RNA–Protein interactions for RNA: YOL044W

PEX15, Transcript of Tail-anchored type II integral peroxisomal membrane protein, yeast

Gene PEX15, Length 1,152 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Peroxisome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PEX15	YOL044W	YOR131C	Q12486	218 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PEX15	YOL044W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PEX15	YOL044W	YAP1801	P38856	637 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PEX15	YOL044W	MEF2	P39677	819 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PEX15	YOL044W	ZRG8	P40021	1076 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PEX15	YOL044W	HUL5	P53119	910 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PEX15	YOL044W	YGR125W	P53273	1036 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PEX15	YOL044W	PLB2	Q03674	706 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PEX15	YOL044W	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PEX15	YOL044W	BDF2	Q07442	638 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PEX15	YOL044W	YLR358C	O13565	187 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PEX15	YOL044W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PEX15	YOL044W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
PEX15	YOL044W	CDC11	P32458	415 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PEX15	YOL044W	SRP101	P32916	621 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PEX15	YOL044W	YER158C	P40095	573 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PEX15	YOL044W	SCT1	P32784	759 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PEX15	YOL044W	YBR284W	P38150	797 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PEX15	YOL044W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PEX15	YOL044W	NPP2	P39997	493 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PEX15	YOL044W	RNH70	P53331	553 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PEX15	YOL044W	SFB2	P53953	876 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PEX15	YOL044W	RXT3	Q07458	294 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PEX15	YOL044W	GPB1	Q08886	897 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PEX15	YOL044W	CTS1	P29029	562 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	PPG1	P32838	368 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	POA1	P38218	177 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	SIT1	P39980	628 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	MND2	P40577	368 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	OSW7	P43611	510 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	GYP7	P48365	746 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	GCV2	P49095	1034 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	YGR012W	P53206	393 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	RPN4	Q03465	531 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	CIT2	P08679	460 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	NPP1	P25353	742 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	RPC82	P32349	654 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
PEX15	YOL044W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	HUL4	P40985	892 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	LCD1	Q04377	747 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	FLC1	Q08967	793 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	CIT1	P00890	479 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	HSF1	P10961	833 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	EMC1	P25574	760 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	ERT1	P38140	529 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	YAP6	Q03935	383 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	DUS4	Q06063	367 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	TPO1	Q07824	586 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	YPR071W	Q12346	211 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	BUD6	P41697	788 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	CDA1	Q06702	301 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	SPE1	P08432	466 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	GAL11	P19659	1081 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	AFR1	P33304	620 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	DOM34	P33309	386 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	REC104	P33323	182 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	BRN1	P38170	754 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	TOK1	P40310	691 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
PEX15	YOL044W	HMI1	Q12039	706 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	CDC20	P26309	610 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	PET10	P36139	283 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	VPS62	P53285	467 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	CDC6	P09119	513 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	TOP3	P13099	656 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.63	not detected
PEX15	YOL044W	NUP82	P40368	713 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	VPS30	Q02948	557 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	TAF8	Q03750	510 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	TMA10	Q06177	86 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	ADY3	Q07732	790 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PEX15	YOL044W	TIM23	P32897	222 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PEX15	YOL044W	ATG19	P35193	415 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PEX15	YOL044W	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PEX15	YOL044W	MET12	P46151	657 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PEX15	YOL044W	ALG12	P53730	551 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PEX15	YOL044W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64

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