RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, human

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTDNEP1-209	ENST00000574205	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		42.6	■■■■■ 4.41
CTDNEP1-209	ENST00000574205	RGL2	O15211	777 aa		42.59	■■■■■ 4.41
CTDNEP1-209	ENST00000574205	COPS6	Q7L5N1	327 aa		42.58	■■■■■ 4.41
CTDNEP1-209	ENST00000574205	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		42.58	■■■■■ 4.41
CTDNEP1-209	ENST00000574205	CACNA1F	O60840	1977 aa		42.57	■■■■■ 4.41
CTDNEP1-209	ENST00000574205	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		42.57	■■■■■ 4.41
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		42.56	■■■■■ 4.4
CTDNEP1-209	ENST00000574205	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		42.56	■■■■■ 4.4
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		42.56	■■■■■ 4.4
CTDNEP1-209	ENST00000574205	MMP10	P09238	476 aa		42.56	■■■■■ 4.4
CTDNEP1-209	ENST00000574205	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	42.55	■■■■■ 4.4
CTDNEP1-209	ENST00000574205	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	42.53	■■■■■ 4.4
CTDNEP1-209	ENST00000574205	NUP98	P52948	1817 aa		42.52	■■■■■ 4.4
CTDNEP1-209	ENST00000574205	TM4SF1	P30408	202 aa		42.51	■■■■■ 4.4
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		42.51	■■■■■ 4.4
CTDNEP1-209	ENST00000574205	NFIX	Q14938	502 aa		42.51	■■■■■ 4.39
CTDNEP1-209	ENST00000574205	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	42.51	■■■■■ 4.39
CTDNEP1-209	ENST00000574205	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	42.51	■■■■■ 4.39
CTDNEP1-209	ENST00000574205	SLC4A2	P04920	1241 aa		42.5	■■■■■ 4.39
CTDNEP1-209	ENST00000574205	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	42.5	■■■■■ 4.39
CTDNEP1-209	ENST00000574205	HLF	Q16534	295 aa		42.5	■■■■■ 4.39
CTDNEP1-209	ENST00000574205	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		42.49	■■■■■ 4.39
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ZNF428	Q96B54	188 aa		42.49	■■■■■ 4.39
CTDNEP1-209	ENST00000574205	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		42.48	■■■■■ 4.39
CTDNEP1-209	ENST00000574205	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	42.46	■■■■■ 4.39
CTDNEP1-209	ENST00000574205	DDR1	Q08345	913 aa		42.46	■■■■■ 4.39
CTDNEP1-209	ENST00000574205	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		42.46	■■■■■ 4.39
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		42.46	■■■■■ 4.39
CTDNEP1-209	ENST00000574205	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	42.45	■■■■■ 4.39
CTDNEP1-209	ENST00000574205	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		42.45	■■■■■ 4.39
CTDNEP1-209	ENST00000574205	SETDB2	Q96T68	719 aa		42.44	■■■■■ 4.38
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ATP10D	Q9P241	1426 aa		42.43	■■■■■ 4.38
CTDNEP1-209	ENST00000574205	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		42.42	■■■■■ 4.38
CTDNEP1-209	ENST00000574205	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	42.41	■■■■■ 4.38
CTDNEP1-209	ENST00000574205	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	42.41	■■■■■ 4.38
CTDNEP1-209	ENST00000574205	G2E3	Q7L622	706 aa		42.4	■■■■■ 4.38
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		42.39	■■■■■ 4.38
CTDNEP1-209	ENST00000574205	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	42.39	■■■■■ 4.38
CTDNEP1-209	ENST00000574205	FLII	Q13045	1269 aa		42.38	■■■■■ 4.37
CTDNEP1-209	ENST00000574205	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		42.38	■■■■■ 4.37
CTDNEP1-209	ENST00000574205	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		42.38	■■■■■ 4.37
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		42.38	■■■■■ 4.37
CTDNEP1-209	ENST00000574205	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		42.37	■■■■■ 4.37
CTDNEP1-209	ENST00000574205	SERPINB2	P05120	415 aa		42.36	■■■■■ 4.37
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		42.36	■■■■■ 4.37
CTDNEP1-209	ENST00000574205	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	42.36	■■■■■ 4.37
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		42.35	■■■■■ 4.37
CTDNEP1-209	ENST00000574205	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		42.35	■■■■■ 4.37
CTDNEP1-209	ENST00000574205	TCIRG1	Q13488	830 aa		42.33	■■■■■ 4.37
CTDNEP1-209	ENST00000574205	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	42.33	■■■■■ 4.37
