RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
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RABGEF1-206ENST00000461017 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-206ENST00000461017 MIER1Q8N108 512 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-206ENST00000461017 BRIP1Q9BX63 1249 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-206ENST00000461017 PIM2Q9P1W9 311 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-206ENST00000461017 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
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RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
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RABGEF1-206ENST00000461017 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
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RABGEF1-206ENST00000461017 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
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RABGEF1-206ENST00000461017 COL4A5P29400 1685 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-206ENST00000461017 FLIIQ13045 1269 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-206ENST00000461017 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-206ENST00000461017 RNF181Q9P0P0 153 aa9.02□□□□□ -0.97
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