RNA–Protein interactions for RNA: YBR187W

GDT1, Transcript of Protein of unknown function involved in calcium homeostasis, yeast

Gene GDT1, Length 843 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GDT1	YBR187W	UTH1	P36135	365 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GDT1	YBR187W	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GDT1	YBR187W	LEO1	P38439	464 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GDT1	YBR187W	RIM4	P38741	713 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GDT1	YBR187W	MED6	P38782	295 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GDT1	YBR187W	UBP12	P39538	1254 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GDT1	YBR187W	SAD1	P43589	448 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GDT1	YBR187W	TMN2	Q04562	672 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GDT1	YBR187W	OPT2	Q06593	877 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GDT1	YBR187W	MNL2	Q12205	849 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GDT1	YBR187W	GPR1	Q12361	961 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GDT1	YBR187W	STE4	P18851	423 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GDT1	YBR187W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GDT1	YBR187W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GDT1	YBR187W	TGL1	P34163	548 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GDT1	YBR187W	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GDT1	YBR187W	OPY1	P38271	328 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GDT1	YBR187W	SAF1	P38352	637 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GDT1	YBR187W	PIB2	P53191	635 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GDT1	YBR187W	SPO1	P53541	631 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GDT1	YBR187W	NAF1	P53919	492 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GDT1	YBR187W	YLL058W	Q12198	575 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GDT1	YBR187W	YLR422W	Q06409	1932 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GDT1	YBR187W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GDT1	YBR187W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GDT1	YBR187W	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GDT1	YBR187W	YNL050C	P53952	270 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GDT1	YBR187W	SPH1	Q06160	661 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GDT1	YBR187W	THI22	Q06490	572 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GDT1	YBR187W	YOL057W	Q08225	711 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GDT1	YBR187W	PRE8	P23639	250 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GDT1	YBR187W	GUT2	P32191	649 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GDT1	YBR187W	PET127	P32606	800 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GDT1	YBR187W	SEC8	P32855	1065 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GDT1	YBR187W	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GDT1	YBR187W	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GDT1	YBR187W	SOL4	P53315	255 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GDT1	YBR187W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GDT1	YBR187W	SPE1	P08432	466 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GDT1	YBR187W	MKS1	P34072	584 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GDT1	YBR187W	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GDT1	YBR187W	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GDT1	YBR187W	YIR014W	P40570	242 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GDT1	YBR187W	AAD14	P42884	376 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GDT1	YBR187W	CLC1	P17891	233 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GDT1	YBR187W	SRM1	P21827	482 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GDT1	YBR187W	SPT5	P27692	1063 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GDT1	YBR187W	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GDT1	YBR187W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GDT1	YBR187W	GCV2	P49095	1034 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GDT1	YBR187W	ROM1	P53046	1155 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GDT1	YBR187W	LSC2	P53312	427 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GDT1	YBR187W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GDT1	YBR187W	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GDT1	YBR187W	YDL176W	Q12027	708 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GDT1	YBR187W	RRI2	Q12348	645 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GDT1	YBR187W	PNS1	Q12412	539 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GDT1	YBR187W	LAA1	P39526	2014 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GDT1	YBR187W	ACO2	P39533	789 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GDT1	YBR187W	SCW11	P53189	542 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GDT1	YBR187W	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GDT1	YBR187W	UBP2	Q01476	1272 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GDT1	YBR187W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	RIP-Chip
GDT1	YBR187W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GDT1	YBR187W	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GDT1	YBR187W	MTC5	Q03897	1148 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GDT1	YBR187W	FRA1	Q07825	749 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GDT1	YBR187W	RAD2	P07276	1031 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GDT1	YBR187W	PTP1	P25044	335 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GDT1	YBR187W	FBP26	P32604	452 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GDT1	YBR187W	YBL036C	P38197	257 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GDT1	YBR187W	NSE5	Q03718	556 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GDT1	YBR187W	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GDT1	YBR187W	APC11	Q12157	165 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GDT1	YBR187W	HMG2	P12684	1045 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	MUK1	Q02866	612 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	YML020W	Q03722	664 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	DFG5	Q05031	458 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	BDS1	Q08347	646 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	HFA1	P32874	2273 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	STE6	P12866	1290 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	YCL042W	P25572	119 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	PEX34	P25584	144 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	CHS3	P29465	1165 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	MSS51	P32335	436 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	CYM1	P32898	989 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	DID4	P36108	232 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	MRPL7	P36519	292 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	YIL092W	P40497	633 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	YJR008W	P47085	338 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	YJR098C	P47139	656 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	ENT3	P47160	408 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	ALT1	P52893	592 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	TFB3	Q03290	321 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	FMP25	Q08023	583 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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