RNA–Protein interactions for RNA: YKL111C

YKL111C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKL111C, Length 336 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKL111CYKL111C YER158CP40095 573 aa3.5□□□□□ -1.85
YKL111CYKL111C TOK1P40310 691 aa3.5□□□□□ -1.85
YKL111CYKL111C MND2P40577 368 aa3.5□□□□□ -1.85
YKL111CYKL111C RTA1P53047 317 aa3.5□□□□□ -1.85
YKL111CYKL111C ORC1P54784 914 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
YKL111CYKL111C GCN5Q03330 439 aa3.5□□□□□ -1.85
YKL111CYKL111C RPN4Q03465 531 aa3.5□□□□□ -1.85
YKL111CYKL111C OSW2Q12202 724 aa3.5□□□□□ -1.85
YKL111CYKL111C CAN1P04817 590 aa3.49□□□□□ -1.85
YKL111CYKL111C RPS13P05756 151 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
YKL111CYKL111C MSD1P15179 658 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
YKL111CYKL111C HSP60P19882 572 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
YKL111CYKL111C ARE1P25628 610 aa3.49□□□□□ -1.85
YKL111CYKL111C PPH3P32345 308 aa3.49□□□□□ -1.85
YKL111CYKL111C PET10P36139 283 aa3.49□□□□□ -1.85
YKL111CYKL111C YRO2P38079 344 aa3.49□□□□□ -1.85
YKL111CYKL111C CCC2P38995 1004 aa3.49□□□□□ -1.85
YKL111CYKL111C PRP43P53131 767 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
YKL111CYKL111C RIM8P53179 542 aa3.49□□□□□ -1.85
YKL111CYKL111C YGR125WP53273 1036 aa3.49□□□□□ -1.85
YKL111CYKL111C VPS62P53285 467 aa3.49□□□□□ -1.85
YKL111CYKL111C LCD1Q04377 747 aa3.49□□□□□ -1.85
YKL111CYKL111C ADY3Q07732 790 aa3.49□□□□□ -1.85
YKL111CYKL111C CDC53Q12018 815 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
YKL111CYKL111C ADE8P04161 214 aa3.48□□□□□ -1.85
YKL111CYKL111C CDC20P26309 610 aa3.48□□□□□ -1.85
YKL111CYKL111C PBP2P38151 413 aaKnown RBP RIP-Chip data3.48□□□□□ -1.85not detected
YKL111CYKL111C UBP5P39944 805 aa3.48□□□□□ -1.85
YKL111CYKL111C IRC24P40580 263 aa3.48□□□□□ -1.85
YKL111CYKL111C TPO1Q07824 586 aa3.48□□□□□ -1.85
YKL111CYKL111C HMI1Q12039 706 aa3.48□□□□□ -1.85
YKL111CYKL111C YPR071WQ12346 211 aa3.48□□□□□ -1.85
YKL111CYKL111C OSH2Q12451 1283 aa3.48□□□□□ -1.85
YKL111CYKL111C YTA7P40340 1379 aa3.48□□□□□ -1.85
YKL111CYKL111C PRE10P21242 288 aaKnown RBP RIP-Chip data3.47□□□□□ -1.85not detected
YKL111CYKL111C CDC48P25694 835 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
YKL111CYKL111C RPC82P32349 654 aa3.47□□□□□ -1.85
YKL111CYKL111C DOM34P33309 386 aa3.47□□□□□ -1.85
YKL111CYKL111C ZRG8P40021 1076 aa3.47□□□□□ -1.85
YKL111CYKL111C UBP6P43593 499 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
YKL111CYKL111C CHA4P43634 648 aa3.47□□□□□ -1.85
YKL111CYKL111C GCV2P49095 1034 aa3.47□□□□□ -1.85
YKL111CYKL111C MAL11P53048 616 aa3.47□□□□□ -1.85
YKL111CYKL111C YGR012WP53206 393 aa3.47□□□□□ -1.85
YKL111CYKL111C GPB1Q08886 897 aa3.47□□□□□ -1.85
YKL111CYKL111C CIT2P08679 460 aa3.46□□□□□ -1.86
YKL111CYKL111C ERR1P0CX10 437 aa3.46□□□□□ -1.86
YKL111CYKL111C ERR2P0CX11 437 aa3.46□□□□□ -1.86
YKL111CYKL111C EMC1P25574 760 aa3.46□□□□□ -1.86
YKL111CYKL111C CDC11P32458 415 aa3.46□□□□□ -1.86
YKL111CYKL111C SRP40P32583 406 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
