RNA–Protein interactions for RNA: YNL193W

YNL193W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YNL193W, Length 1,677 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL193W	YNL193W	NPP1	P25353	742 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YNL193W	YNL193W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
YNL193W	YNL193W	GIC1	P38785	314 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YNL193W	YNL193W	GDH3	P39708	457 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YNL193W	YNL193W	TOK1	P40310	691 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YNL193W	YNL193W	HFM1	P51979	1187 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YNL193W	YNL193W	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
YNL193W	YNL193W	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
YNL193W	YNL193W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.91	□□□□□ -1.78	not detected
YNL193W	YNL193W	MSH2	P25847	964 aa		3.91	□□□□□ -1.78
YNL193W	YNL193W	LIP5	P32875	414 aa		3.91	□□□□□ -1.78
YNL193W	YNL193W	AFR1	P33304	620 aa		3.91	□□□□□ -1.78
YNL193W	YNL193W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
YNL193W	YNL193W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
YNL193W	YNL193W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
YNL193W	YNL193W	RPC82	P32349	654 aa		3.9	□□□□□ -1.78
YNL193W	YNL193W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.9	□□□□□ -1.78	not detected
YNL193W	YNL193W	HSP78	P33416	811 aa		3.9	□□□□□ -1.78
YNL193W	YNL193W	ERT1	P38140	529 aa		3.9	□□□□□ -1.78
YNL193W	YNL193W	YAP1801	P38856	637 aa		3.9	□□□□□ -1.78
YNL193W	YNL193W	ALG2	P43636	503 aa		3.9	□□□□□ -1.78
YNL193W	YNL193W	NIT3	P49954	291 aa		3.9	□□□□□ -1.78
YNL193W	YNL193W	ORC3	P54790	616 aa		3.9	□□□□□ -1.78
YNL193W	YNL193W	BRE4	Q07660	1125 aa		3.9	□□□□□ -1.78
YNL193W	YNL193W	RAD53	P22216	821 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	PEX6	P33760	1030 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	OMA1	P36163	345 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	SFB2	P53953	876 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	UGO1	Q03327	502 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	GSY1	P23337	708 aa		3.89	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	NPP2	P39997	493 aa		3.89	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	DAM1	P53267	343 aa		3.89	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	YOR352W	Q08816	343 aa		3.89	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	SFP1	P32432	683 aa		3.88	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	DSS1	P39112	969 aa		3.88	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	YKE2	P52553	114 aa		3.88	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	MSC2	Q03455	724 aa		3.88	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	XYL2	Q07993	356 aa		3.88	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	NTG2	Q08214	380 aa		3.88	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	MPH2	P0CD99	609 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	CMP2	P14747	604 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	SPC29	P33419	253 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	MAL11	P53048	616 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	VPS30	Q02948	557 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	SIZ1	Q04195	904 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.87	□□□□□ -1.79	not detected
YNL193W	YNL193W	MDM12	Q92328	271 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	ENA1	P13587	1091 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	MAC1	P35192	417 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	EMC3	P36039	253 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	GYP8	P43570	497 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	CTH1	P47976	325 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	ENA2	Q01896	1091 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	YDR514C	Q04408	483 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	ENV7	Q12003	364 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	ENA5	Q12691	1091 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	VBA3	P25594	458 aa		3.86	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	ZRG8	P40021	1076 aa		3.86	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	INP52	P50942	1183 aa		3.86	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	YGR012W	P53206	393 aa		3.86	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	SNO2	P53823	222 aa		3.86	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	HSF1	P10961	833 aa		3.85	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	SRM1	P21827	482 aa		3.85	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	SRP101	P32916	621 aa		3.85	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.85	□□□□□ -1.79	not detected
YNL193W	YNL193W	YJR142W	P47173	342 aa		3.85	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.85	□□□□□ -1.79	RIP-Chip
YNL193W	YNL193W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	DNM1	P54861	757 aa		3.85	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	TFB2	Q02939	513 aa		3.85	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	ATP25	Q03153	612 aa		3.85	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	REH1	Q06709	432 aa		3.85	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	MET7	Q08645	548 aa		3.85	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	GAL10	P04397	699 aa		3.84	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	TOP1	P04786	769 aa		3.84	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	CEP3	P40969	608 aa		3.84	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	DFG16	Q99234	619 aa		3.84	□□□□□ -1.79
YNL193W	YNL193W	ADR1	P07248	1323 aa		3.84	□□□□□ -1.8
YNL193W	YNL193W	DAL7	P21826	554 aa		3.84	□□□□□ -1.8
YNL193W	YNL193W	MEF1	P25039	761 aa		3.84	□□□□□ -1.8
YNL193W	YNL193W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.8
YNL193W	YNL193W	STE13	P33894	931 aa		3.84	□□□□□ -1.8
YNL193W	YNL193W	ATG36	P46983	293 aa		3.84	□□□□□ -1.8

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 20.9 ms