RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
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PTPRM-202ENST00000400053 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP10.21□□□□□ -0.772e-6■■■■□ 20.7
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PTPRM-202ENST00000400053 CCDC175P0C221 793 aa10.2□□□□□ -0.78
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PTPRM-202ENST00000400053 CTR9Q6PD62 1173 aa10.2□□□□□ -0.78
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