RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 ZBTB7AO95365 584 aa37.35■■■■□ 3.57
ECHS1-201ENST00000368547 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP37.35■■■■□ 3.57
ECHS1-201ENST00000368547 PARP10Q53GL7 1025 aa37.34■■■■□ 3.57
ECHS1-201ENST00000368547 ITPRIPQ8IWB1 547 aa37.33■■■■□ 3.57
ECHS1-201ENST00000368547 GCKRQ14397 625 aa37.32■■■■□ 3.57
ECHS1-201ENST00000368547 SUSD4Q5VX71 490 aa37.32■■■■□ 3.57
ECHS1-201ENST00000368547 COG6Q9Y2V7 657 aa37.32■■■■□ 3.57
ECHS1-201ENST00000368547 CARMIL3Q8ND23 1372 aa37.32■■■■□ 3.57
ECHS1-201ENST00000368547 FAM177BA6PVY3 158 aa37.32■■■■□ 3.56
ECHS1-201ENST00000368547 MTFR1LQ9H019 292 aa37.32■■■■□ 3.56
ECHS1-201ENST00000368547 MMP10P09238 476 aa37.31■■■■□ 3.56
ECHS1-201ENST00000368547 DDR1Q08345 913 aa37.31■■■■□ 3.56
ECHS1-201ENST00000368547 MVPQ14764 893 aaKnown RBP37.29■■■■□ 3.56
ECHS1-201ENST00000368547 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP37.28■■■■□ 3.56
ECHS1-201ENST00000368547 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa37.28■■■■□ 3.56
ECHS1-201ENST00000368547 PPP4R2Q9NY27 417 aa37.28■■■■□ 3.56
ECHS1-201ENST00000368547 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP37.28■■■■□ 3.56
ECHS1-201ENST00000368547 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP37.27■■■■□ 3.56
ECHS1-201ENST00000368547 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP37.27■■■■□ 3.56
ECHS1-201ENST00000368547 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP37.27■■■■□ 3.56
ECHS1-201ENST00000368547 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP37.27■■■■□ 3.56
ECHS1-201ENST00000368547 NTSR2O95665 410 aa37.26■■■■□ 3.56
ECHS1-201ENST00000368547 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP37.26■■■■□ 3.56
ECHS1-201ENST00000368547 SERPINB2P05120 415 aa37.25■■■■□ 3.55
ECHS1-201ENST00000368547 USP44Q9H0E7 712 aa37.25■■■■□ 3.55
ECHS1-201ENST00000368547 PARP3Q9Y6F1 533 aa37.25■■■■□ 3.55
ECHS1-201ENST00000368547 GRM8O00222 908 aa37.25■■■■□ 3.55
ECHS1-201ENST00000368547 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP37.25■■■■□ 3.55
ECHS1-201ENST00000368547 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP37.25■■■■□ 3.55
ECHS1-201ENST00000368547 FAM89AQ96GI7 184 aa37.24■■■■□ 3.55
ECHS1-201ENST00000368547 NYXQ9GZU5 481 aa37.24■■■■□ 3.55
ECHS1-201ENST00000368547 TPTE2Q6XPS3 522 aa37.23■■■■□ 3.55
ECHS1-201ENST00000368547 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP37.23■■■■□ 3.55
ECHS1-201ENST00000368547 DDX19BQ9UMR2 479 aa37.23■■■■□ 3.55
ECHS1-201ENST00000368547 NRXN2Q9P2S2 1712 aa37.23■■■■□ 3.55
ECHS1-201ENST00000368547 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP37.22■■■■□ 3.55
ECHS1-201ENST00000368547 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa37.22■■■■□ 3.55
ECHS1-201ENST00000368547 CRBNQ96SW2 442 aa37.22■■■■□ 3.55
ECHS1-201ENST00000368547 MEIS3Q99687 375 aa37.22■■■■□ 3.55
ECHS1-201ENST00000368547 H7C1W4 665 aa37.21■■■■□ 3.55
ECHS1-201ENST00000368547 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP37.21■■■■□ 3.55
ECHS1-201ENST00000368547 NUTM1Q86Y26 1132 aa37.21■■■■□ 3.55
ECHS1-201ENST00000368547 SYNE4Q8N205 404 aa37.21■■■■□ 3.55
ECHS1-201ENST00000368547 SH3TC1Q8TE82 1336 aa37.2■■■■□ 3.55
ECHS1-201ENST00000368547 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP37.2■■■■□ 3.55
ECHS1-201ENST00000368547 NPHP1O15259 732 aa37.2■■■■□ 3.55
ECHS1-201ENST00000368547 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP37.2■■■■□ 3.55
ECHS1-201ENST00000368547 CNBD1Q8NA66 436 aa37.2■■■■□ 3.55
ECHS1-201ENST00000368547 UTYO14607 1347 aa37.19■■■■□ 3.54
