RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469376.5

OPN3-204, Transcript of opsin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene OPN3, Length 1,961 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-204ENST00000469376 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa31.15■■■□□ 2.58
OPN3-204ENST00000469376 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa31.15■■■□□ 2.58
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OPN3-204ENST00000469376 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa31.15■■■□□ 2.58
OPN3-204ENST00000469376 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa31.15■■■□□ 2.58
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OPN3-204ENST00000469376 UBE2HP62256 183 aa30.98■■■□□ 2.55
OPN3-204ENST00000469376 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP30.98■■■□□ 2.55
OPN3-204ENST00000469376 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP30.98■■■□□ 2.55
OPN3-204ENST00000469376 KAZALD1Q96I82 304 aa30.97■■■□□ 2.55
OPN3-204ENST00000469376 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP30.97■■■□□ 2.55
OPN3-204ENST00000469376 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP30.97■■■□□ 2.55
OPN3-204ENST00000469376 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa30.97■■■□□ 2.55
OPN3-204ENST00000469376 SASH1O94885 1247 aa30.97■■■□□ 2.55
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