RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa8.82□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 GCC1Q96CN9 775 aa8.82□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 USP31Q70CQ4 1352 aa8.82□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 GCGRP47871 477 aa8.81□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF445P59923 1031 aa8.81□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 NUCB1Q02818 461 aa8.81□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 KCNA1Q09470 495 aa8.81□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 ESCO1Q5FWF5 840 aa8.81□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 C1orf167Q5SNV9 1468 aa8.81□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 RLBP1P12271 317 aa8.81□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 MTHFSP49914 203 aa8.81□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 ALDH1L2Q3SY69 923 aa8.81□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa8.81□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 OVOS2Q6IE36 1432 aa8.81□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM88BA6NKF7 163 aa8.8□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa8.8□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 NBPF26B4DH59 902 aa8.8□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 PDE4CQ08493 712 aa8.8□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 NR6A1Q15406 480 aa8.8□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa8.8□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 NME9Q86XW9 330 aa8.8□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 SMC4Q9NTJ3 1288 aa8.8□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 USTQ9Y2C2 406 aa8.8□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 MST1RQ04912 1400 aa8.8□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 DYNC1I1O14576 645 aa8.8□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 PSME1Q06323 249 aa8.8□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 MTMR2Q13614 643 aa8.8□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 VRTNQ9H8Y1 702 aa8.8□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 ERBB4Q15303 1308 aa8.79□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 PIK3C2AO00443 1686 aa8.79□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 C6orf229H3BNL8 230 aa8.79□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 PACS2Q86VP3 889 aa8.79□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 CHD1LQ86WJ1 897 aa8.79□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 ITPRIPQ8IWB1 547 aa8.79□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 BCL2L12Q9HB09 334 aa8.79□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 PNPLA6Q8IY17 1366 aa8.79□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 NCLP19338 710 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 RABEP1Q15276 862 aa8.78□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa8.78□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 KIF24Q5T7B8 1368 aa8.78□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa8.78□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 PTPREP23469 700 aa8.78□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC39Q9UFE4 941 aa8.78□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 NPHP3Q7Z494 1330 aa8.77□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 TRIM27P14373 513 aa8.77□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa8.77□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 ABTB2Q8N961 1025 aa8.77□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 ARHGAP45Q92619 1136 aa8.77□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 PDLIM2Q96JY6 352 aa8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 ORAI2Q96SN7 254 aa8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 POLKQ9UBT6 870 aa8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 CDC45O75419 566 aa8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 BAG4O95429 457 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 MBD3O95983 291 aa8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 FUT2Q10981 343 aa8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 CASC1Q6TDU7 716 aa8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 KCNH5Q8NCM2 988 aa8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 FOXO3O43524 673 aa8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 SEMA3FQ13275 785 aa8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 KRT28Q7Z3Y7 464 aa8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 GAS2L3Q86XJ1 694 aa8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 KIAA1468Q9P260 1216 aa8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 SBNO1A3KN83 1393 aa8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 ST18O60284 1047 aa8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 SASS6Q6UVJ0 657 aa8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 BCL2L13Q9BXK5 485 aa8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 PIK3CDO00329 1044 aa8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 DOK7Q18PE1 504 aa8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 KCNK17Q96T54 332 aa8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 SLAIN2Q9P270 581 aa8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 ALS2Q96Q42 1657 aa8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 RTL1A6NKG5 1358 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 FLT4P35916 1363 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-201ENST00000372616 MCM2P49736 904 aa8.73□□□□□ -1.01
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