□ -1.03
STRADBP1-201ENST00000478954 PREX1Q8TCU6 1659 aa8.59□□□□□ -1.03
STRADBP1-201ENST00000478954 PTPRGP23470 1445 aa8.58□□□□□ -1.04
STRADBP1-201ENST00000478954 GPR25O00155 361 aa8.58□□□□□ -1.04
STRADBP1-201ENST00000478954 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
STRADBP1-201ENST00000478954 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
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