RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366959.4

RPS6KC1-201, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene RPS6KC1, Length 5,454 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-201ENST00000366959 DACT1Q9NYF0 836 aa16.51■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 ANO6Q4KMQ2 910 aa16.51■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 CCDC178Q5BJE1 867 aa16.51■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 ANKRD44Q8N8A2 993 aa16.51■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZBTB9Q96C00 473 aa16.51■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 IL16Q14005 1332 aa16.51■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP16.51■□□□□ 0.231e-6■■■■■ 27.4
RPS6KC1-201ENST00000366959 KRT28Q7Z3Y7 464 aa16.51■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 ANKRD24Q8TF21 1146 aa16.51■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP16.51■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 YEATS4O95619 227 aa16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 NEMFO60524 1076 aa16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 CEP135Q66GS9 1140 aa16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 CATIPQ7Z7H3 387 aa16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 MCM5P33992 734 aa16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 MAPKBP1O60336 1514 aa16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 CCDC102BQ68D86 513 aa16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 NSD2O96028 1365 aa16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 MACROD2A1Z1Q3 448 aa16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 PAFAH1B1P43034 410 aa16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 IFNL2Q8IZJ0 200 aa16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 DYDC1Q8WWB3 177 aa16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 GRIN2AQ12879 1464 aa16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 ARHGAP45Q92619 1136 aa16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 COPS6Q7L5N1 327 aa16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 XAGE3Q8WTP9 111 aa16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZNF287Q9HBT7 754 aa16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 LIG1P18858 919 aa16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 TSG101Q99816 390 aa16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 DNAJC25Q9H1X3 360 aa16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 V9GYY5 206 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 SHTN1A0MZ66 631 aa16.48■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 MAP9Q49MG5 647 aa16.48■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 CLCN1P35523 988 aa16.48■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 UVSSAQ2YD98 709 aa16.48■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 NCOA7Q8NI08 942 aa16.48■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 GOPCQ9HD26 462 aa16.48■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 SKILP12757 684 aa16.48■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP16.48■□□□□ 0.234e-6■■■■□ 22.5
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 TCERG1LQ5VWI1 586 aa16.48■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 USO1O60763 962 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 UBA7P41226 1012 aa16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 SYKP43405 635 aa16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 PHACTR3Q96KR7 559 aa16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 AFMP43652 599 aa16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 IFFO1Q0D2I5 559 aa16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 SPECC1Q5M775 1068 aa16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 TMOD2Q9NZR1 351 aa16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 HMG20BQ9P0W2 317 aa16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 POLKQ9UBT6 870 aa16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 USP8P40818 1118 aa16.46■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 MFSD6Q6ZSS7 791 aa16.46■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 TSPY2A6NKD2 308 aa16.46■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 N4BP3O15049 544 aa16.46■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 CHMP4BP1P59074 171 aa16.46■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 CHST3Q7LGC8 479 aa16.46■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 DYNC1I1O14576 645 aa16.46■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 UBASH3AP57075 661 aa16.46■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 LMBR1LQ6UX01 489 aa16.46■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa16.46■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 TMCO5BA8MYB1 307 aa16.46■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 C6orf229H3BNL8 230 aa16.46■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 MYO1BO43795 1136 aa16.46■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa16.46■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 LMAN1P49257 510 aa16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 TMEM266Q2M3C6 531 aa16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 FAM200AQ8TCP9 573 aa16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 RAB34Q9BZG1 259 aa16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 DNAI1Q9UI46 699 aa16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 VPS36Q86VN1 386 aa16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 CARD14Q9BXL6 1004 aa16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 FANCAO15360 1455 aa16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.3 ms