ECHS1-201ENST00000368547 ERFEQ4G0M1 354 aa37.18■■■■□ 3.54
ECHS1-201ENST00000368547 PRR5LQ6MZQ0 368 aa37.18■■■■□ 3.54
ECHS1-201ENST00000368547 CASP7P55210 303 aa37.18■■■■□ 3.54
ECHS1-201ENST00000368547 EXOC6Q8TAG9 804 aa37.18■■■■□ 3.54
ECHS1-201ENST00000368547 POLD1P28340 1107 aa37.17■■■■□ 3.54
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC24Q8N4L8 307 aa37.17■■■■□ 3.54
ECHS1-201ENST00000368547 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP37.16■■■■□ 3.54
ECHS1-201ENST00000368547 GNAI3P08754 354 aa37.15■■■■□ 3.54
ECHS1-201ENST00000368547 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP37.15■■■■□ 3.54
ECHS1-201ENST00000368547 CDHR2Q9BYE9 1310 aa37.15■■■■□ 3.54
ECHS1-201ENST00000368547 SGIP1Q9BQI5 828 aa37.14■■■■□ 3.54
ECHS1-201ENST00000368547 ABCC12Q96J65 1359 aa37.14■■■■□ 3.54
ECHS1-201ENST00000368547 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP37.14■■■■□ 3.54
ECHS1-201ENST00000368547 LAMB2P55268 1798 aa37.14■■■■□ 3.54
ECHS1-201ENST00000368547 PTGER2P43116 358 aa37.13■■■■□ 3.53
ECHS1-201ENST00000368547 SPON1Q9HCB6 807 aa37.13■■■■□ 3.53
ECHS1-201ENST00000368547 ST5P78524 1137 aa37.12■■■■□ 3.53
ECHS1-201ENST00000368547 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP37.12■■■■□ 3.53
ECHS1-201ENST00000368547 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP37.11■■■■□ 3.53
ECHS1-201ENST00000368547 SUCLG2Q96I99 432 aa37.1■■■■□ 3.53
ECHS1-201ENST00000368547 SLC10A5Q5PT55 438 aa37.1■■■■□ 3.53
ECHS1-201ENST00000368547 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa37.1■■■■□ 3.53
ECHS1-201ENST00000368547 MYH3P11055 1940 aa37.09■■■■□ 3.53
ECHS1-201ENST00000368547 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa37.08■■■■□ 3.53
ECHS1-201ENST00000368547 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP37.08■■■■□ 3.53
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ECHS1-201ENST00000368547 KAZALD1Q96I82 304 aa37.07■■■■□ 3.53
ECHS1-201ENST00000368547 GNAI2P04899 355 aa37.07■■■■□ 3.52
ECHS1-201ENST00000368547 C1orf115Q9H7X2 142 aa37.07■■■■□ 3.52
ECHS1-201ENST00000368547 HDAC5Q9UQL6 1122 aa37.07■■■■□ 3.52
ECHS1-201ENST00000368547 PDE8AO60658 829 aa37.06■■■■□ 3.52
ECHS1-201ENST00000368547 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP37.06■■■■□ 3.52
ECHS1-201ENST00000368547 PLA2G12BQ9BX93 195 aa37.06■■■■□ 3.52
ECHS1-201ENST00000368547 EPHA10Q5JZY3 1008 aa37.05■■■■□ 3.52
ECHS1-201ENST00000368547 RIC1Q4ADV7 1423 aa37.05■■■■□ 3.52
ECHS1-201ENST00000368547 AAMPQ13685 434 aa37.04■■■■□ 3.52
ECHS1-201ENST00000368547 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP37.03■■■■□ 3.52
ECHS1-201ENST00000368547 FOXO4P98177 505 aa37.03■■■■□ 3.52
ECHS1-201ENST00000368547 BRIP1Q9BX63 1249 aa37.03■■■■□ 3.52
ECHS1-201ENST00000368547 C10orf71Q711Q0 1435 aa37.02■■■■□ 3.52
ECHS1-201ENST00000368547 C3orf67Q6ZVT6 689 aa37.02■■■■□ 3.52
ECHS1-201ENST00000368547 NLRP3Q96P20 1036 aa37.02■■■■□ 3.52
ECHS1-201ENST00000368547 KIF13BQ9NQT8 1826 aa37.01■■■■□ 3.51
ECHS1-201ENST00000368547 CTSWP56202 376 aa37■■■■□ 3.51
ECHS1-201ENST00000368547 ANKRD44Q8N8A2 993 aa36.99■■■■□ 3.51
ECHS1-201ENST00000368547 LMBR1LQ6UX01 489 aa36.98■■■■□ 3.51
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC136Q96JN2 1154 aa36.98■■■■□ 3.51
ECHS1-201ENST00000368547 TTLL11Q8NHH1 800 aa36.97■■■■□ 3.51
ECHS1-201ENST00000368547 PDE6BP35913 854 aa36.96■■■■□ 3.51
ECHS1-201ENST00000368547 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP36.96■■■■□ 3.51
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP36.96■■■■□ 3.51
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