YKL111CYKL111C SRP101P32916 621 aa3.46□□□□□ -1.86
YKL111CYKL111C TOD6P34219 525 aa3.46□□□□□ -1.86
YKL111CYKL111C GGA2P38817 585 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
YKL111CYKL111C MET12P46151 657 aa3.46□□□□□ -1.86
YKL111CYKL111C CCM1P48237 864 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
YKL111CYKL111C GTF1P53260 183 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
YKL111CYKL111C TPO2P53283 614 aa3.46□□□□□ -1.86
YKL111CYKL111C SPE1P08432 466 aa3.45□□□□□ -1.86
YKL111CYKL111C FBP1P09201 348 aa3.45□□□□□ -1.86
YKL111CYKL111C HSF1P10961 833 aa3.45□□□□□ -1.86
YKL111CYKL111C REC104P33323 182 aa3.45□□□□□ -1.86
YKL111CYKL111C YKL091CP33324 310 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
YKL111CYKL111C FLR1P38124 548 aa3.45□□□□□ -1.86
YKL111CYKL111C URM1P40554 99 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
YKL111CYKL111C TAF1P46677 1066 aa3.45□□□□□ -1.86
YKL111CYKL111C TY4A-JP47023 414 aa3.45□□□□□ -1.86
YKL111CYKL111C SPT20P50875 604 aa3.45□□□□□ -1.86
YKL111CYKL111C PBP1P53297 722 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
YKL111CYKL111C YAP6Q03935 383 aa3.45□□□□□ -1.86
YKL111CYKL111C RXT3Q07458 294 aa3.45□□□□□ -1.86
YKL111CYKL111C ACK1Q07622 623 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
YKL111CYKL111C ENV7Q12003 364 aa3.45□□□□□ -1.86
YKL111CYKL111C NOT3P06102 836 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
YKL111CYKL111C HIS5P07172 385 aa3.44□□□□□ -1.86
YKL111CYKL111C ENA1P13587 1091 aa3.44□□□□□ -1.86
YKL111CYKL111C GAL11P19659 1081 aa3.44□□□□□ -1.86
YKL111CYKL111C STE14P32584 239 aa3.44□□□□□ -1.86
YKL111CYKL111C TIM23P32897 222 aa3.44□□□□□ -1.86
YKL111CYKL111C STE13P33894 931 aa3.44□□□□□ -1.86
YKL111CYKL111C LST4P34239 828 aa3.44□□□□□ -1.86
YKL111CYKL111C CHZ1P40019 153 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
YKL111CYKL111C HUL4P40985 892 aa3.44□□□□□ -1.86
YKL111CYKL111C GYP8P43570 497 aa3.44□□□□□ -1.86
YKL111CYKL111C HDA1P53973 706 aa3.44□□□□□ -1.86
YKL111CYKL111C ENA2Q01896 1091 aa3.44□□□□□ -1.86
YKL111CYKL111C YDL124WQ07551 312 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
YKL111CYKL111C WHI4Q07655 649 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
YKL111CYKL111C ENA5Q12691 1091 aa3.44□□□□□ -1.86
YKL111CYKL111C POA1P38218 177 aa3.43□□□□□ -1.86
YKL111CYKL111C NUP82P40368 713 aa3.43□□□□□ -1.86
YKL111CYKL111C RAI1P53063 387 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
YKL111CYKL111C NCS6P53088 359 aa3.43□□□□□ -1.86
YKL111CYKL111C YGR283CP53336 341 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
YKL111CYKL111C SSL1Q04673 461 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
YKL111CYKL111C ESC8Q08119 714 aa3.43□□□□□ -1.86
YKL111CYKL111C NOP12Q08208 459 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
YKL111CYKL111C YOR352WQ08816 343 aa3.43□□□□□ -1.86
YKL111CYKL111C UPC2Q12151 913 aa3.43□□□□□ -1.86
YKL111CYKL111C EMC3P36039 253 aa3.42□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 51.5 ms