RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 GPR162Q16538 588 aa27.38■■□□□ 1.97
SGMS1-210ENST00000619438 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
SGMS1-210ENST00000619438 CFAP44Q96MT7 982 aa27.38■■□□□ 1.97
SGMS1-210ENST00000619438 NBPF26B4DH59 902 aa27.36■■□□□ 1.97
SGMS1-210ENST00000619438 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
SGMS1-210ENST00000619438 TM4SF1P30408 202 aa27.36■■□□□ 1.97
SGMS1-210ENST00000619438 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
SGMS1-210ENST00000619438 NBPF15Q8N660 670 aa27.36■■□□□ 1.97
SGMS1-210ENST00000619438 BICDL1Q6ZP65 573 aa27.36■■□□□ 1.97
SGMS1-210ENST00000619438 BCL2L12Q9HB09 334 aa27.36■■□□□ 1.97
SGMS1-210ENST00000619438 KDM3BQ7LBC6 1761 aa27.36■■□□□ 1.97
SGMS1-210ENST00000619438 NFIXQ14938 502 aa27.34■■□□□ 1.97
SGMS1-210ENST00000619438 MYL6BP14649 208 aa27.33■■□□□ 1.97
SGMS1-210ENST00000619438 GNAI1P63096 354 aa27.33■■□□□ 1.97
SGMS1-210ENST00000619438 DDR1Q08345 913 aa27.33■■□□□ 1.97
SGMS1-210ENST00000619438 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
SGMS1-210ENST00000619438 IFT57Q9NWB7 429 aa27.32■■□□□ 1.96
SGMS1-210ENST00000619438 KIF13BQ9NQT8 1826 aa27.31■■□□□ 1.96
SGMS1-210ENST00000619438 CAMTA2O94983 1202 aa27.31■■□□□ 1.96
SGMS1-210ENST00000619438 NECTIN2Q92692 538 aa27.3■■□□□ 1.96
SGMS1-210ENST00000619438 MBIPQ9NS73 344 aa27.3■■□□□ 1.96
SGMS1-210ENST00000619438 SERPINB2P05120 415 aa27.3■■□□□ 1.96
SGMS1-210ENST00000619438 KRT24Q2M2I5 525 aa27.3■■□□□ 1.96
SGMS1-210ENST00000619438 TBC1D9BQ66K14 1250 aa27.3■■□□□ 1.96
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF652Q9Y2D9 606 aa27.3■■□□□ 1.96
SGMS1-210ENST00000619438 CHD4Q14839 1912 aa27.3■■□□□ 1.96
SGMS1-210ENST00000619438 TGFB2P61812 414 aa27.29■■□□□ 1.96
SGMS1-210ENST00000619438 SETDB2Q96T68 719 aa27.29■■□□□ 1.96
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF853P0CG23 659 aa27.28■■□□□ 1.96
SGMS1-210ENST00000619438 YY1P25490 414 aa27.28■■□□□ 1.96
SGMS1-210ENST00000619438 WWC3Q9ULE0 1092 aa27.28■■□□□ 1.96
SGMS1-210ENST00000619438 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
SGMS1-210ENST00000619438 CLEC4GQ6UXB4 293 aa27.27■■□□□ 1.96
SGMS1-210ENST00000619438 ERBB4Q15303 1308 aa27.27■■□□□ 1.96
SGMS1-210ENST00000619438 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP27.27■■□□□ 1.962e-8■□□□□ 8.8
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SGMS1-210ENST00000619438 NPHP1O15259 732 aa27.26■■□□□ 1.95
SGMS1-210ENST00000619438 KIF6Q6ZMV9 814 aa27.26■■□□□ 1.95
SGMS1-210ENST00000619438 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa27.25■■□□□ 1.95
SGMS1-210ENST00000619438 LAMB4A4D0S4 1761 aa27.25■■□□□ 1.95
SGMS1-210ENST00000619438 CLUAP1Q96AJ1 413 aa27.24■■□□□ 1.95
SGMS1-210ENST00000619438 C10orf71Q711Q0 1435 aa27.24■■□□□ 1.95
SGMS1-210ENST00000619438 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
SGMS1-210ENST00000619438 PDE4AP27815 886 aa27.24■■□□□ 1.95
SGMS1-210ENST00000619438 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa27.24■■□□□ 1.95
SGMS1-210ENST00000619438 BACH2Q9BYV9 841 aa27.24■■□□□ 1.95
SGMS1-210ENST00000619438 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
SGMS1-210ENST00000619438 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
SGMS1-210ENST00000619438 PANK1Q8TE04 598 aa27.23■■□□□ 1.95
