RNA–Protein interactions for RNA: YOL005C

RPB11, Transcript of RNA polymerase II subunit B12.5, yeastyeast

Gene RPB11, Length 363 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPB11YOL005C FPR4Q06205 392 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C XYL2Q07993 356 aa3.57□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C YDL177CQ12257 170 aa3.57□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C RIB2Q12362 591 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C RFA1P22336 621 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C CDC48P25694 835 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C FUN30P31380 1131 aa3.56□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C REC104P33323 182 aa3.56□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C BET3P36149 193 aa3.56□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C YAP1801P38856 637 aa3.56□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C ZRG8P40021 1076 aa3.56□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C NUP82P40368 713 aa3.56□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C AVT1P47082 602 aa3.56□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C ECL1P48235 211 aa3.56□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C CCM1P48237 864 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C RTA1P53047 317 aa3.56□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C SGD1Q06132 899 aa3.56□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C YLL058WQ12198 575 aa3.56□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C PHR1P05066 565 aaKnown RBP RIP-Chip data3.55□□□□□ -1.84not detected
RPB11YOL005C CIT2P08679 460 aa3.55□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C PHO8P11491 566 aa3.55□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C THI4P32318 326 aa3.55□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C SCT1P32784 759 aa3.55□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C TSL1P38427 1098 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C SIT1P39980 628 aa3.55□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C NPP2P39997 493 aa3.55□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C TOK1P40310 691 aa3.55□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C GYP7P48365 746 aa3.55□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C GCV2P49095 1034 aa3.55□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C PRP43P53131 767 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C ORC1P54784 914 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C MSC2Q03455 724 aa3.55□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C MET6P05694 767 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C NOT3P06102 836 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C SRM1P21827 482 aa3.54□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C AFR1P33304 620 aa3.54□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C PET10P36139 283 aa3.54□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C ECM21P38167 1117 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C AIM3P38266 947 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C BUD6P41697 788 aa3.54□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C UBP6P43593 499 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C SPT20P50875 604 aa3.54□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C YGR012WP53206 393 aa3.54□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C RNH70P53331 553 aa3.54□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C YLR125WQ12138 136 aa3.54□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C RNQ1P25367 405 aa3.53□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C YKR078WP36158 585 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C POA1P38218 177 aa3.53□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C LAM1P38851 1228 aa3.53□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C CEP3P40969 608 aa3.53□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C NIT3P49954 291 aa3.53□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C HSV2P50079 448 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C PSP2P50109 593 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C VPS30Q02948 557 aa3.53□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C PLB2Q03674 706 aa3.53□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C SIZ1Q04195 904 aa3.53□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C PPM2Q08282 695 aa3.53□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C AIM44Q99299 758 aa3.53□□□□□ -1.84
RPB11YOL005C RPS9AO13516 197 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RPB11YOL005C RPS13P05756 151 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RPB11YOL005C HSF1P10961 833 aa3.52□□□□□ -1.85
RPB11YOL005C MEF2P39677 819 aa3.52□□□□□ -1.85
RPB11YOL005C ALG2P43636 503 aa3.52□□□□□ -1.85
RPB11YOL005C RAI1P53063 387 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RPB11YOL005C PBP1P53297 722 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RPB11YOL005C RAD53P22216 821 aa3.51□□□□□ -1.85
RPB11YOL005C SAP190P36123 1033 aa3.51□□□□□ -1.85
RPB11YOL005C DSS1P39112 969 aa3.51□□□□□ -1.85
RPB11YOL005C MND2P40577 368 aa3.51□□□□□ -1.85
RPB11YOL005C BUL2Q03758 920 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RPB11YOL005C RXT3Q07458 294 aa3.51□□□□□ -1.85
RPB11YOL005C GPB1Q08886 897 aa3.51□□□□□ -1.85
RPB11YOL005C MPH2P0CD99 609 aa3.5□□□□□ -1.85
RPB11YOL005C EMC1P25574 760 aa3.5□□□□□ -1.85
RPB11YOL005C RPC82P32349 654 aa3.5□□□□□ -1.85
RPB11YOL005C RPD3P32561 433 aa3.5□□□□□ -1.85
RPB11YOL005C TOD6P34219 525 aa3.5□□□□□ -1.85
RPB11YOL005C GDH3P39708 457 aa3.5□□□□□ -1.85
RPB11YOL005C PUS2P53167 370 aa3.5□□□□□ -1.85
RPB11YOL005C ALG12P53730 551 aa3.5□□□□□ -1.85
RPB11YOL005C GCN5Q03330 439 aa3.5□□□□□ -1.85
RPB11YOL005C CDA2Q06703 312 aa3.5□□□□□ -1.85
RPB11YOL005C TPO1Q07824 586 aa3.5□□□□□ -1.85
RPB11YOL005C YPL277CQ08989 487 aa3.5□□□□□ -1.85
RPB11YOL005C ENV7Q12003 364 aa3.5□□□□□ -1.85
RPB11YOL005C SPE1P08432 466 aa3.49□□□□□ -1.85
RPB11YOL005C DAL7P21826 554 aa3.49□□□□□ -1.85
RPB11YOL005C PER1P25625 357 aa3.49□□□□□ -1.85
RPB11YOL005C YIL108WP40483 696 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
RPB11YOL005C GYP8P43570 497 aa3.49□□□□□ -1.85
RPB11YOL005C DAM1P53267 343 aa3.49□□□□□ -1.85
RPB11YOL005C YAP6Q03935 383 aa3.49□□□□□ -1.85
RPB11YOL005C YDR514CQ04408 483 aa3.49□□□□□ -1.85
RPB11YOL005C POB3Q04636 552 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
RPB11YOL005C SSL1Q04673 461 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
RPB11YOL005C CDA1Q06702 301 aa3.49□□□□□ -1.85
RPB11YOL005C WHI4Q07655 649 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
RPB11YOL005C URA1P28272 314 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
RPB11YOL005C TYE7P33122 291 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
RPB11YOL005C STE13P33894 931 aa3.48□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 47.4 ms