CTDNEP1-209	ENST00000574205	KSR2	Q6VAB6	950 aa		42.32	■■■■■ 4.37
CTDNEP1-209	ENST00000574205	GPT	P24298	496 aa		42.31	■■■■■ 4.36
CTDNEP1-209	ENST00000574205	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	42.31	■■■■■ 4.36
CTDNEP1-209	ENST00000574205	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	42.31	■■■■■ 4.36
CTDNEP1-209	ENST00000574205	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		42.3	■■■■■ 4.36
CTDNEP1-209	ENST00000574205	KLHL34	Q8N239	644 aa		42.3	■■■■■ 4.36
CTDNEP1-209	ENST00000574205	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		42.3	■■■■■ 4.36
CTDNEP1-209	ENST00000574205	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		42.3	■■■■■ 4.36
CTDNEP1-209	ENST00000574205	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		42.3	■■■■■ 4.36
CTDNEP1-209	ENST00000574205	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		42.3	■■■■■ 4.36
CTDNEP1-209	ENST00000574205	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		42.3	■■■■■ 4.36
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ADCY9	O60503	1353 aa		42.29	■■■■■ 4.36
CTDNEP1-209	ENST00000574205	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	42.29	■■■■■ 4.36
CTDNEP1-209	ENST00000574205	PARP10	Q53GL7	1025 aa		42.28	■■■■■ 4.36
CTDNEP1-209	ENST00000574205	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		42.28	■■■■■ 4.36
CTDNEP1-209	ENST00000574205	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		42.28	■■■■■ 4.36
CTDNEP1-209	ENST00000574205	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		42.28	■■■■■ 4.36
CTDNEP1-209	ENST00000574205	CNBD1	Q8NA66	436 aa		42.27	■■■■■ 4.36
CTDNEP1-209	ENST00000574205	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	42.26	■■■■■ 4.36
CTDNEP1-209	ENST00000574205	SYT17	Q9BSW7	474 aa		42.26	■■■■■ 4.36
CTDNEP1-209	ENST00000574205	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	42.25	■■■■■ 4.35
CTDNEP1-209	ENST00000574205	NPHP1	O15259	732 aa		42.25	■■■■■ 4.35
CTDNEP1-209	ENST00000574205	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		42.25	■■■■■ 4.35
CTDNEP1-209	ENST00000574205	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		42.25	■■■■■ 4.35
CTDNEP1-209	ENST00000574205	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	42.24	■■■■■ 4.35
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		42.24	■■■■■ 4.35
CTDNEP1-209	ENST00000574205	NYX	Q9GZU5	481 aa		42.24	■■■■■ 4.35
CTDNEP1-209	ENST00000574205	FAM177B	A6PVY3	158 aa		42.22	■■■■■ 4.35
CTDNEP1-209	ENST00000574205	SUSD4	Q5VX71	490 aa		42.22	■■■■■ 4.35
CTDNEP1-209	ENST00000574205	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		42.22	■■■■■ 4.35
CTDNEP1-209	ENST00000574205	NLRP10	Q86W26	655 aa		42.22	■■■■■ 4.35
CTDNEP1-209	ENST00000574205	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	42.21	■■■■■ 4.35
CTDNEP1-209	ENST00000574205	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	42.21	■■■■■ 4.35
CTDNEP1-209	ENST00000574205	MYD88	Q99836	296 aa		42.21	■■■■■ 4.35
CTDNEP1-209	ENST00000574205	PTPRC	P08575	1304 aa		42.2	■■■■■ 4.35
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		42.2	■■■■■ 4.35
CTDNEP1-209	ENST00000574205	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		42.2	■■■■■ 4.35
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ST5	P78524	1137 aa		42.2	■■■■■ 4.35
CTDNEP1-209	ENST00000574205	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		42.19	■■■■■ 4.34
CTDNEP1-209	ENST00000574205	NTSR2	O95665	410 aa		42.17	■■■■■ 4.34
CTDNEP1-209	ENST00000574205	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	42.17	■■■■■ 4.34
CTDNEP1-209	ENST00000574205	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	42.17	■■■■■ 4.34
CTDNEP1-209	ENST00000574205	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		42.16	■■■■■ 4.34
CTDNEP1-209	ENST00000574205	TGFB2	P61812	414 aa		42.15	■■■■■ 4.34
CTDNEP1-209	ENST00000574205	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		42.15	■■■■■ 4.34
CTDNEP1-209	ENST00000574205	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		42.15	■■■■■ 4.34
CTDNEP1-209	ENST00000574205	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		42.15	■■■■■ 4.34
CTDNEP1-209	ENST00000574205	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		42.15	■■■■■ 4.34
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		42.14	■■■■■ 4.34
CTDNEP1-209	ENST00000574205		F6X3S4	739 aa		42.14	■■■■■ 4.34

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