RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP34.22■■■■□ 3.07
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLRG1Q96E93 195 aa34.2■■■■□ 3.07
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP34.19■■■■□ 3.06
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRT24Q2M2I5 525 aa34.19■■■■□ 3.06
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa34.19■■■■□ 3.06
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COPS6Q7L5N1 327 aa34.19■■■■□ 3.06
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SYNE4Q8N205 404 aa34.19■■■■□ 3.06
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 XAGE3Q8WTP9 111 aa34.18■■■■□ 3.06
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP34.18■■■■□ 3.06
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP34.18■■■■□ 3.06
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP34.18■■■■□ 3.06
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IARSP41252 1262 aaKnown RBP34.17■■■■□ 3.06
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa34.17■■■■□ 3.06
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CRAMP1Q96RY5 1269 aa34.17■■■■□ 3.06
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PSMD1Q99460 953 aa34.16■■■■□ 3.06
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SNED1Q8TER0 1413 aa34.15■■■■□ 3.06
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IQCA1LA6NCM1 817 aa34.15■■■■□ 3.06
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C3orf67Q6ZVT6 689 aa34.15■■■■□ 3.06
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP34.15■■■■□ 3.06
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NLRP3Q96P20 1036 aa34.15■■■■□ 3.06
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF541Q9H0D2 1346 aa34.14■■■■□ 3.06
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa34.13■■■■□ 3.05
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RNF123Q5XPI4 1314 aa34.13■■■■□ 3.05
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC10A5Q5PT55 438 aa34.13■■■■□ 3.05
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP34.12■■■■□ 3.05
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HOXB7P09629 217 aa34.12■■■■□ 3.05
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GRIPAP1Q4V328 841 aa34.12■■■■□ 3.05
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa34.12■■■■□ 3.05
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHADLQ6NUI6 762 aa34.12■■■■□ 3.05
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CFAP44Q96MT7 982 aa34.12■■■■□ 3.05
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHPF2Q9P2E5 772 aa34.12■■■■□ 3.05
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NLRP10Q86W26 655 aa34.11■■■■□ 3.05
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SCN4AP35499 1836 aa34.11■■■■□ 3.05
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TCIRG1Q13488 830 aa34.1■■■■□ 3.05
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 JDP2Q8WYK2 163 aa34.1■■■■□ 3.05
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FZD9O00144 591 aa34.09■■■■□ 3.05
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP34.09■■■■□ 3.05
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POTEIP0CG38 1075 aa34.09■■■■□ 3.05
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POTEJP0CG39 1038 aa34.09■■■■□ 3.05
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 JMYQ8N9B5 988 aa34.09■■■■□ 3.05
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP34.09■■■■□ 3.05
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP34.07■■■■□ 3.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 APAF1O14727 1248 aa34.06■■■■□ 3.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IFFO2Q5TF58 517 aa34.06■■■■□ 3.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP34.06■■■■□ 3.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP34.06■■■■□ 3.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DUSP27Q5VZP5 1158 aa34.05■■■■□ 3.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LDHDQ86WU2 507 aa34.05■■■■□ 3.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MBIPQ9NS73 344 aa34.05■■■■□ 3.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HACL1Q9UJ83 578 aa34.05■■■■□ 3.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP34.04■■■■□ 3.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC51AQ86UW1 340 aa34.04■■■■□ 3.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPC2Q8N158 579 aa34.04■■■■□ 3.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLBD2Q8NHP8 589 aa34.04■■■■□ 3.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LARGE2Q8N3Y3 721 aa34.03■■■■□ 3.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa34.03■■■■□ 3.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ABCC4O15439 1325 aa34.03■■■■□ 3.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SH3TC1Q8TE82 1336 aa34.03■■■■□ 3.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF853P0CG23 659 aa34.02■■■■□ 3.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EIF6P56537 245 aaKnown RBP34.02■■■■□ 3.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP34.02■■■■□ 3.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa34.02■■■■□ 3.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HYPKQ9NX55 129 aa34.02■■■■□ 3.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COL4A5P29400 1685 aa34.01■■■■□ 3.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP34.01■■■■□ 3.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IFT57Q9NWB7 429 aa34.01■■■■□ 3.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LAMB2P55268 1798 aa34■■■■□ 3.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EPHX2P34913 555 aa34■■■■□ 3.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BBOX1O75936 387 aa33.99■■■■□ 3.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GNAI1P63096 354 aa33.99■■■■□ 3.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP33.98■■■■□ 3.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GJA3Q9Y6H8 435 aa33.98■■■■□ 3.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP33.97■■■■□ 3.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF428Q96B54 188 aa33.97■■■■□ 3.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CREBZFQ9NS37 354 aa33.97■■■■□ 3.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLEC11AQ9Y240 323 aa33.97■■■■□ 3.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NIM1KQ8IY84 436 aa33.96■■■■□ 3.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ISCA1Q9BUE6 129 aa33.96■■■■□ 3.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPIP5K2O43314 1243 aa33.95■■■■□ 3.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SP8Q8IXZ3 490 aa33.95■■■■□ 3.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VPS33BQ9H267 617 aa33.95■■■■□ 3.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa33.94■■■■□ 3.02
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SUPT20HQ8NEM7 779 aa33.94■■■■□ 3.02
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GRAPQ13588 217 aa33.93■■■■□ 3.02
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AOC3Q16853 763 aa33.93■■■■□ 3.02
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP33.93■■■■□ 3.02
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PASKQ96RG2 1323 aa33.93■■■■□ 3.02
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCNTO95613 3336 aa33.92■■■■□ 3.02
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP33.92■■■■□ 3.02
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP33.92■■■■□ 3.02
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP33.92■■■■□ 3.02
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa33.92■■■■□ 3.02
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP33.91■■■■□ 3.02
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MPNDQ8N594 471 aa33.91■■■■□ 3.02
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM89AQ96GI7 184 aa33.91■■■■□ 3.02
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP33.9■■■■□ 3.02
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP33.9■■■■□ 3.02
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GOLGA2Q08379 1002 aa33.89■■■■□ 3.02
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP33.89■■■■□ 3.02
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RIC3Q7Z5B4 369 aa33.89■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms