RNA–Protein interactions for RNA: YKR080W

MTD1, Transcript of NAD-dependent 5,10-methylenetetrahydrafolate dehydrogenase, yeast

Gene MTD1, Length 963 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MTD1	YKR080W	SPS1	P08458	490 aa		5.71	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	BET3	P36149	193 aa		5.71	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	YRO2	P38079	344 aa		5.71	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	RRT14	P40470	206 aa		5.71	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	RTA1	P53047	317 aa		5.71	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	ALG12	P53730	551 aa		5.71	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	MTC5	Q03897	1148 aa		5.71	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	MDM38	Q08179	573 aa		5.71	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	SVS1	Q12254	260 aa		5.71	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	BNI1	P41832	1953 aa		5.71	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	CHD1	P32657	1468 aa		5.71	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	TOP3	P13099	656 aa		5.7	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	ACE2	P21192	770 aa		5.7	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	YPR071W	Q12346	211 aa		5.7	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	TY2B-B	Q12491	1770 aa		5.7	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	RKR1	Q04781	1562 aa		5.69	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	DOM34	P33309	386 aa		5.69	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	PET10	P36139	283 aa		5.69	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	MTC3	P53077	123 aa		5.69	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.69	□□□□□ -1.5	not detected
MTD1	YKR080W	LCD1	Q04377	747 aa		5.69	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	TY1B-H	O13535	1793 aa		5.68	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	TY1B-DR5	P0C2I2	1755 aa		5.68	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	TY1B-DR6	P0C2I3	1755 aa		5.68	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	TY1B-LR2	P0C2I5	1755 aa		5.68	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	TY1B-LR3	P0C2I6	1755 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	TY1B-PR1	P0C2I9	1755 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	TY1B-PR2	P0C2J0	1756 aa		5.68	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	TY1B-PR3	P0C2J1	1755 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	TY1B-JR1	P47098	1755 aa		5.68	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	TY1B-ML2	Q03434	1755 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	TY1B-ER1	Q03612	1755 aa		5.68	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	TY1B-ML1	Q04711	1755 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	TY1B-GR2	Q12269	1755 aa		5.68	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	TY1B-OL	Q12273	1755 aa		5.68	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	TY1B-PL	Q12414	1755 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	TY1B-DR3	Q99231	1755 aa		5.68	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	THI4	P32318	326 aa		5.68	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	AFR1	P33304	620 aa		5.68	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	RFC5	P38251	354 aa		5.68	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	NPP1	P25353	742 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	BRN1	P38170	754 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	GIC1	P38785	314 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	YER158C	P40095	573 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	HFM1	P51979	1187 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	SRT1	Q03175	343 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	FUN30	P31380	1131 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.66	□□□□□ -1.5	not detected
MTD1	YKR080W	LIP5	P32875	414 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	HSP78	P33416	811 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	ERT1	P38140	529 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	TOK1	P40310	691 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	GYP7	P48365	746 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	OSW2	Q12202	724 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	MET5	P47169	1442 aa		5.65	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	APL1	P27351	700 aa		5.65	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	REC104	P33323	182 aa		5.65	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	OMA1	P36163	345 aa		5.65	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	NPP2	P39997	493 aa		5.65	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	5.65	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	ORC3	P54790	616 aa		5.65	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	RSM24	Q03976	319 aa		5.65	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	BRE4	Q07660	1125 aa		5.65	□□□□□ -1.5
MTD1	YKR080W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
MTD1	YKR080W	SPC42	P36094	363 aa		5.64	□□□□□ -1.51
MTD1	YKR080W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	5.64	□□□□□ -1.51
MTD1	YKR080W	ENV11	P53246	860 aa		5.64	□□□□□ -1.51
MTD1	YKR080W	DOS2	P54858	310 aa		5.64	□□□□□ -1.51
MTD1	YKR080W	PAN1	P32521	1480 aa		5.64	□□□□□ -1.51
MTD1	YKR080W	YAP1801	P38856	637 aa		5.63	□□□□□ -1.51
MTD1	YKR080W	GDH3	P39708	457 aa		5.63	□□□□□ -1.51
MTD1	YKR080W	ALG2	P43636	503 aa		5.63	□□□□□ -1.51
MTD1	YKR080W	CTH1	P47976	325 aa		5.63	□□□□□ -1.51
MTD1	YKR080W	SFB2	P53953	876 aa		5.63	□□□□□ -1.51
MTD1	YKR080W	YPR196W	Q06595	470 aa		5.63	□□□□□ -1.51
MTD1	YKR080W	XYL2	Q07993	356 aa		5.63	□□□□□ -1.51
MTD1	YKR080W	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
MTD1	YKR080W	MSH2	P25847	964 aa		5.62	□□□□□ -1.51
MTD1	YKR080W	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
MTD1	YKR080W	INP52	P50942	1183 aa		5.62	□□□□□ -1.51
MTD1	YKR080W	LTE1	P07866	1435 aa		5.61	□□□□□ -1.51
MTD1	YKR080W	RPC82	P32349	654 aa		5.61	□□□□□ -1.51
MTD1	YKR080W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
MTD1	YKR080W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
MTD1	YKR080W	MNN1	P39106	762 aa		5.61	□□□□□ -1.51

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 17.8 ms