RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 PDIA6Q15084 440 aa8.82□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 TBC1D9BQ66K14 1250 aa8.82□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 TTLL7Q6ZT98 887 aa8.82□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 NLGN2Q8NFZ4 835 aa8.82□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 SERPINB2P05120 415 aa8.81□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 DDR1Q08345 913 aa8.81□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 HLFQ16534 295 aa8.81□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 PROSER3Q2NL68 480 aa8.81□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa8.81□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 TSPYL6Q8N831 410 aa8.81□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 CD2APQ9Y5K6 639 aa8.81□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 NUP98P52948 1817 aa8.81□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 IL16Q14005 1332 aa8.8□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A0G2JLW4 131 aa8.8□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM177BA6PVY3 158 aa8.8□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 POLA2Q14181 598 aa8.8□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 KIF6Q6ZMV9 814 aa8.8□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 COPS6Q7L5N1 327 aa8.8□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC24Q8N4L8 307 aa8.8□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 SETDB2Q96T68 719 aa8.8□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 ZBTB3Q9H5J0 574 aa8.8□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP8.8□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 CHPF2Q9P2E5 772 aa8.8□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 WWC3Q9ULE0 1092 aa8.8□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 HOXB7P09629 217 aa8.79□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 GOLGA2Q08379 1002 aa8.79□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 GPR162Q16538 588 aa8.79□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 CLEC4GQ6UXB4 293 aa8.79□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 XAGE3Q8WTP9 111 aa8.79□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP8.79□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF652Q9Y2D9 606 aa8.79□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 ERBB4Q15303 1308 aa8.79□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa8.79□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 BCORQ6W2J9 1755 aa8.78□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 ERVV-1B6SEH8 477 aa8.78□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 NPHP1O15259 732 aa8.78□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 GPTP24298 496 aa8.78□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC30Q5VVM6 783 aa8.78□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 LRP10Q7Z4F1 713 aa8.78□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 DPEP1P16444 411 aa8.77□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 CHRNA5P30532 468 aa8.77□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 TGFB2P61812 414 aa8.77□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF428Q96B54 188 aa8.77□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 CDCA7LQ96GN5 454 aa8.77□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 MYH16Q9H6N6 1097 aa8.77□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 HYPKQ9NX55 129 aa8.77□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 SCN7AQ01118 1682 aa8.77□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 KIF13BQ9NQT8 1826 aa8.77□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 FANCIQ9NVI1 1328 aa8.77□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 VAMP4O75379 141 aa8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 PRR5LQ6MZQ0 368 aa8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 TPTE2Q6XPS3 522 aa8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 CHMP4AQ9BY43 222 aa8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF521Q96K83 1311 aa8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 CARMIL3Q8ND23 1372 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 NRXN2Q9P2S2 1712 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 H0YIN7 160 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP8.75□□□□□ -1.014e-9■■□□□ 11.5
EFTUD2-211ENST00000588374 KCNA3P22001 575 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 SLFN5Q08AF3 891 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 SUSD4Q5VX71 490 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 RIC3Q7Z5B4 369 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 C2CD5Q86YS7 1000 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF34Q8IZ26 560 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 CNBD1Q8NA66 436 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 PLBD2Q8NHP8 589 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 STK31Q9BXU1 1019 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 E9PSI1 815 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 ST5P78524 1137 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 TCIRG1Q13488 830 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 ERFEQ4G0M1 354 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 G2E3Q7L622 706 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 NUTM1Q86Y26 1132 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP8.74□□□□□ -1.016e-8■□□□□ 9
EFTUD2-211ENST00000588374 BRIP1Q9BX63 1249 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 PIM2Q9P1W9 311 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 BCS1LQ9Y276 419 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 C10orf71Q711Q0 1435 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 HAX1O00165 279 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 RGL2O15211 777 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 PDE6BP35913 854 aa8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms