RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627746.2

PPP4C-214, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PPP4C, Length 1,301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-214ENST00000627746 CNBD1Q8NA66 436 aa30.77■■■□□ 2.52
PPP4C-214ENST00000627746 BRIP1Q9BX63 1249 aa30.77■■■□□ 2.52
PPP4C-214ENST00000627746 ZNF652Q9Y2D9 606 aa30.77■■■□□ 2.52
PPP4C-214ENST00000627746 TTLL7Q6ZT98 887 aa30.76■■■□□ 2.52
PPP4C-214ENST00000627746 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP30.76■■■□□ 2.52
PPP4C-214ENST00000627746 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP30.76■■■□□ 2.52
PPP4C-214ENST00000627746 TTLL6Q8N841 843 aa30.75■■■□□ 2.51
PPP4C-214ENST00000627746 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP30.75■■■□□ 2.51
PPP4C-214ENST00000627746 PDE6BP35913 854 aa30.74■■■□□ 2.51
PPP4C-214ENST00000627746 C1QTNF8P60827 252 aa30.74■■■□□ 2.51
PPP4C-214ENST00000627746 KRT24Q2M2I5 525 aa30.74■■■□□ 2.51
PPP4C-214ENST00000627746 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP30.74■■■□□ 2.51
PPP4C-214ENST00000627746 DLEC1Q9Y238 1755 aa30.74■■■□□ 2.51
PPP4C-214ENST00000627746 C9orf131Q5VYM1 1079 aa30.73■■■□□ 2.51
PPP4C-214ENST00000627746 NECTIN2Q92692 538 aa30.73■■■□□ 2.51
PPP4C-214ENST00000627746 BABAM1Q9NWV8 329 aa30.73■■■□□ 2.51
PPP4C-214ENST00000627746 APAF1O14727 1248 aa30.73■■■□□ 2.51
PPP4C-214ENST00000627746 ST5P78524 1137 aa30.73■■■□□ 2.51
PPP4C-214ENST00000627746 CHL1O00533 1208 aa30.72■■■□□ 2.51
PPP4C-214ENST00000627746 ANXA1P04083 346 aa30.72■■■□□ 2.51
PPP4C-214ENST00000627746 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP30.72■■■□□ 2.51
PPP4C-214ENST00000627746 PROSER3Q2NL68 480 aa30.71■■■□□ 2.51
PPP4C-214ENST00000627746 ZBTB3Q9H5J0 574 aa30.71■■■□□ 2.51
PPP4C-214ENST00000627746 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa30.7■■■□□ 2.5
PPP4C-214ENST00000627746 RASSF7Q02833 373 aa30.7■■■□□ 2.5
PPP4C-214ENST00000627746 PDIA6Q15084 440 aa30.7■■■□□ 2.5
PPP4C-214ENST00000627746 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa30.7■■■□□ 2.5
PPP4C-214ENST00000627746 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP30.69■■■□□ 2.5
PPP4C-214ENST00000627746 KIF6Q6ZMV9 814 aa30.69■■■□□ 2.5
PPP4C-214ENST00000627746 RNF181Q9P0P0 153 aa30.68■■■□□ 2.5
PPP4C-214ENST00000627746 ERVV-1B6SEH8 477 aa30.67■■■□□ 2.5
PPP4C-214ENST00000627746 TPTE2Q6XPS3 522 aa30.67■■■□□ 2.5
PPP4C-214ENST00000627746 NUP98P52948 1817 aa30.66■■■□□ 2.5
PPP4C-214ENST00000627746 RGL2O15211 777 aa30.66■■■□□ 2.5
PPP4C-214ENST00000627746 SRGNP10124 158 aa30.66■■■□□ 2.5
PPP4C-214ENST00000627746 GPTP24298 496 aa30.66■■■□□ 2.5
PPP4C-214ENST00000627746 LRP10Q7Z4F1 713 aa30.66■■■□□ 2.5
PPP4C-214ENST00000627746 SBF1O95248 1867 aa30.65■■■□□ 2.5
PPP4C-214ENST00000627746 C21orf2O43822 256 aa30.65■■■□□ 2.5
PPP4C-214ENST00000627746 PRELPP51888 382 aa30.65■■■□□ 2.5
PPP4C-214ENST00000627746 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa30.65■■■□□ 2.5
PPP4C-214ENST00000627746 ERBB4Q15303 1308 aa30.64■■■□□ 2.5
PPP4C-214ENST00000627746 NUTM1Q86Y26 1132 aa30.63■■■□□ 2.49
PPP4C-214ENST00000627746 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
PPP4C-214ENST00000627746 MASTLQ96GX5 879 aa30.62■■■□□ 2.49
PPP4C-214ENST00000627746 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
PPP4C-214ENST00000627746 STYK1Q6J9G0 422 aa30.61■■■□□ 2.49
PPP4C-214ENST00000627746 CFAP44Q96MT7 982 aa30.61■■■□□ 2.49
PPP4C-214ENST00000627746 CACNA1SQ13698 1873 aa30.6■■■□□ 2.49
PPP4C-214ENST00000627746 UBN2Q6ZU65 1347 aa30.6■■■□□ 2.49
PPP4C-214ENST00000627746 SLX4Q8IY92 1834 aa30.6■■■□□ 2.49
PPP4C-214ENST00000627746 NFKBIEO00221 500 aa30.6■■■□□ 2.49
PPP4C-214ENST00000627746 CNKSR1Q969H4 720 aa30.6■■■□□ 2.49
PPP4C-214ENST00000627746 MBIPQ9NS73 344 aa30.6■■■□□ 2.49
PPP4C-214ENST00000627746 KIF3CO14782 793 aa30.59■■■□□ 2.49
PPP4C-214ENST00000627746 SUSD4Q5VX71 490 aa30.59■■■□□ 2.49
PPP4C-214ENST00000627746 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
PPP4C-214ENST00000627746 COPS6Q7L5N1 327 aa30.59■■■□□ 2.49
PPP4C-214ENST00000627746 ANP32CO43423 234 aa30.58■■■□□ 2.49
PPP4C-214ENST00000627746 ERFEQ4G0M1 354 aa30.58■■■□□ 2.49
PPP4C-214ENST00000627746 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
PPP4C-214ENST00000627746 ZNF34Q8IZ26 560 aa30.58■■■□□ 2.49
PPP4C-214ENST00000627746 XAGE3Q8WTP9 111 aa30.58■■■□□ 2.49
PPP4C-214ENST00000627746 NMRK2Q9NPI5 230 aa30.58■■■□□ 2.49
PPP4C-214ENST00000627746 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
PPP4C-214ENST00000627746 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa30.56■■■□□ 2.48
PPP4C-214ENST00000627746 ZNF853P0CG23 659 aa30.56■■■□□ 2.48
PPP4C-214ENST00000627746 LMNB1P20700 586 aa30.56■■■□□ 2.48
PPP4C-214ENST00000627746 CHPF2Q9P2E5 772 aa30.56■■■□□ 2.48
PPP4C-214ENST00000627746 ABCC12Q96J65 1359 aa30.56■■■□□ 2.48
PPP4C-214ENST00000627746 NPR1P16066 1061 aa30.55■■■□□ 2.48
PPP4C-214ENST00000627746 NYXQ9GZU5 481 aa30.55■■■□□ 2.48
PPP4C-214ENST00000627746 MRS2Q9HD23 443 aa30.55■■■□□ 2.48
PPP4C-214ENST00000627746 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP30.55■■■□□ 2.48
PPP4C-214ENST00000627746 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa30.54■■■□□ 2.48
PPP4C-214ENST00000627746 DUSP27Q5VZP5 1158 aa30.54■■■□□ 2.48
PPP4C-214ENST00000627746 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP30.53■■■□□ 2.48
PPP4C-214ENST00000627746 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
PPP4C-214ENST00000627746 OLFM4Q6UX06 510 aa30.52■■■□□ 2.48
PPP4C-214ENST00000627746 ZNF428Q96B54 188 aa30.51■■■□□ 2.48
PPP4C-214ENST00000627746 IFT57Q9NWB7 429 aa30.51■■■□□ 2.48
PPP4C-214ENST00000627746 NTSR2O95665 410 aa30.5■■■□□ 2.47
PPP4C-214ENST00000627746 GNAI1P63096 354 aa30.5■■■□□ 2.47
PPP4C-214ENST00000627746 C7orf43Q8WVR3 580 aa30.5■■■□□ 2.47
PPP4C-214ENST00000627746 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa30.5■■■□□ 2.47
PPP4C-214ENST00000627746 RRAGCQ9HB90 399 aa30.48■■■□□ 2.47
PPP4C-214ENST00000627746 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa30.48■■■□□ 2.47
PPP4C-214ENST00000627746 HOXB7P09629 217 aa30.47■■■□□ 2.47
PPP4C-214ENST00000627746 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
PPP4C-214ENST00000627746 C3orf67Q6ZVT6 689 aa30.47■■■□□ 2.47
PPP4C-214ENST00000627746 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa30.47■■■□□ 2.47
PPP4C-214ENST00000627746 C8orf58Q8NAV2 365 aa30.47■■■□□ 2.47
PPP4C-214ENST00000627746 TAOK3Q9H2K8 898 aa30.47■■■□□ 2.47
PPP4C-214ENST00000627746 CRY2Q49AN0 593 aa30.46■■■□□ 2.47
PPP4C-214ENST00000627746 PARP10Q53GL7 1025 aa30.46■■■□□ 2.47
PPP4C-214ENST00000627746 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
PPP4C-214ENST00000627746 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
PPP4C-214ENST00000627746 KDM2BQ8NHM5 1336 aa30.45■■■□□ 2.47
PPP4C-214ENST00000627746 ALDH1B1P30837 517 aa30.45■■■□□ 2.46
PPP4C-214ENST00000627746 TCIRG1Q13488 830 aa30.45■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.3 ms