RNA–Protein interactions for RNA: YOL077C

BRX1, Transcript of Nucleolar protein, yeast

Gene BRX1, Length 876 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BRX1	YOL077C	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	POA1	P38218	177 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	MND2	P40577	368 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	HUL5	P53119	910 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	YGR012W	P53206	393 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	GPB1	Q08886	897 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	YOR131C	Q12486	218 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	CIT1	P00890	479 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	not detected
BRX1	YOL077C	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	YBR284W	P38150	797 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	SFB2	P53953	876 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	YDR132C	Q03900	495 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	LCD1	Q04377	747 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	NSE3	Q05541	303 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	BDF2	Q07442	638 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	FLC1	Q08967	793 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	HSF1	P10961	833 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	NPP2	P39997	493 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	GCV2	P49095	1034 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	YPR071W	Q12346	211 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	YLR358C	O13565	187 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	NPP1	P25353	742 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	DOM34	P33309	386 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	REC104	P33323	182 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	THI80	P35202	319 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	DUS4	Q06063	367 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	GAL11	P19659	1081 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BRX1	YOL077C	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
BRX1	YOL077C	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
BRX1	YOL077C	OCA5	P38738	679 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BRX1	YOL077C	IOC3	P43596	787 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BRX1	YOL077C	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.77	□□□□□ -1.65	not detected
BRX1	YOL077C	VPS30	Q02948	557 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BRX1	YOL077C	YAP6	Q03935	383 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BRX1	YOL077C	CDA1	Q06702	301 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BRX1	YOL077C	TPO1	Q07824	586 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BRX1	YOL077C	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
BRX1	YOL077C	SPE1	P08432	466 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BRX1	YOL077C	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
BRX1	YOL077C	EMC1	P25574	760 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BRX1	YOL077C	AFR1	P33304	620 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BRX1	YOL077C	PET10	P36139	283 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BRX1	YOL077C	TOK1	P40310	691 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BRX1	YOL077C	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
BRX1	YOL077C	VPS62	P53285	467 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BRX1	YOL077C	HMI1	Q12039	706 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BRX1	YOL077C	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
BRX1	YOL077C	CDC6	P09119	513 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BRX1	YOL077C	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
BRX1	YOL077C	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.75	□□□□□ -1.65	not detected
BRX1	YOL077C	CDC20	P26309	610 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BRX1	YOL077C	ATG19	P35193	415 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BRX1	YOL077C	ERT1	P38140	529 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BRX1	YOL077C	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
BRX1	YOL077C	MET12	P46151	657 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BRX1	YOL077C	TAF8	Q03750	510 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BRX1	YOL077C	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
BRX1	YOL077C	CAN1	P04817	590 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BRX1	YOL077C	HIS5	P07172	385 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BRX1	YOL077C	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
BRX1	YOL077C	NIT3	P49954	291 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BRX1	YOL077C	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
BRX1	YOL077C	ADY3	Q07732	790 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BRX1	YOL077C	ESC8	Q08119	714 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BRX1	YOL077C	TOP3	P13099	656 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BRX1	YOL077C	FLR1	P38124	548 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BRX1	YOL077C	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.73	□□□□□ -1.65	not detected
BRX1	YOL077C	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
BRX1	YOL077C	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
BRX1	YOL077C	YKE2	P52553	114 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BRX1	YOL077C	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
BRX1	YOL077C	YLR224W	Q05947	369 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BRX1	YOL077C	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
BRX1	YOL077C	YKL222C	P35995	705 aa		4.72	□□□□□ -1.65
BRX1	YOL077C	TMA10	Q06177	86 aa		4.72	□□□□□ -1.65
BRX1	YOL077C	MPH2	P0CD99	609 aa		4.71	□□□□□ -1.66
BRX1	YOL077C	STE13	P33894	931 aa		4.71	□□□□□ -1.66
BRX1	YOL077C	BET3	P36149	193 aa		4.71	□□□□□ -1.66
BRX1	YOL077C	PLB1	P39105	664 aa		4.71	□□□□□ -1.66
BRX1	YOL077C	CEP3	P40969	608 aa		4.71	□□□□□ -1.66
BRX1	YOL077C	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.71	□□□□□ -1.66	not detected
BRX1	YOL077C	RPN4	Q03465	531 aa		4.71	□□□□□ -1.66
BRX1	YOL077C	YTA7	P40340	1379 aa		4.7	□□□□□ -1.66
BRX1	YOL077C	STE11	P23561	717 aa		4.7	□□□□□ -1.66
BRX1	YOL077C	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
BRX1	YOL077C	LST4	P34239	828 aa		4.7	□□□□□ -1.66
BRX1	YOL077C	GIP4	P39732	760 aa		4.7	□□□□□ -1.66
BRX1	YOL077C	OSW7	P43611	510 aa		4.7	□□□□□ -1.66
BRX1	YOL077C	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11.9 ms