RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560359.1

GABPB1-AS1-204, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene GABPB1-AS1, Length 709 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa30.82■■■□□ 2.52
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SGIP1Q9BQI5 828 aa30.82■■■□□ 2.52
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RGL2O15211 777 aa30.81■■■□□ 2.52
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 POLD1P28340 1107 aa30.81■■■□□ 2.52
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 G2E3Q7L622 706 aa30.72■■■□□ 2.51
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CARMIL3Q8ND23 1372 aa30.69■■■□□ 2.5
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SETDB2Q96T68 719 aa30.69■■■□□ 2.5
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 BCL2L13Q9BXK5 485 aa30.65■■■□□ 2.5
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa30.63■■■□□ 2.49
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NTSR2O95665 410 aa30.53■■■□□ 2.48
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ST5P78524 1137 aa30.53■■■□□ 2.48
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa30.53■■■□□ 2.48
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 BCAR3O75815 825 aa30.52■■■□□ 2.48
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP30.52■■■□□ 2.48
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP30.52■■■□□ 2.48
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RNF123Q5XPI4 1314 aa30.51■■■□□ 2.48
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SYT17Q9BSW7 474 aa30.51■■■□□ 2.47
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
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