RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025262.5

Ltb-201, Transcript of Lymphotoxin-beta, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ltb, Length 1,160 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltb-201ENSMUST00000025262 GmpsQ3THK7 693 aa25.04■■□□□ 1.6
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm7347D3YYI9 267 aa25.03■■□□□ 1.6
Ltb-201ENSMUST00000025262 Speer4aF8VPX6 267 aa25.03■■□□□ 1.6
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Klf15Q9EPW2 415 aa25.01■■□□□ 1.59
Ltb-201ENSMUST00000025262 NinQ61043 2035 aa25■■□□□ 1.59
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Glis3Q6XP49 780 aa25■■□□□ 1.59
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Scn11aQ9R053 1765 aa24.98■■□□□ 1.59
Ltb-201ENSMUST00000025262 Prpmp5E9PXN1 296 aa24.98■■□□□ 1.59
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tmem119Q8R138 280 aa24.98■■□□□ 1.59
Ltb-201ENSMUST00000025262 Kank1E9Q238 1360 aa24.97■■□□□ 1.59
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Ankrd31A0A140LI88 1765 aa24.95■■□□□ 1.59
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Ltn1Q6A009 1767 aa24.95■■□□□ 1.58
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Vsig10D3YX43 558 aa24.94■■□□□ 1.58
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mansc4Q3UU94 337 aa24.93■■□□□ 1.58
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tmem130Q6NXM3 419 aa24.93■■□□□ 1.58
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ltb4r2Q9JJL9 360 aa24.93■■□□□ 1.58
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gdf11Q9Z1W4 405 aa24.93■■□□□ 1.58
Ltb-201ENSMUST00000025262 Nrxn2E9Q7X7 1710 aa24.92■■□□□ 1.58
Ltb-201ENSMUST00000025262 1700019A02RikA0A087WPV9 146 aa24.92■■□□□ 1.58
Ltb-201ENSMUST00000025262 UvssaQ9D479 717 aa24.92■■□□□ 1.58
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tbc1d8Q9Z1A9 1134 aa24.92■■□□□ 1.58
Ltb-201ENSMUST00000025262 Plekhh1Q80TI1 1356 aa24.92■■□□□ 1.58
Ltb-201ENSMUST00000025262 Podnl1Q6P3Y9 559 aa24.91■■□□□ 1.58
Ltb-201ENSMUST00000025262 Q7TT23 1179 aa24.91■■□□□ 1.58
Ltb-201ENSMUST00000025262 Kcnc4Q8R1C0 628 aa24.91■■□□□ 1.58
Ltb-201ENSMUST00000025262 OsbpQ3B7Z2 805 aa24.9■■□□□ 1.58
Ltb-201ENSMUST00000025262 Igflr1Q3U4N7 345 aa24.9■■□□□ 1.58
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ankle2Q6P1H6 964 aa24.9■■□□□ 1.58
Ltb-201ENSMUST00000025262 Zmynd8A2A484 1235 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
Ltb-201ENSMUST00000025262 Oas2E9Q9A9 742 aa24.89■■□□□ 1.58
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cnot7Q60809 285 aa24.89■■□□□ 1.58
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Pbx4Q99NE9 378 aa24.88■■□□□ 1.57
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tmem67Q8BR76 992 aa24.87■■□□□ 1.57
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Psmd14O35593 310 aa24.86■■□□□ 1.57
Ltb-201ENSMUST00000025262 EappQ5BU09 281 aa24.86■■□□□ 1.57
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tor1aip2Q8BYU6 502 aa24.86■■□□□ 1.57
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sde2Q8K1J5 448 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
Ltb-201ENSMUST00000025262 Lysmd1Q9D0E3 226 aa24.86■■□□□ 1.57
Ltb-201ENSMUST00000025262 Adarb2Q9JI20 745 aa24.86■■□□□ 1.57
Ltb-201ENSMUST00000025262 Lgr5Q9Z1P4 907 aa24.86■■□□□ 1.57
Ltb-201ENSMUST00000025262 Dlg5E9Q9R9 1921 aa24.86■■□□□ 1.57
Ltb-201ENSMUST00000025262 Kiaa0232Q80U59 1396 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
Ltb-201ENSMUST00000025262 Shtn1Q8K2Q9 631 aa24.85■■□□□ 1.57
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sf3b3Q921M3 1217 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
Ltb-201ENSMUST00000025262 Swt1Q9DBQ9 907 aa24.85■■□□□ 1.57
Ltb-201ENSMUST00000025262 Foxo4Q9WVH3 505 aa24.85■■□□□ 1.57
Ltb-201ENSMUST00000025262 HunkO88866 714 aa24.84■■□□□ 1.57
Ltb-201ENSMUST00000025262 Best3Q6H1V1 669 aa24.84■■□□□ 1.57
Ltb-201ENSMUST00000025262 Znf609Q8BZ47 1413 aa24.84■■□□□ 1.57
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pcdh15Q99PJ1 1943 aa24.83■■□□□ 1.57
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cyp19a1P28649 503 aa24.83■■□□□ 1.57
Ltb-201ENSMUST00000025262 NyxP83503 476 aa24.83■■□□□ 1.57
Ltb-201ENSMUST00000025262 Q3TQI7 289 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
Ltb-201ENSMUST00000025262 Znf541Q0GGX2 1363 aa24.82■■□□□ 1.56
Ltb-201ENSMUST00000025262 NefmP08553 848 aa24.82■■□□□ 1.56
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Ltb-201ENSMUST00000025262 U2surpQ6NV83 1029 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
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Ltb-201ENSMUST00000025262 GptQ8QZR5 496 aa24.82■■□□□ 1.56
Ltb-201ENSMUST00000025262 Telo2Q9DC40 840 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
Ltb-201ENSMUST00000025262 Popdc2Q9ES82 367 aa24.82■■□□□ 1.56
Ltb-201ENSMUST00000025262 Morc2aQ69ZX6 1030 aa24.81■■□□□ 1.56
Ltb-201ENSMUST00000025262 Kcnq5Q9JK45 933 aa24.81■■□□□ 1.56
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ecm29Q6PDI5 1840 aa24.8■■□□□ 1.56
Ltb-201ENSMUST00000025262 Arrdc4A0A0B4J1F4 415 aa24.8■■□□□ 1.56
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rps12P63323 132 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cyp7a1Q64505 503 aa24.8■■□□□ 1.56
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sirt2Q8VDQ8 389 aa24.8■■□□□ 1.56
Ltb-201ENSMUST00000025262 Dydc2Q9D3X8 139 aa24.8■■□□□ 1.56
Ltb-201ENSMUST00000025262 LeprP48356 1162 aa24.79■■□□□ 1.56
Ltb-201ENSMUST00000025262 Arih1Q9Z1K5 555 aa24.79■■□□□ 1.56
Ltb-201ENSMUST00000025262 MypnQ5DTJ9 1315 aa24.79■■□□□ 1.56
Ltb-201ENSMUST00000025262 AK157302I3ITR1 129 aa24.78■■□□□ 1.56
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