SGMS1-210ENST00000619438 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
SGMS1-210ENST00000619438 SCN7AQ01118 1682 aa27.23■■□□□ 1.95
SGMS1-210ENST00000619438 GRIN3BO60391 1043 aa27.22■■□□□ 1.95
SGMS1-210ENST00000619438 ANXA1P04083 346 aa27.22■■□□□ 1.95
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SGMS1-210ENST00000619438 TTLL7Q6ZT98 887 aa27.22■■□□□ 1.95
SGMS1-210ENST00000619438 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
SGMS1-210ENST00000619438 ANP32EQ9BTT0 268 aa27.22■■□□□ 1.95
SGMS1-210ENST00000619438 DPEP1P16444 411 aa27.21■■□□□ 1.95
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SGMS1-210ENST00000619438 PXDNLA1KZ92 1463 aa27.21■■□□□ 1.95
SGMS1-210ENST00000619438 HLFQ16534 295 aa27.21■■□□□ 1.95
SGMS1-210ENST00000619438 ZBTB3Q9H5J0 574 aa27.21■■□□□ 1.95
SGMS1-210ENST00000619438 CARMIL3Q8ND23 1372 aa27.2■■□□□ 1.95
SGMS1-210ENST00000619438 ERVV-1B6SEH8 477 aa27.2■■□□□ 1.94
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF428Q96B54 188 aa27.2■■□□□ 1.94
SGMS1-210ENST00000619438 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa27.2■■□□□ 1.94
SGMS1-210ENST00000619438 RGL2O15211 777 aa27.19■■□□□ 1.94
SGMS1-210ENST00000619438 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
SGMS1-210ENST00000619438 PROSER3Q2NL68 480 aa27.19■■□□□ 1.94
SGMS1-210ENST00000619438 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP27.19■■□□□ 1.94
SGMS1-210ENST00000619438 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa27.18■■□□□ 1.94
SGMS1-210ENST00000619438 BCORQ6W2J9 1755 aa27.18■■□□□ 1.94
SGMS1-210ENST00000619438 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
SGMS1-210ENST00000619438 CNBD1Q8NA66 436 aa27.17■■□□□ 1.94
SGMS1-210ENST00000619438 CHPF2Q9P2E5 772 aa27.17■■□□□ 1.94
SGMS1-210ENST00000619438 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
SGMS1-210ENST00000619438 FAM177BA6PVY3 158 aa27.17■■□□□ 1.94
SGMS1-210ENST00000619438 COPS6Q7L5N1 327 aa27.17■■□□□ 1.94
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC24Q8N4L8 307 aa27.17■■□□□ 1.94
SGMS1-210ENST00000619438 BCS1LQ9Y276 419 aa27.17■■□□□ 1.94
SGMS1-210ENST00000619438 NRXN2Q9P2S2 1712 aa27.16■■□□□ 1.94
SGMS1-210ENST00000619438 RLBP1P12271 317 aa27.16■■□□□ 1.94
SGMS1-210ENST00000619438 CHRNA5P30532 468 aa27.16■■□□□ 1.94
SGMS1-210ENST00000619438 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
SGMS1-210ENST00000619438 C8orf58Q8NAV2 365 aa27.16■■□□□ 1.94
SGMS1-210ENST00000619438 CHMP4AQ9BY43 222 aa27.16■■□□□ 1.94
SGMS1-210ENST00000619438 PIM2Q9P1W9 311 aa27.16■■□□□ 1.94
SGMS1-210ENST00000619438 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
SGMS1-210ENST00000619438 ST5P78524 1137 aa27.15■■□□□ 1.94
SGMS1-210ENST00000619438 ALDH1L2Q3SY69 923 aa27.15■■□□□ 1.94
SGMS1-210ENST00000619438 PRR5LQ6MZQ0 368 aa27.15■■□□□ 1.94
SGMS1-210ENST00000619438 TPTE2Q6XPS3 522 aa27.15■■□□□ 1.94
SGMS1-210ENST00000619438 XAGE3Q8WTP9 111 aa27.15■■□□□ 1.94
SGMS1-210ENST00000619438 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
SGMS1-210ENST00000619438 LRP10Q7Z4F1 713 aa27.14■■□□□ 1.94
SGMS1-210ENST00000619438 BCL2L13Q9BXK5 485 aa27.14■■□□□ 1.94
SGMS1-210ENST00000619438 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.93
SGMS1-210ENST00000619438 SMC4Q9NTJ3 1288 aa27.14■■□□□ 1.93
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