RNA–Protein interactions for RNA: YGR247W

CPD1, Transcript of Cyclic nucleotide phosphodiesterase, yeastyeast

Gene CPD1, Length 720 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CPD1YGR247W DPH2P32461 534 aa10.09□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W GCS1P35197 352 aa10.09□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W YTA12P40341 825 aa10.09□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W MAF1P41910 395 aa10.09□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W BIO5P53744 561 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W TRS120Q04183 1289 aa10.09□□□□□ -0.79
CPD1YGR247W ADE4P04046 510 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
CPD1YGR247W RSA4P25382 515 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
CPD1YGR247W HXT5P38695 592 aa10.08□□□□□ -0.8
CPD1YGR247W YDR344CQ05510 147 aa10.08□□□□□ -0.8
CPD1YGR247W PEX1P24004 1043 aa10.07□□□□□ -0.8
CPD1YGR247W PUP3P25451 205 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
CPD1YGR247W ASF1P32447 279 aa10.07□□□□□ -0.8
CPD1YGR247W RPT1P33299 467 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
CPD1YGR247W STT3P39007 718 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
CPD1YGR247W YEL023CP39992 682 aa10.07□□□□□ -0.8
CPD1YGR247W RPN3P40016 523 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
CPD1YGR247W MGA2P40578 1113 aa10.07□□□□□ -0.8
CPD1YGR247W ISM1P48526 1002 aa10.07□□□□□ -0.8
CPD1YGR247W YLH47Q06493 454 aa10.07□□□□□ -0.8
CPD1YGR247W ESC8Q08119 714 aa10.07□□□□□ -0.8
CPD1YGR247W PKH2Q12236 1081 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
CPD1YGR247W SCP160P06105 1222 aaKnown RBP RIP-Chip data10.06□□□□□ -0.8not detected
CPD1YGR247W CBP3P21560 335 aa10.06□□□□□ -0.8
CPD1YGR247W YKL097CP34245 136 aa10.06□□□□□ -0.8
CPD1YGR247W RIM4P38741 713 aa10.06□□□□□ -0.8
CPD1YGR247W MNP1P53163 194 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
CPD1YGR247W PGA2P53903 129 aa10.06□□□□□ -0.8
CPD1YGR247W TIP41Q12199 356 aa10.06□□□□□ -0.8
CPD1YGR247W OSW2Q12202 724 aa10.06□□□□□ -0.8
CPD1YGR247W CDC6P09119 513 aa10.05□□□□□ -0.8
CPD1YGR247W VPS1P21576 704 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
CPD1YGR247W SKG6P32900 734 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
CPD1YGR247W MRX3P38172 270 aa10.05□□□□□ -0.8
CPD1YGR247W ARP1P38696 384 aa10.05□□□□□ -0.8
CPD1YGR247W ULP2P40537 1034 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
CPD1YGR247W ROG3P43602 733 aa10.05□□□□□ -0.8
CPD1YGR247W AVT1P47082 602 aa10.05□□□□□ -0.8
CPD1YGR247W RTT102P53330 157 aa10.05□□□□□ -0.8
CPD1YGR247W YNL146WP53906 100 aa10.05□□□□□ -0.8
CPD1YGR247W NCS2P53923 493 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
CPD1YGR247W YML083CQ04526 418 aa10.05□□□□□ -0.8
CPD1YGR247W FUS2Q05670 677 aa10.05□□□□□ -0.8
CPD1YGR247W IES4Q08561 116 aa10.05□□□□□ -0.8
CPD1YGR247W SMC6Q12749 1114 aa10.05□□□□□ -0.8
CPD1YGR247W CCH1P50077 2039 aa10.05□□□□□ -0.8
CPD1YGR247W COX4P04037 155 aa10.04□□□□□ -0.8
CPD1YGR247W COT1P32798 439 aa10.04□□□□□ -0.8
CPD1YGR247W YGR130CP53278 816 aa10.04□□□□□ -0.8
CPD1YGR247W YLR407WQ06070 228 aa10.04□□□□□ -0.8
CPD1YGR247W SDH5Q08230 162 aa10.04□□□□□ -0.8
CPD1YGR247W HAP2P06774 265 aa10.03□□□□□ -0.8
CPD1YGR247W TOM70P07213 617 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
CPD1YGR247W TRL1P09880 827 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
CPD1YGR247W SIS1P25294 352 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
CPD1YGR247W RAD27P26793 382 aa10.03□□□□□ -0.8
CPD1YGR247W RAD54P32863 898 aa10.03□□□□□ -0.8
CPD1YGR247W HEL1P36113 551 aa10.03□□□□□ -0.8
CPD1YGR247W ECM7Q06200 448 aa10.03□□□□□ -0.8
CPD1YGR247W DNL4Q08387 944 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
CPD1YGR247W ATP1P07251 545 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W SPE1P08432 466 aa10.02□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W HMG2P12684 1045 aa10.02□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W DBP5P20449 482 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W PEX2P32800 271 aa10.02□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W CUL3P53202 744 aa10.02□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W PLP2Q12017 286 aa10.02□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W CAN1P04817 590 aa10.01□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W VPH1P32563 840 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W HMT1P38074 348 aa10.01□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W VID24P38263 362 aa10.01□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W YER186CP40101 306 aa10.01□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W NUT1P53114 1132 aa10.01□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W SDA1P53313 767 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W RCR2Q03446 210 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W PML39Q03760 334 aa10.01□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W HXK1P04806 485 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W FRS2P15625 503 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W VPS35P34110 944 aa10□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W COY1P34237 679 aa10□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W YHL017WP38745 532 aa10□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W BUD6P41697 788 aa10□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W CAF130P53280 1122 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W ALG11P53954 548 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W YDR090CQ03193 310 aa10□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W YOR296WQ08748 1289 aa10□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W TSR3Q12094 313 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W GET3Q12154 354 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W ZPS1Q12512 249 aa10□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W NBL1Q3E7Y6 73 aa10□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W TUF1P02992 437 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W RAM1P22007 431 aa9.99□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W RPC53P25441 422 aa9.99□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W MNR2P35724 969 aa9.99□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W PCM1P38628 557 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W SIP3P38717 1229 aa9.99□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W ERC1P38767 581 aa9.99□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W CBK1P53894 756 aa9.99□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W HSP82P02829 709 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
CPD1YGR247W CIT2P08679 460 aa9.98□□□□□ -0.81
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